+Marker Data: gg2800_1152

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_02
Marker Type SNP
Map Position 13.137
Annotation
Source Name FKO03-01.3346.C2
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_rep_c2800
454-Contig_seq (unpadded) AAATGGATCAAATTCACATGTGGTGGGGTTCATCTCCTATTAATTATACACAGCTATATAATAGTGTATCTATTTTAATTGCTTTTAATTTAATTAAAGGATCTGACTAAGCACCACGAAGGCAAGTGCTAATGTGGAGAGCATATGTTCACATGATTATTGGTATTCCTCTTCATTTGCATATACANTTGACCGTCAGTATGACACATTCAAAGTTAANAATTAAACAAGGNAAGGAAAAANAANNCCAGAGACTAATTGATGTCTCTTTTTCTCGTTTGCACTCCCTTCTTAATGNAAAATCCTATTCCTAAAATAAATTCTTCTACCTAGCAAACTGTTCTGTCTTGTACACATTATCAGACGAATTAAACGTTAATGTTTTCTGGGGTGGTGGCATCGATGATTGAGGATAACAAGCTCTTTTAAGCTCGTTATACCTCTCAAGATCAAANATTCCGAAGCTTCATGAGTCGCTTTTGCTTAGCGACCAGCCGGCTTTGGAAAAATCCTTCGAAGGAAGGCTCTTTCGACGTCTTANAGGAAAAAAGTATAACCAGCCATGCAGTAAAAGGATGTAATATAGAAGCAAATTGGCTCCATGACATCCCATGAGAGTTCCCAAAATGTCAATCTCATTAATGCTGCTGTCTGGATGACAAAGTNAGCCTAGCCCACACCACANATTCTCTGCGCACCAATGACTCTGCTTTATTGTCAATTTCTGTTTTTTCCTCTTCCATTTGGTTGAGCTCTTTCATCATTTCTGGATAATTTGGGTTCCTCATCACTGCCGTTGGTAATAGGCTTTGTAGAGTTTNTCACTACCTGTAAACAAAATAGAGTACCAAACATTTGGGTNAAAACTTGCACTCCACTTGACAATAGTCGTCATTCGAATACTATTCATATATATATATATATATAAATAANTAGTTTTTTCTTTTAAAAAANATATGTATATAGAATAATACTTTTCAAAAAATATGTATATAGAATAATAATTTTCNAAAAAATATGTATTAATTTGGAATAGGAAAAAAGNAATCAAAATTGACATTCTCCTAACCTAATTTNGTTGTNGACAATTAGTGCTACTATCTCCCTAGCTATTCTGTAGCCCCTTAATTTGAATTCTTCTAATAAGAAGAATAAGGCGATTGTCCAATACACCACGTTATGTACCTATTATATGAACATGCTAGAATTGACATATTGGGACTTTTCTAGAACTACGCAAACCAATTTTCACCAAAATTCATTTGCTATTTTCTAAAGAGTTCTCTAACGTCAAGTATAAGAAAAGACTAGTGGCCAATTTGAAAGCTGAATAGGTAGCTACTANTTTCCACAATAATTGGATGTCTTTTCCCTCTTTTCACACCCACCCCCATGNCCAAAAAAAANNAGGATTCACCAACTATTCATCACTTAAAATTTTGGCACACATAAAATCAGGTCTAACTTACGCCTCAAAAACTAACTCAAATCTCATAAGAGTCCACCATCTCGNTTGTGAAACTTTTATCATTTTTCGACACCNAATCNAAACATGTAAAACCGACCATCACCCTCCTNAAAAAAGTTTGATTCTCCTTAATTCTTTATTTTGGGGGTNGAACTATCTTAAAGGGTCTTGAAGAAGGAAATTTTGGGTCTTTGAAAATGNATCCGAACTGGTCCACTCCTTTATAAAAGTCACCATCTCGNTTTTAGAGATCTGGAGAAACTTTGTTTCATTTCCCTGTCTGGAGAAAAANACACGAAAATGCTACTATCAGTTTTCGGGAGAATCCCAATATTTGATTAAACAGAAAATGCTNAAATTTACATCTAANTTTCTATCGAATGTTGCTAATTACCANACTGANTTGTCACATAGTGGTAAATTAATCTTTATGCGTATCTGTCAAAGAANACAGTTACGCAATAGCATAGAGAAAAGATTATTAATTAATAAAAGAAGATTGAAATAAGTGAGNAAAAACCAACCTGATCAGGCCTGAGGAACACAACGTTTCCCAAAACAAGCACGGTGCCAGAATCATCTAGAATCTTCGCAAATTCGGCTCCTAATTCATTATTCGAACTAACCCCAGAGCAGATCTGAAGAAATTCCGGATACGAAATACAATTCTTTTCAATCTGGTTTAGTTTCAATTTCACCATCTCCAATTGTGATATTTTTAGCAGCTTCTTCGCATCTGCCACCGTCAATTTCCCTTCCGGCTCCGATTCCGGTTCCGCTCGCAACTCTTGCGGCGGCAGGAGTCCATCGAGTTTGATCCTACTTCTGCNTTATATCCATTTCTCGCAGTTTCTCGACTAGACTTCCGCCGGTGGGTAGTGACCGGAGCTCCGGAGAGGTCGCCGGAGATGAGTATATAGCTCGACGATGGATGAATCGCCTGAAGATTCCATTATCTCCGGGANTCTGGGGCNGATTTTGTNCGTCAGGTTGAGGAGGGGTCAGTTTTCTGGCGGACATGGATGATGAAGATATACGACAAGCGGAAATGGAAAAACCGGTGGTTTTGTATACATTGGAAAGGCGCTGAATTAGCGATTTCTNTGAACGCCATTGAAAGAAAAAATAAGAAGGCTACAGAAAGAGAGAANAAAATTGATTTGAGAATAATGGGAGATTTCAGCTAGGGATTTGAATTGTTCAAGTTTTTTCAACGATGAAGAAAGGAGTCCTAGGCTGGACATATTTATAGGTCCATTTCTTTGGGACGAAATGACGGCACAGCTGCTTACGTTAATCCAAGTTAAGACCGGATTTAAAATTCTAAATAATTGCGTAGTAACTAGTCAATCTATTTTACTTGTCATATTTATCTTAAAATTTTAAAATAATAAATTATTATTTTNAAAAATTACTTATATTAATAATAATAATAATAAATATTTTNTAATGAAATATCAAGGTATTTTCAGTTTCATGGTAATAATATCCATGTGTGTAACCTTTTGTTTTTATGCATTTTTGTCTTGAGNTTTTATTTTAATAATAACGACAATAAATAAATAAATGGACTATCAAGGTG
SNP_position 1152
sequence_for_GGdesign TGCTACTATCTCCCTAGCTATTCTGTAGCCCCTTAATTTGAATTCTTCTAATAAGAAGAA[T/C]AAGGCGATTGTCCAATACACCACGTTATGTACCTATTATATGAACATGCTAGAATTGACA
GGdesign_Final_Score 0.863
Ilmn_Id 2800_1152-0_T_R_1967850581
allele_1 T
allele_2 C

Line allele-1 allele-2

Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_02 13.137

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain