+Marker Data: gg12298_902

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_01
Marker Type SNP
Map Position 115.415
Annotation
Source Name FKO03-01.10739.C1
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_c12298
454-Contig_seq (unpadded) AGGTCTCCATGCTGTCAGAGAGCATGCGTGCAATTTGTGGTTTGGGTAATGCCCTATTCGAGATTTGCTGTTGATGCACTAGGTGTAATTACTATTATACTTGTTTCAATTTTGGTACTGGCTGGGTTGTGTTGCATCTTGTACTTGATCTACTTTCACACAAAGATTCGCGGGCAAGGTTACAGTCAACTTGGCTATTTTCATGGTCCTTGGATCATCAGGATTACATTTATATTGTTTGCAATCTGGTGGGGATTTGGAGAGGTTGTTCGNGCTAAACTTGATCAGAGGCGACAGAAGATTGTTGAGTGCTCTCAGTTTCAGATGGCAGGAAACTGTTTGCAAGTGTTACATTGTTTCGAGCTTAGGTTTTGCAGAACCTTGCCTGTATCTAACCGTTGTGTTTCTTCTTCGGGCGTCCTTGCAGAAGTCGGGAACTTTAAGTCAGAAATGGAATGGCAAAACAATCGGATACATACTTCTCTTTTGCCTCCCGGTTTTTGCTCTACAGCTCATGCTTATTTTGGCTNGGACCGGAATATAGGAAGAACCACATGAAACACTTGCCACATTATTTCACTACTCCAGTTGCGCTGTATGAAAATGATGTTGCCCTGTGCACTTACCCTTTGTTGAGTACTTTCTGCCTTGGTCTTTTTGCCATCCTGCTAACTTCATATTTGTTCTGGGTTGGTGGAAGAATCCTGCATTTGGTTATCAATAGGAGTCTTCAAAAGAGAGTATACATGCTAGTGGTATCAATTTCAGTTTTCTTTCCTATAAGGATTCTATTGCTTGGTTTAACTGTTAGAACTCAGCCAGAACATTTTCCTTTTCAAGCTCTTGCANTTTCTGGGTTTTGTTTCCTTCTTTTTTTGTATTGGGATGGGCGTGTTCATACTTGTTATCATGCCCATGCGGGATTGTTTAGCACTGAAGAAGAGCTCAGAGAGGGATATAGAGGCTAGGAGAAGGTTAAGTGATGAACAAAATGATACTGTTTCTCTAATTGCTAACCAAAGCACCCTTGGAGGAAGTATGGTGAGCAGTCCTGGGAGAAATTCAGCTGCCTCAACAAAGAGAGGATCGATCTCCTTCCGAACGGACAAGGATGCAACCTCAGGGGTGGCCTTTGTGGAACTAAGTGTATTCTCTCCTAGTCAGCACTCAACACCTCCTGGCTCACCTCAACTTCTTGGCTGGCCTATGCTTCCACCCTCACAAGCTCAAGGTCCCTTATAGTTTTCTTGGGCTGTATCTTTCTTGTATTCTNCCTATTACTTTCATGATGGTGGATGACTAAAAGGTCACTTTTTNTGGGTTTTAAATTGNTTTATGTTCNATTATGCNTGAGTGATTTNGATGTTTGAAAATACATTTTTAATTAATAACTAGGATTGCAAACAAGATTGAGAGGAGNAAATCTAACAAAATGGTGCTTGTATAAAGTGTTCTTTTATTTGTGCGTGNTGCTNCCCCAGAAGCTGAATGTCAACCGATAGTTTGTAGCTTGCATATCANTACACCTATGGTGAATGTTCATCNATATCAACCAAAATTNTGCTCCAGAAAAAATTNAAGGTGTGATGGCTCTTGCTTCAGGACATACTAAAACCATTACAAATCCACCTTTCCAAGATTCTAAGTTATTCTTTAAAATGAAATGTTTGGTAGGGTATTTGACAAGAAATGATTACAAAAAGTTAGTGGAAGTAGAAGAAAGATTGTTTTCATATGGTACTTTGGTGATCTTGAAAGAGGTTGAGGAAATAATATTGCAAGTGATTAGGAAAATAATTTCCTCTCATGCATCTTTCTTTTCTTTGGATGATGGTAAGTAAAC
SNP_position 902
sequence_for_GGdesign CTNGCA-NTTCTGGGTTTTGTTTCCTTCTTTTTTTGTATTGGGATGGGCGTGTTCATACT[T/C]GTTNTCATGCCCANGCGGGATTGTTTAGCACTGAAGAAGAGCTCAGAGAGGGATATAGAG
GGdesign_Final_Score 0.639
Ilmn_Id 12298_902-0_B_F_1951734590
allele_1 T
allele_2 C
Line allele-1 allele-2
Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_01 115.415
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain