Typing_Method |
GoldenGate
|
454-Contig_ID |
eggplant_rep_c12733
|
454-Contig_seq (unpadded) |
TTGTAAAAATCTCCTTTTATATTAAAACCAGTTTATAGCAGCATGATATACATGGGATATATATATANTAATTTTTTTAATGAACTTCGATAATTTNAAATTGAAAGGNACATAACCATCAAAAAACNACAAAAANGTAAANATATAACTTTGTNGAAGCTTCTGCCGCAGAGCNAAAGTATCTTATTCTCNTGAGGAATTCTGGACAGNCTAAAAGTTAATTTATTTAATCGCCTTGTAAAAANATTATGGTAATAAAGATGATATATATATATANTTTTTTTTTGGNATATATACACACTAACCGTTGAACCTTATATACATAATATTGCTTCTAGTCAGTAGTGACAGAGATGACTCAAAATTGCTTTATGTTTTAAGTTGGAATACCAAATATATATACGACATTTCTTTGTATTTCTTTTCTTTTTTACTTAATTACCTTATTAAAATNTCTTAACCCCGCCCCTGATGAGTTATGTCATGTTAATTTTGTGAAATCGAGATATCCAGCTTAAAANATTCTTTCTTNCTTGCTTTTGTAAANTTATTGTAGTTCTTTTATTGGCCTTTNTAATAACCNTTTTGANTTTGGTACTTNTATTCANTGAGATATATTTCTAAAATTTATATATGTNCATAAAAAGATACTAAATTCATGAGCTTGACTTCGCCTCTGCTTGCTTATGTCATGAACTAATTTTAGGNCCAGCAACGTTATTGATCTTANTAGCTTCTGTTTTAACCTTNTGAGTTCAAAATGACAAAAACGTTNATTTCATTGAAANAGGCACAGAATACNTTGTCTCAAGTTCAGCCTCTCCCCTATTTGGGCCTTGGCCCAAATCACTTAAAAAGGCTTCGAGCATTTTGGGCCNAGATGGGAGTTGATTACTTTTCTNTTTTGGACTTTCCACAGTTAAANACAAAATATAGCCCAAAAAAGNACCAGNATCAAACCATTCNATCTTATTTGGATTATTTGTTAATTGAACTAGGACACATATGATCTGGATTTCATATTTATACCACCTTTTGGACACAACGTTACAA
|
SNP_position |
496
|
sequence_for_GGdesign |
AATTACCTTATTAAAAT-TCTTAACCCCGCCNCTGATGAGTTATGTCATGTTAATTTTGT[T/G]AAATCGAGATATCCAGCTTAAAA-ATTCTTTCTT-CTTGCTTTTGTAAA-TTATTGTAGT
|
GGdesign_Final_Score |
0.701
|
Ilmn_Id |
12733_496-0_B_F_1967852769
|
allele_1 |
T
|
allele_2 |
G
|