+Marker Data: SOL8460

Crop tomato
Population EXPEN_NIVTS_2010
Linkage Group T_02
Marker Type SNP
Map Position 34.0
Annotation
Source Name LeGI_TC208359
Source Type LeGI_v12
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd CTGCCGTATGATGCTGATGTATCC
STS_primer_rev GCATGCGCTCTTCCATCTCCT
amplicon_seq TTGATCTTTGGTGAAAATTTTAGCGGATGCTTGGTCCATATAGTTAAAGAAGTAAAATAACAAAGAGGAATGAATTTTAAGATTGTGCTTTTGGTAATGAGAATTCTATTCTGTGCGTAGTATAATATTTACTTACTTTGTTAGGATCAGAGAATAACCAACTACCATATTGACTTAGTTTAATTACAATTAAAAGTGAGAATAAATATTAACTTGACTGTAAATAAGTGATAAAATGTGTGTATGAAAGACGTGTCTTGCATGCATTGGTTGGTGTAAACACCAGTGCGGGTAAGTTTTTTTATTTTGTTGCTCAAGGGTGATGCAAATCAATCAAAATCACAATGTTGAGCCTTTTATGTAAATAGTAAGATTTAATGATATTAGAATGATCGGAATTGAAGAAGATAAGAACGGAATAATTAGCACAGTGAACATGTTGTTGTTGATGCTTCAAAATAGCCAATTCCCGAGTCATTGTTACTCATGGAGAATTGTTGGGTTTGTCTCTGTTTAAGCTGCTCTTCTCTGGTTCTTCCTTCTCCACTTATAGTCTGAACCTATAGGAATCACTAGATTATAGCGATTAACCTTGCTTCATATCATGGACTGTCAAGCAAGTAAATTAAATTGAAAATCGTCTACACATTTCGAGGACTTTCACATAAAGCAAAGTGTCAGAGTGGTTTAATCCTTATGAAAGTTTAATGGAGAAGCTTATGTTGGAAGGTAAGTTTATCTTGAGCTTTTGATATCAGCATCATCAGCCCACTTAAATGCAAAACTTATTTTGAACTTTTAGTTGCAAATTTTAGAAGTTATTGATATCACAGATTGTGGATAAAAAAGGGGTAAGTGGGTGAGTGAGGAAGCAAAATAAGGTCTTTTGGTTATTAGTCCATTGCTTATGTTATTTGCTATGTATCGGATTACAACAAGAATATGCTCAATGTAATCCCATAAGTGGAATCTGGGAAGGTTAGTGTATACACAGCCTTACCCTTACATTCCGAAGGTAGAGAAGTTGTTTTTGATAGACCTTGACTCAAGTAAATCATATCGAAATCAGTAAGAAAAGGAAATGCGTTAGTGAAGAAGCCATGTAGAAAATAATGGAGAAAAGAAACAAATAATATGATAACTAAAANGAAGGAAACAACAGGTACTAGTAGAATTGAAGAATAAGATAGTAGGAGAGTAATAATAATAN
SNP_position 841
allele_1 A
allele_2 G
ASP_primer_S GCGGGCGAAGTTATTGATATCACAGATTGTGGA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCGAAGTTATTGATATCACAGATTGTTGG
Common_primer TTTTGCTTCCTCACTCACCCACTTACC
enzyme Native Taq
dye SYBR Green

Line allele-1 allele-2
LA716 (S.pennellii) G
LA925 A

Population Linkage Group Position
EXPEN_NIVTS_2010 T_02 34.0

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain