+Marker Data: SOL8552

Crop tomato
Population EXPEN_NIVTS_2010
Linkage Group T_11
Marker Type SNP
Map Position 32.8
Annotation
Source Name LeGI_TC208438
Source Type LeGI_v12
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd GGTGGTTATGGTGATGCAAGTCAG
STS_primer_rev GCATGTGCACGTAATTCTTCAAGC
amplicon_seq TGAGTTTAGTCTTGATTCTAAAGCTACAATTGGTGTTGAATTCCAGACAAGAACACTTGTTATTCAGCATAAGTCTGTTAAAGCTCAGATCTGGGATACTGCTGGCCAAGAAAGGTAAATGGGGTTTTGTTTTTTTTTGCTAAAGATTGAACCTTTTTTTAGTTTTGATTGTTTTGATGTAAGTGTTGTTAAAGTTTACAACTTTTTGATGTTGGAAATGATTGAGGAAATGGGTGTTTAAAGAAGAAAGTTGGGATGGTTTTTGCTTAAAAAAATTTGATCTTTTTAGTTTTCTTGTTTTGCTGTAAGTATTGTTGAAGTTTACAACTTTTTGATGTTGGAAATGAATTGAGGAGATGGGTGATGAAAGAAAAAAAGTTGTGATGGTTCTTTGCTAAAAAAAGTTGAACCTTTTTAGTTTTGTTGCAAGTGTTGTTAAAGTTTACAACTTTTTGATGATTAGAGATGTATGAGAAGATGGGTGTTAAAGAAAAGAAGTTGTTTTGATCTACAAATATTAGTGTCATATAAAGTGCAAGAAAGGGAATACATTTCTTTTTCACTTGTAATGGTTCTTTTTAGTTCTCTAGTTTTGAAGCATTGTTAAAGTCACAACTTTTGATCTGCAGAAATTAGTGCATTAAATTGAGAAGNNTAATGAATTNNNNNNNNGTAGTTGTATAATGCTGTTTTCTTCACTTTGATCTGCCTTTTCTTGTTCTTTTGCTTTGTGTTTGAAGCTGCTGATATCATATAAGATATTTAGTGATGTGTTTTGCATATTAGCAAAACTGTGTAGTGAACTATGTATTTGCTGTGAATTTTCGTTGAATCATCCGAGGAAAAGCTTGATATTGGTGTATTCGTAAGTTTGAAGTCATATACATGTTGCTCAGAGATTCAGAATTGTTTATCTTACTGTAGGACTGCATGAATTTTCCCCTCCATACTAAAGGATTTACACCACTATGAGTTTCGATATTCACCATCGTTGTCGCTTTCAACCAAACAATGAAACAGTCTTGTATTAGAGGAGAAATTAGTGATGTCTATCACTGTTACATTACTTAAGCTGAAATAGAGGTTCCAAGCAGTTCCTGTTAAATATTTTTGTCTTTCGATAAACGAGTGCATTGGAGCACGGTTTTGAACTTGATTTGGCAAGTTTGCACTTAAATACCTAACTTTTTGCTATCGTTGGGTCTGAACCGATGATGTGCTCTAACCAACACGGGCAGCAATTCTTTGCTCCTTGGTTTGCCTAAGACATTCCAAAAATCCCATTTAGATCCGAGTCTTAACAGCTTATATGTCACTCAATCATTGGTTTGGTTTGTTGTCATGAACAGATATAGAGCTGTCACGAG
SNP_position 726
allele_1 G
allele_2 C
ASP_primer_S GCGGGCTGATATCAGCAGCTTCAAACACAAAGG
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCTGATATCAGCAGCTTCAAACACAAAGC
Common_primer AATGCTGTTTTCTTCACTTTGATCTGC
enzyme Native Taq
dye SYBR Green

Line allele-1 allele-2
LA716 (S.pennellii) C
LA925 G

Population Linkage Group Position
EXPEN_NIVTS_2010 T_11 32.8

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain