+Marker Data: SOL7154

Crop tomato
Population EXPEN_NIVTS_2010
Linkage Group T_02
Marker Type SNP
Map Position 14.3
Annotation
Source Name LeGI_TC208431
Source Type LeGI_v12
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd CCGAAGGATGTTGATTTGGAACTT
STS_primer_rev ATACCAGTGCTCCCAGTAAAAACG
amplicon_seq NAAATCAGTGTGGTGTATGGAAAAAAATGGAATAAGGTATTGTGGCTGGAGGAGTCTTGATTATTCAAAGACGAGACATGAGATGTGGATATGACATCATGAATTTTGGAAAAGGAGTAGATGACCACTATGTGTTATCATTAGAAGCTAATATATTCTNTTTTTTTTCCAAGAGAAGGTGAATTAATGGTCAAACAAATTGTTCACTATTAGTGGTAGACGTTTCTAATGACACATTGAATTAGAGGGAAATCACTATATAATATAGAACCAAAAGCGAGGTCCTTCAAATTATGTTACTCTCAAGGAGAGGTTGGTGTAATATTGTAATATATCATGTGTCTTTTTCTTTTTTATTTTATCCTTTCCCTATTATTTGATAGATCTTTTATAGTGATGCAATAATTTGCTTATATTTATCTTTAATCAGTATAAGCTGCTGATACTTACTATTTTATGGTATACTTTTGGTTTATTGTTCTTTCATGTTATGTTATGTAGACACAGTGTGGTGATGTGGAGGTTGAAAAGAAAATTGAAGAGAAGATTACCCTATTCATTGATAGAGTCGAGAAGCACCCTAACAGGAAAAATCAGGTTAGCCAGTGGTTGCAGTTTGTTTCTGTTGGTGATGATCACTGTTTTGGCCAATGGCCATTCACTTTCCTACTTTATAGTCCTGTTCAGTGTTTTACATATTCTACTAGCCATTTCCTTTTCTTGTGATGACGGTAACCTTGTATTCACACCAAAAAACTCATCAAGAAAAACTGATGGTGGGATTTACAACCCCTGGGTGCATCATGATAAACAAAAACCAAAAAATACTTTGCAGTTCTCCTATAATGTCCACTAGACTTTCTGCCTCTCCCGCCATGTCCTATTTACACCAAAAATATAGCGAAGTCAGACTCTTCATCTTGATCTTCTGAATGCTGCTAGCTTGCCCGTCACGGGATCTTCCGTTCCTTTCCTTCAAAAGTGTTTATAAGATGCAAGCTGGAATGCGTTTCCACCATCCTCTTTTGATCTTCTCCTTCTGCCCATTCCTTTGCTTTGTTTCAGCATGTCTAAAGAAGTTTTGGGCATTACCCAGCTAACTCCAGGTATACATTAAGAACATGTCCCACAGATTTACAACTGTTTTGCAATGTTCAAATAAGTGGTTGTTAACCTCTGCCTCCTTTTCACACATGTAACACCTTGAGTAAACCTGTATACTACTTCTCTGTAACACTTCATGAGTTAGGAATGCCTATCACCAACCATGAGAAACATGACACCTTATGAGGGATTTTAATCTTCCAGATTAGCTTCCATGGCCACACCATTACCATTGTCTGATTAGAGTTCATATTCCAGTAACAGGATTTCACAGTGAAGCCCCCTTTGTTGTGTAGCTTCCATATTGGACTATCAGGTCCCACTGAAACACTTGGGAATGAATTCAACATCTTCAACAGTCCTGCTACTCTACTAATCTCCCAATCGTTTAGACTATAGCCATTTCTTTTTCTTCAATATGCTCTCTGGTCATAAGAATATCTTGTGATTTATGGCGGGTTCTTATTCCGTACTGTTTGGTTCTTCTATTGTATGTTGCATTTTTTCTCAGGATATTGTTGCCTGTAACCTTTTGACTAGTGATATAAGTATCTTGTGGAATTCTAATCACTAGTGAAATCAGTATTGGTCTAAATATCTAAATGAACTTTCTGTTGTAACCTCAACATACATATTTGTGTAACT
SNP_position 1009
allele_1 G
allele_2 A
ASP_primer_S GCGGGCTGTTTATAAGATGCAAGCTGGAATGCA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCTGTTTATAAGATGCAAGCTGGAATTCG
Common_primer GGGCAGAAGGAGAAGATCAAAAGAGGA
enzyme Native Taq
dye SYBR Green

Line allele-1 allele-2
LA716 (S.pennellii) A
LA925 G

Population Linkage Group Position
EXPEN_NIVTS_2010 T_02 14.3

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain