Typing_Method |
GoldenGate
|
454-Contig_ID |
eggplant_rep_c2800
|
454-Contig_seq (unpadded) |
AAATGGATCAAATTCACATGTGGTGGGGTTCATCTCCTATTAATTATACACAGCTATATAATAGTGTATCTATTTTAATTGCTTTTAATTTAATTAAAGGATCTGACTAAGCACCACGAAGGCAAGTGCTAATGTGGAGAGCATATGTTCACATGATTATTGGTATTCCTCTTCATTTGCATATACANTTGACCGTCAGTATGACACATTCAAAGTTAANAATTAAACAAGGNAAGGAAAAANAANNCCAGAGACTAATTGATGTCTCTTTTTCTCGTTTGCACTCCCTTCTTAATGNAAAATCCTATTCCTAAAATAAATTCTTCTACCTAGCAAACTGTTCTGTCTTGTACACATTATCAGACGAATTAAACGTTAATGTTTTCTGGGGTGGTGGCATCGATGATTGAGGATAACAAGCTCTTTTAAGCTCGTTATACCTCTCAAGATCAAANATTCCGAAGCTTCATGAGTCGCTTTTGCTTAGCGACCAGCCGGCTTTGGAAAAATCCTTCGAAGGAAGGCTCTTTCGACGTCTTANAGGAAAAAAGTATAACCAGCCATGCAGTAAAAGGATGTAATATAGAAGCAAATTGGCTCCATGACATCCCATGAGAGTTCCCAAAATGTCAATCTCATTAATGCTGCTGTCTGGATGACAAAGTNAGCCTAGCCCACACCACANATTCTCTGCGCACCAATGACTCTGCTTTATTGTCAATTTCTGTTTTTTCCTCTTCCATTTGGTTGAGCTCTTTCATCATTTCTGGATAATTTGGGTTCCTCATCACTGCCGTTGGTAATAGGCTTTGTAGAGTTTNTCACTACCTGTAAACAAAATAGAGTACCAAACATTTGGGTNAAAACTTGCACTCCACTTGACAATAGTCGTCATTCGAATACTATTCATATATATATATATATATAAATAANTAGTTTTTTCTTTTAAAAAANATATGTATATAGAATAATACTTTTCAAAAAATATGTATATAGAATAATAATTTTCNAAAAAATATGTATTAATTTGGAATAGGAAAAAAGNAATCAAAATTGACATTCTCCTAACCTAATTTNGTTGTNGACAATTAGTGCTACTATCTCCCTAGCTATTCTGTAGCCCCTTAATTTGAATTCTTCTAATAAGAAGAATAAGGCGATTGTCCAATACACCACGTTATGTACCTATTATATGAACATGCTAGAATTGACATATTGGGACTTTTCTAGAACTACGCAAACCAATTTTCACCAAAATTCATTTGCTATTTTCTAAAGAGTTCTCTAACGTCAAGTATAAGAAAAGACTAGTGGCCAATTTGAAAGCTGAATAGGTAGCTACTANTTTCCACAATAATTGGATGTCTTTTCCCTCTTTTCACACCCACCCCCATGNCCAAAAAAAANNAGGATTCACCAACTATTCATCACTTAAAATTTTGGCACACATAAAATCAGGTCTAACTTACGCCTCAAAAACTAACTCAAATCTCATAAGAGTCCACCATCTCGNTTGTGAAACTTTTATCATTTTTCGACACCNAATCNAAACATGTAAAACCGACCATCACCCTCCTNAAAAAAGTTTGATTCTCCTTAATTCTTTATTTTGGGGGTNGAACTATCTTAAAGGGTCTTGAAGAAGGAAATTTTGGGTCTTTGAAAATGNATCCGAACTGGTCCACTCCTTTATAAAAGTCACCATCTCGNTTTTAGAGATCTGGAGAAACTTTGTTTCATTTCCCTGTCTGGAGAAAAANACACGAAAATGCTACTATCAGTTTTCGGGAGAATCCCAATATTTGATTAAACAGAAAATGCTNAAATTTACATCTAANTTTCTATCGAATGTTGCTAATTACCANACTGANTTGTCACATAGTGGTAAATTAATCTTTATGCGTATCTGTCAAAGAANACAGTTACGCAATAGCATAGAGAAAAGATTATTAATTAATAAAAGAAGATTGAAATAAGTGAGNAAAAACCAACCTGATCAGGCCTGAGGAACACAACGTTTCCCAAAACAAGCACGGTGCCAGAATCATCTAGAATCTTCGCAAATTCGGCTCCTAATTCATTATTCGAACTAACCCCAGAGCAGATCTGAAGAAATTCCGGATACGAAATACAATTCTTTTCAATCTGGTTTAGTTTCAATTTCACCATCTCCAATTGTGATATTTTTAGCAGCTTCTTCGCATCTGCCACCGTCAATTTCCCTTCCGGCTCCGATTCCGGTTCCGCTCGCAACTCTTGCGGCGGCAGGAGTCCATCGAGTTTGATCCTACTTCTGCNTTATATCCATTTCTCGCAGTTTCTCGACTAGACTTCCGCCGGTGGGTAGTGACCGGAGCTCCGGAGAGGTCGCCGGAGATGAGTATATAGCTCGACGATGGATGAATCGCCTGAAGATTCCATTATCTCCGGGANTCTGGGGCNGATTTTGTNCGTCAGGTTGAGGAGGGGTCAGTTTTCTGGCGGACATGGATGATGAAGATATACGACAAGCGGAAATGGAAAAACCGGTGGTTTTGTATACATTGGAAAGGCGCTGAATTAGCGATTTCTNTGAACGCCATTGAAAGAAAAAATAAGAAGGCTACAGAAAGAGAGAANAAAATTGATTTGAGAATAATGGGAGATTTCAGCTAGGGATTTGAATTGTTCAAGTTTTTTCAACGATGAAGAAAGGAGTCCTAGGCTGGACATATTTATAGGTCCATTTCTTTGGGACGAAATGACGGCACAGCTGCTTACGTTAATCCAAGTTAAGACCGGATTTAAAATTCTAAATAATTGCGTAGTAACTAGTCAATCTATTTTACTTGTCATATTTATCTTAAAATTTTAAAATAATAAATTATTATTTTNAAAAATTACTTATATTAATAATAATAATAATAAATATTTTNTAATGAAATATCAAGGTATTTTCAGTTTCATGGTAATAATATCCATGTGTGTAACCTTTTGTTTTTATGCATTTTTGTCTTGAGNTTTTATTTTAATAATAACGACAATAAATAAATAAATGGACTATCAAGGTG
|
SNP_position |
1152
|
sequence_for_GGdesign |
TGCTACTATCTCCCTAGCTATTCTGTAGCCCCTTAATTTGAATTCTTCTAATAAGAAGAA[T/C]AAGGCGATTGTCCAATACACCACGTTATGTACCTATTATATGAACATGCTAGAATTGACA
|
GGdesign_Final_Score |
0.863
|
Ilmn_Id |
2800_1152-0_T_R_1967850581
|
allele_1 |
T
|
allele_2 |
C
|