| Typing_Method |
Tm-Shift
|
| Marker_Class |
SOL
|
| STS_primer_fwd |
CTGCCGTATGATGCTGATGTATCC
|
| STS_primer_rev |
GCATGCGCTCTTCCATCTCCT
|
| amplicon_seq |
TTGATCTTTGGTGAAAATTTTAGCGGATGCTTGGTCCATATAGTTAAAGAAGTAAAATAACAAAGAGGAATGAATTTTAAGATTGTGCTTTTGGTAATGAGAATTCTATTCTGTGCGTAGTATAATATTTACTTACTTTGTTAGGATCAGAGAATAACCAACTACCATATTGACTTAGTTTAATTACAATTAAAAGTGAGAATAAATATTAACTTGACTGTAAATAAGTGATAAAATGTGTGTATGAAAGACGTGTCTTGCATGCATTGGTTGGTGTAAACACCAGTGCGGGTAAGTTTTTTTATTTTGTTGCTCAAGGGTGATGCAAATCAATCAAAATCACAATGTTGAGCCTTTTATGTAAATAGTAAGATTTAATGATATTAGAATGATCGGAATTGAAGAAGATAAGAACGGAATAATTAGCACAGTGAACATGTTGTTGTTGATGCTTCAAAATAGCCAATTCCCGAGTCATTGTTACTCATGGAGAATTGTTGGGTTTGTCTCTGTTTAAGCTGCTCTTCTCTGGTTCTTCCTTCTCCACTTATAGTCTGAACCTATAGGAATCACTAGATTATAGCGATTAACCTTGCTTCATATCATGGACTGTCAAGCAAGTAAATTAAATTGAAAATCGTCTACACATTTCGAGGACTTTCACATAAAGCAAAGTGTCAGAGTGGTTTAATCCTTATGAAAGTTTAATGGAGAAGCTTATGTTGGAAGGTAAGTTTATCTTGAGCTTTTGATATCAGCATCATCAGCCCACTTAAATGCAAAACTTATTTTGAACTTTTAGTTGCAAATTTTAGAAGTTATTGATATCACAGATTGTGGATAAAAAAGGGGTAAGTGGGTGAGTGAGGAAGCAAAATAAGGTCTTTTGGTTATTAGTCCATTGCTTATGTTATTTGCTATGTATCGGATTACAACAAGAATATGCTCAATGTAATCCCATAAGTGGAATCTGGGAAGGTTAGTGTATACACAGCCTTACCCTTACATTCCGAAGGTAGAGAAGTTGTTTTTGATAGACCTTGACTCAAGTAAATCATATCGAAATCAGTAAGAAAAGGAAATGCGTTAGTGAAGAAGCCATGTAGAAAATAATGGAGAAAAGAAACAAATAATATGATAACTAAAANGAAGGAAACAACAGGTACTAGTAGAATTGAAGAATAAGATAGTAGGAGAGTAATAATAATAN
|
| SNP_position |
841
|
| allele_1 |
A
|
| allele_2 |
G
|
| ASP_primer_S |
GCGGGCGAAGTTATTGATATCACAGATTGTGGA
|
| ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCGAAGTTATTGATATCACAGATTGTTGG
|
| Common_primer |
TTTTGCTTCCTCACTCACCCACTTACC
|
| enzyme |
Native Taq
|
| dye |
SYBR Green
|