+Marker Data: gg2565_495

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_01
Marker Type SNP
Map Position 42.55
Annotation
Source Name FKO03-01.3792.C3
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_rep_c2565
454-Contig_seq (unpadded) AATTTTGGGCAGTCCTGACAAACCTCNAAAAATGGCATGTTTACTCTGCCTCGGCTGGACATATTCAGACTAAGAACCCTGTCTACACTCTTGAGATGTGCATGACTAATTTGGATAGGGAGAAGGCTTCTGTCTTTTACAAGACCGAATCAAGCTCAGCAGCTCAAATGACTATTGGATCTGGCATAAGGAAGATCCTCCCCGACTCTGATATATGCAATTTCGAGTTTGATCCATGTGGTTATTCCATGAATTCTATTGAAGGAGCTGCGCTTTCTACTATTCATGTTNACACCGNGAAGAAGGTTTTAGTTATGCTAGCTTTGAAGCAGNTTGGGTATGATTTAAACTCCTCCAGTCTTGGGTCGCTGGTTAAGAGGGTGCTGACATGTTTCCAGCCTGATGAGTTCTGTATTGCNTTTGCATGCTGATGGTGTTGCTTGTGAGCTACTGGAGCATATTTGCTCTTTNTGATGTTAAGGGCTACTCCCTCGCTGTCTGGAGCCCAGAAGAACTTGGTAAAGGTGGTTCTATTGTCTATCAGAAGTTCATTAGGAGTACCTCCTGTGGGTCTCCGAAATCCGTTCTGGAGGACTGCTGNAAAAGAGGAAAGAAGAAAAGGAGTTGTGTTTGAGGGTCTCGTTTAGTTCAATTACCAATGTTGTTTGCAGACATGTATTATGGTGNTTCAGTTGTGTTGCTTCTTCAAATAAATAGTGCGGTTTATGTCCTTAAAACTAGTTATGAAAATTGTGAAGTTAGTTTGGCTTTTTGGTGTTCCACCTGNAAGCCCTATTTCTTGCATNATTGTGGATTATTACCGCATTTGGTTGTTATCAGATTGTTATTAGTGTGTTTCTTGTCCACCCAGTTAAGATGTGATTTTATGTTTCATTAGTTGGCATTTTTCTTCCTGGATTTGCTGTATAGAAGAGGCTGATATAATGTTATGATGAAAATTATGTGTATACCAATAACTCTTGCAACTATTTAAGCAAGTCATACATTTTATACTAGTTCATACAACAATGATAGACCTACTAAAATCCACGGGTAGAGTGCGCATGCAGACCAGTTCATAGGACACTCAATTATTTAGTATGGATGTTAACATTATAATATTGCATAGAATGTTACTCCAANACACACAAACATGTATTAACAAAACACACTGAACAACAAGTGAGAGCTAGCAATTTGTGTTCCATCAGGCACCAGTGATTGGTTTACCTGAAGCATCCACCATTTCAATATTGTAAAAGGACAGTAAACTGGATAGCCCAAATATTCCCACTGCCACTGCTACTGAATACACCGCCAGCTTATGACAAAACGATGCTATCTTTGGCCGNATTTTCCTTCATGGATTCCGACGCCATCGAACCGGAGAAGGCAAACATCAGAGACAACANCAAATGCTTNGGAAAAAAACAGGCTTTCTTGTGAATATCACAGTTGGTACTAAATTCCCATCTATTGTCTCCAATGGAAGCTGAAAAATTGCTGTAGCAGTCAGAAATGCAATTCTGTATAATGCATCTTGAGTGCTTGTTGTGCCTGTGGNGAGATGTATTATCATCAGTTGTTACAGTCATCCTATTGAAAGTGTGTTGAGAAGTTTTTGTTGGGAATTTGATGTACTATTATCACTAGGAATTTTGTTGATGGAATACTCTTGAAGTCTTATTTATATAGTCGGAAATCAAGAACGCGTGAGTGGGAAAAAGTGTAAAATGGTGCAAGGACTGAGAAAAGAGGAGAGCGTTTCTTGGCACTTTCGCTGTCCCTATCNATAATAAAAGAGACTTTGNAAAAAAATGCCAGGAAATTTCCACGAAATGATTCCATTTTGAAATTACTAGATACTCCCTCCACCCACTACTATTGGTCAATAGGGATGGCAGGGGCNAGATGCGGAACGGGTTGAGCTCAACTCGCNAAATTTTTTGNAATCGCTCCATTTCGCATGATGATTTTTNTCNATTTTCAACTCGTCCTATCTCGTCCCATATAGACTCACCCTGCTTAAATTTAAANATTCTTTTATTTTTNTAATTGAATTTGANTTTTTTTCCTGCTAATTCACGTCTTAACAACTAATTAACTATTTTCAGTTGACATTTTANTAATTANTTTTTAATCATTAATTAAAAGNNNNNNNNTTAATATTTTAACAACTAACAATTACCAGACATGTTT
SNP_position 495
sequence_for_GGdesign GTTGCTTGTGAGCTACTGGAGCATATTTGCTCTTT-TGATGTTAAGGGCTACTCCCTCGC[T/C]GTCTGGAGCCCAGAAGAACTTGGTAAAGGTGGTTCTATTGTCTATCAGAAGTTCATTAGG
GGdesign_Final_Score 0.841
Ilmn_Id 2565_495-0_T_R_1951734433
allele_1 T
allele_2 C

Line allele-1 allele-2

Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_01 42.55

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain