+Marker Data: gg2348_2882

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_02
Marker Type SNP
Map Position 7.93
Annotation
Source Name FKO03-01.8457.C2
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_rep_c2348
454-Contig_seq (unpadded) TCTGAACATTTTTAGTATTTATTACTCTCTATATATTCATTTTTACTTGTTTTCTATATTAAATTTGATGAACAATTTGAAAAATTATCATTATTATTTGGTGCTTCTTGATTTTTATATCAAGTTAATAATAGATAATTATTATGGGAGGAAGGAATTGTACTANAATGAAATGAAGAGAGTACATGTGATTGTCAACAGAGTTTCAGTACCCAACCAATAGGAATCAATAAAACAAGAAGTGATTGCGAAAGAATAGAAGGGAAAAGTGAAAAGATTGTGAATAATGCGCATCGAGNTATTGGTGGATTTAAGGGAGGTATATTTTGGTTTTTGAAGGATATTTGTGTCCGAACAGAATTTTTTGTACTTGAATTGCAATACAATCGGNCATCGTACTGTCCGTCGCGTACTATAANATTTGANAACTTCCAAACATAAAATATCTTGCATTTCCCATTTAAGAGCTCGCCATCTCAGGTGGAGTTCTCCGGCGATCGATCGTCCTCTCTTCCNTTTTCTGGTGAGTCNAAATTAAGAAANTCGTTTTTCTTTTTCTTTGATTGAATTAGGAATTTCTCTGTTTCTGTTGGTTTCTTCATCCGATCGATTGNAATTTCGAATATAAGCTGCCTCACTAATTGTTTCAACGTATCGTGCATCTTTCTGGTCGAGGTTCCTAACCTCTTTGCCTAAATTTTGTAGNAAAATTTTCTCTTTTTGGCTCTCTTTATTTGTCAAGTGTTTTGCGTGCTATTTTCAATTTNTGTGATTTTATAACTGAACGTTGTTATGACTTCATTTCGACGTAAATCACTTTTNTCTGTACACAAAAGAAGAGTGATCGATAATTCAAATAATTTACTTTGTTTATTTACGTACTGGCTCAGTGATCTTTGAGAAGTCCGTAGAAAGCATACAAAAGGGNAAAAAAATTATCTACTCTTGTAACTTCCTTTATATATTTCTGTTTCTGTCAGGATGCTGATTTAAGGATATAAATTTGTTAGTTTTTGATTTTTATGTGCNTTGAATGTTAGTACTTTGATGAATTCCTCTAGAACTCTGANTTTGTATTTGTTATACTTAATCCTGTTGCTTTTGATAAACCTTCATGCTTCAATTTGGCAATAGAATGGATATTAGTGGAGAAAAGATGGAAATGAAGCAACAGTTAGAGTGGAATGAAGCTCAGAAGACTCTGATAAGTGTGGACCTTGTTGCTGCAGNCTAAAGAGCAGCTCAAGTTTCTTGCTACTGTTGATAGGAACCGTTNGGCTCTATGAAGGCCGTGGCCTTGATAAAGCCATTCATAGGTAATACAGAATCTCTAAGTGGTTATCTCTTGTTAATTATTTTCCAACTATGAATACTGATTGTTTGGAATCTTTACTTTATAAAAATCATTTTCATTTTCTTCTTATCTGAGGTAATATTACAAGTTAGTCATTTGTTTATGGTATATGATGGTTATATCATTTTAACTTTTTCAGCTGACGTGCTTATCTTATATATTTTNCCCATTTCAAGGATTTGAGATTCTTTATGCTATCTAAGGGTGGCTCACTAGTTTATTAAAACTCCCAATTTCAGGTACTACTCATGTTGGCTACCTCTGTTGGCAAAACATTCTGAGGCCCNCCTACTTTGACGGACCTTNTGGTTGTTCCTNTTGGATTGTGAATGGATTTGGCATTGTCACAGGCTCAACCCTGTACGTGTCTAAATTAATGAAACATTTGTTACATAACATCTGTTACTAAAAGCTATTTATTTCATACTTAAATGTCCTTTCTGACANTTTTTCACAGGTTAGATACAAGACTGATTGTGAGAAATTATATGGGAAAATTCTTGACAACCGTGATGTTATATCTTCTGTGANATGCAAANATCAAAACNAGGACACGGAGGAACTGTGGAAAAACTTGTATACAAATGAACCTTATGATTTGGACTCGGCAAGAGCTCTTTCAGAAGATGTCCATGCNAAAAGCTATACAAACTGAAAGGTGCAGTGATTATGATCTAGTCTCTGCTGTTACACGGCAAAGCCCATTCTTCTACCAGGTGAGCAAGAGGATGCCAAGACTCTTCTCCTTCTAAAGTCCTTTTTTCTTTATATCAAGTGCTTCAAGTATGACTTTCTCTGACTTGGAATTTGATAAANCAGATCTATGCAAGTAGGATATGTTGTTTANTAATCTTATGTTATGTCTTTCTTCTAGGTGTCTAGACCACACATGAACAACGANTCTCTNATCTTGAAGGTNGCTGTGGCTCGATATAAGGGTTTTTTACNATCTGATCCGGAGAAACAAAGAAAGATCGATTAAGAGCTTCACTGTTCCAACTTATGACATAGACCTTATCTGGCACACTCACCAGTTACATCCTGCTTCTTATTGCAAAGACCTTGTTAACATTATGGGTAAGGTGTTAGAACATGATGACACTGACTCGGACCGAACAAAAGGGAAAAAGTTGGATACTGGCTTTTTTCAAACTACAAAGCAGTGGGAAGAAACATATGGTTCTAGATATTGGAGGGCAGGTGCAATGTATAGAGGCAGTTCACCATCTCCTCTTGGAACTTCTTATTACCCCTCCAACCCTGTAAGCAAGAATGCAGATATATTGCATGAGCAATACAAGATAATGCAACATCCTGAGATGGAAGCAGTAGAAGTAATTTTNCTGCATCTTTCTACTTTTCGNCTTTGTCTNTCTCAATATTGTTTACATATTTTGAGATCCAATGTTACTTATATATCTAGCATAATTGCATATAACGAATTCCATTTCCAAACTTATATATGTATGAAGGTAATAAGTGCAAGGATGAGAGATCTAGAGAATATGCTGACAAAACCTAATTATATGTATTTAAAGAGTGTCCTTTTGTCTTCAATCAGTATTCTATAAATGCTAGAGAGCATAGGGGAGCCATATTATTTTACAAGTATACAATTTAAATCTAAATGTAGAAAATTATTACAGCTTTAATCCTACATTGACCATTAAAGACAATCATTATCTGTGTCTGGTCTTGCTATGACAGGTAAGGTATCAATTCAGTTAATTGTATCCTTCATGGCCTATCTTGAACATTGCTGCTCTCTGATATAAAGAACATTAAT
SNP_position 2882
sequence_for_GGdesign GAAGGTAATAAGTGCAAGGATGAGAGATCTAGAGAATATGCTGACAAAACCTAATTATAT[A/G]TATTTAAAGAGTGTCCTTTTGTCTTCAATCAGTATTCTATAAATGCTAGAGAGCATAGGG
GGdesign_Final_Score 0.708
Ilmn_Id 2348_2882-0_B_R_1967850573
allele_1 A
allele_2 G

Line allele-1 allele-2

Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_02 7.93

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain