| Typing_Method |
GoldenGate
|
| 454-Contig_ID |
eggplant_rep_c1480
|
| 454-Contig_seq (unpadded) |
ATAGTGATCAACATTATAAATCACGCTTAAACTCCTCCTTCAANNNNGNNNNNNNNNNNNNGNTGTTCATAATTATTCAGGTCCGGCTTTGATTAATAATAAAATAAAATAAATTTTATCAAATCGTAATTATATCTATGTCAATTTGTCAAACAACACTATTCATTTTTAAATTAAATCAAATNCGACAATNATANACAAAAAATANATTAAACAGATAAAAAATNCAGAGTTGTTCTTTTTTCTTTTCCCGCCTTATTTCAACTGAAGATTTTCTTCAAGGGCCCTCCTTCCTTCAAACTTCAACATATGAAGCAATAAATCACTCCAAGTATCAATAGGACCAGGCAAACACCAATGTACACAATCATTATACAAAACCACATTAGCATTTGGCCAATGTCCATATCTACTAGGATGACCATCTGGTCTCAACAACATTGCTNTGTGTTATATCCAATAATCNTAAACCTTTTGCCTTTTTNTCCTCCCTTCCTCAGCTGCAACCTTAAATTCTTCAACTTGTGTCCTATNAAAAANTCCAAACTTATACCATCCAAACTTGTCTCATTGCTTCTAAATGGACCTTTTCTCACACAATTTCCACCTTTATTCCATTCACCACCTTCAAAATGAGAAGGTGCAATTGTCCTAACAAANAGTAATGCCTTTAAAATTTTCTAAATTATTTATGGCTTTTAGTGTTGTTGTAAGTGCTTTTTGATAGCCATAATTTACTGGGAGATCAGTAACATTTGGTAGTCCACAGTAACGGCACCCAATTATTNTGATTTTTTTCATAGTAGACACTGCACCTTGTGAACCAATGGGCAGAATTGAGGATCAAATAATTGAATTGTTGAATTTGGGTAGTCCATTTTGGATCAGGTTGGTCAAGATAAACATTNAAAAAGTCCTGTGTGGCTAGGACCATCAGGGTCTGATTCTTTAACTCTCACTNAAAAATGGTGACCAATATGCTGCTAGTGTGAAATTATAGGTTGTGTATTNTCCACCTTTNTGAAATTTTGATCTGCGTCGTAAGAAATATCAACTGGATATTCCACCTGTAAATTAAACAAAGTGAAAAAAAGAAAAGAAAATGAATTAGTGATGATTTTTTAACTAGTTAATTTTNCANTTATTTTTTTNGNNGTTGTTGTTAAAAGGGGAATTNTTATAAATACNATATGCTTGAAACTTAATATGGTAAAATAGTTATATTTTACATAATTACACGGCAAAACCTTGGCTATGTGACTTGGAGAGAAGGAGAGAGATGAGTGAGATCAAGAGAAGGAGGAGAGAGACGAATTATATATGTATA
|
| SNP_position |
1084
|
| sequence_for_GGdesign |
AATTTTGATCTGCGTCGTAAGAAATATCAACTGGATANTCCACCTGTAAATTAAACAAAG[T/C]GAAAAAAAGAAAAGAAAATGAATTAGTGATGATTTTTTAACTAGTTAATTTT-CA-TTAT
|
| GGdesign_Final_Score |
0.627
|
| Ilmn_Id |
1480_1084-0_T_R_1967850583
|
| allele_1 |
T
|
| allele_2 |
C
|
