+Marker Data: gg16629_419

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_02
Marker Type SNP
Map Position 63.715
Annotation
Source Name SMFL17A24W
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_c16629
454-Contig_seq (unpadded) TGGGGTGCTGCAGGAGGATGGGCCGTATTTGGNAGTATTATCATGCATGTATGTGATCTTCCTTTTCAACCTCNTTTTTTCACGTTGAAATGTCAGAGTGAGTTCCGTTGGATCTTATGCAGTTTTACATTACATGTTTTGCTGCAGCATAACTGGTTATCTTGNCTTATGAAGTTGTTTGAAATTTATATTTTTAATAGTGTTTCATATATTTAGATGCTGCTCTTGGTCATCTTGTGTAGTGTCTTATAATTATGACATACTCTATAATTATGACATACTGTNATGGNAACAGAGTATTAGTTGCCTCAACACTATTCTGCTGTGGAGGGTTCATTTACAAGACACGAGTGCAGAATCAGGTAGGTTTATTATTCGTGCTTTTTGCTATGAACTATGTTTTCTCTCTCTTACTCTAGCTCTGTTTTCAATTGAATAATTCTTTTGAAACATTTAGTAATTCATTAAATCTCATTTTTACAGCGTGGGCTTGATGCATTGCCTGGAATAACACTTTTATCCGCATTTTTGGAAACTGTAAGTCCACCTACTCTGGAGTTTTAACTTCTTTGGGATGGTGTGGAGTGCTTTGTGTGAGTTATCAATGCACTTCTTGTAGGTGACCCAAAAAAGTGAAATATGTGGAGGCTACACCACAAGGGATAGAGANGGGGGAGAGTCAGAGCTTAATGTGTGAGTAGTGCTAGGGGTATGGTTGTTCAGGTTAAGGGTGTATGGATGTAGTAGAGATGCTAAGGGAAAATGTTATTTTGAGCATGCTGTGAAAATCATGGGAGCTGAATTGGTTTAATGTGCTGATTTGATTTTCTTCGCACATTATAACACTGCACTGTTGGAACTNGAAAAATAGGTAAGCGGGCTAGGCCATGGCTATTNCACGACCAGAAGATTTCAACAATCCTTTTNGCAAATCAAACTTCATGGGAGCGTCAACCTACTTCTACTCAAGCAACACGAAGAACTACTGAAGTTAGATACGGATCAATCTGAGTCCTGTCTGTTTCTGGATGGAAGAGTCTTTCCCACGTCCCAGGCCTAGTGTTCCATGTTAGATATGNTGCACAAGACAGGTCTCTCTCCGTGGAAGCAACTGATATTTGGTGCTCTGCTTCTTGGTAAACAGCATTGCTTTTACCCNTTCTCATTCTCGTGGCAATAGAGATTGAAGAACCATGAAATTTTNTCGNAAATCTCTGATAGAGCAGCAATTTTGGTATTTGATTCCCACCCGTGAAGCATAAATTATAATCTAACATATTGGAAATGNCTGGCCGTTATATAGCTACTTGCTACAGCTTTTTTATTTTAAGTTGNAGAACAAATTCCTCTCTCTGTACGTATAGCTCAGGAACTTAAAATGNCTCACACAAATTATTAGAAATATTGTGAAGTTGAAATTTAATGATTACTTTGAACTTGAATTTTAATGTGATTAATTGGTACTTGATACTCTATCATTGACAATGATGTTTCGAANTCCAAGAGCCTNAACACGAGNAATTAGATTCCTGTTACACTACTTAAAGTCAATCGTCTGCTTCGTGTTTTNTAAGNCAAAAACTTACATCCAAGTTGCCTGTACTGCTT
SNP_position 419
sequence_for_GGdesign CAGGTAGGTTTATTATTCGTGCTTTTTGCTATGAACTATGTTTTCTCTCTCTTACTCTAG[C/G]TCTGTTTTCAATTGAATAATTCTTTTGAAACATTTAGTAATTCATTAAATCTCATTTTTA
GGdesign_Final_Score 0.653
Ilmn_Id 16629_419-0_T_R_1951734825
allele_1 C
allele_2 G

Line allele-1 allele-2

Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_02 63.715

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain