+Marker Data: SOL7204

Crop tomato
Population EXPEN_NIVTS_2010
Linkage Group T_08
Marker Type SNP
Map Position 47.1
Annotation
Source Name LeGI_TC201148
Source Type LeGI_v12
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd GGGGCTTTTGTTTAGGGAGAGGAT
STS_primer_rev AGCTTCAATTGGGGACATGTAACG
amplicon_seq CCGTCAGTTGTAGCATTGATGACTTCTTCGCTGATGCTATTATTAGTCAGTTGTTGTTGTTGGATGCTCTGGATTCCACTAAAGATATTAGGCTCTTTATTAATTGCCCTGGTGGCTCACTCAGGTATTTCTAATTGTTAACATAGAATTAGAATTTATATCTGAATTTTGAAGCTTAGCTTTAACTGGATTTGTGACGCATCTGTCCTACAAGGAGAATTATTGAGTACCCGGTGAGCTCAGTGACTCATGTAGTCGAGCCCAGTTAGTTTGGGATTCAGGTGTACTGTTGCAGTAGTCTATGTTGCTCGGACTCTCCAAAAAGGGTGTCGCACCCTCTAAAAATGCACTACTTTTGAAGGATTTGTCGTGCACCCGTGAACATTTTGAAGAGTTTGAGCGACATTGGTAGTAGTAGTAATTGTTGTTCGGAAAGTTGTTAACTTTAGGGTAGCGTGTGGTTGTTTTGAAGGTTCAAGCTACGTTTTAGTTTTTCTTTTGTCTTAATTGAATATGTTGCTGAAATTTGTCTTATGATGTGAAGTTTATGTAGCACTTCACATAATGTCGGGTAGTTTAGAGATCAGACTGATGAAACAGTTCTGTTGCTAGAATGATCATTAGGAGGAAAGACATATGTCTACGTCATAATTTGATGTAGTTGGATATTTCATACCGTTAGTAAGATACGAACTCTGATGTTGAATATGCGGACCATGTGTNNGCTGTGTAAGACAAGTAGCAGGAACGTATGGTGATTAGCTATTATTTGATAGGTAAATGTGGTGGTAAGTTATTTTCCTTCCGTAAAAACAGCAAGACCAGTCTTGAGATGATACAAGAACTCTGACTTTCGTATAATGTGTAGATTTCGAGTGATCATGCAGCATGTTTAATACAAGTTGCAGAAATATGCAGTGATAAGTTATTTATTTATTTTTTCTTTATTTTACTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCGAGCTATTGCATAGGAGTGGGGGTTTTTACCCTGTGCGCACCCAAAGGGTAGCGGCTGCGGGTTTCCCTTGTCATCAAAATAAATTATATTGTTTATATGATCTACTCTTTGGTGTCTATGAAAGTTTTAGTTGAGACTGTTGAGCAGAACATGCATTATGATTCCTTTTCAATTGCATTTATTTTAGCAGTGTCAGTTTTTGAGTNNNGATCCATGGTATATAAAGGTCACTGTACACTATTTCCCTTCTGTTTCTTTGATTTTGTCAAGAAACTGACGATCTAGTGCTTCTCTTTTTTGTTCCGTTTGCACTTATCTTTAGCACATGATTGTAATGGTCTCTATGCTTTTCCCTTCCCCCAGTAACCTCTTTGATTTGCTCATTTGAGTTGATAACTGAGTGTTCTGTAACTGCATGGTAACATTTGGTTTTCCACTCACTGTACATTATAAGGATTTCGGGGTCAGGTCCAACTTTGATCTATCCATTCTGAAGGCTTGAGTGAACATGCGAGGCCCATACATCAAAATTTAGTTTTTCAATTCGCAAAAATTTCAGTTTTGTCAGCATTCACATGATTATCTTAGTTTCTTCACACATTCATGTCAATTTGTTAATGAAAGAATGTTGAATCTTTTGTAGAAATACTTTTACCTTTTCTTCCTTTTGATGTACTTCTTCCTGTTTACCAGCGCAACAATGGCTATCTTCGACGTTGTGCAGTTGGTGAGGGCTGATGTATCCACAGTTGCACTTGGCATTTCAGCTTCCACAGCTTCAATAATCCTTGCCGGTGGCACCAAAGGAAAACGCTACGCAATGCCTAATACTCGAATTATGATACATCAACCACTTGGAGGTGCCAGTGGTCAAGCAATAGATGTAGAAATTCAAGCCCGAGAAATAATGCATAACAAGGACAATGTTATCAAAATCTTTTCCAATTCCACTGGACGATCATAGAACAAGTCAGA
SNP_position 246
allele_1 A
allele_2 G
ASP_primer_S GCGGGCTTATTGAGTACCCGGTGAGCTCAGTGA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCTTATTGAGTACCCGGTGAGCTCAGGGG
Common_primer ATCCCAAACTAACTGGGCTCGACTACA
enzyme Native Taq
dye SYBR Green
Line allele-1 allele-2
LA716 (S.pennellii) G
LA925 A
Population Linkage Group Position
EXPEN_NIVTS_2010 T_08 47.1
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain