+Marker Data: gg1529_1307

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_01
Marker Type SNP
Map Position 20.806
Annotation
Source Name FKO03-01.40.C17
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_rep_c1529
454-Contig_seq (unpadded) CGTTCTTTGAAATTAAGCTCTCCTTTTTATTTGTCTACTTAGTATTTCGTTAAGCTTTTGATTGTTNGGAATTAATAATATTGAAATTATTTGTATCATGATTAAAGTAATATAACTTTATATCACACTCGATATGAGATGACAAGTTTGAGAAAACTTAGGGATAAATATCAAAATGATGAAGATNGCCCTTACTCCTTTGAAANAGTCAAGGTAATATTNGGAAATAAAANTTTTGTCCTAGTTTATCTNTGTAAGTTAAGATACATTCATATCATTATGCATTGACTCTCGTATACCAAATTCCCTCACATANACAATAAAATTTNNTATCACATGNATATAATNAAAATTTAAGNAAACTATCAAAACAAATATTTTANTTAAAAGTAACAATATTATACGATACAATATATAATAANTCATTCAAAGAAAAAGAANACTTACAATTAAAAGTTGACAACAACATTAACCGTATCAACTAACTCCCAAAAAACAAANACAGAACAATTCTGTTTCTTGATCGAGTTTAGATGGTCTTATTTCATGACAAATAAAACACAACAACAAACGATATGACATGGATTAATTCATAGTATTTATTTTNCTCCCTTCAGTTGAGTCATCCATTNTATGTTTNTCACTTTTNTGAGAGTTATTTAGACACAGTGCTTGGTGCATAAGCAACGACGACGGAATCCGCGACAGACGCCACCAGTAAAGCCCTCTCTGTGGCAAATATTAGCACAGTTACTGCTGCTAAAGCACAACCCNCTTGAATCTGCCACTTGGCGACTCGCAAATCCTTGCCTCCGCNCACCATATCTGCATATCAACATATAATATCAGAAGCAAATTCAAAATTCAATTAAGTTTTATGAGTTCAAAGACTGTCATCTTTTTANTACACTTACAAATAATTTAAGACTTCTCTCTTAATCATGTGATTCTATAGTCACATAGCTGTTATGATCAGTAACATANTTTTGGATACAAGTTTTNAAAAATATTCTTTCTTTAANTTTCATGTCTCATCACTCACTATCACATNAAAGTGAGATAAATAAAACACACACATATATAGAATAGAGAAATAATAAGTTCAATTAAACTCGTTGAATTCAGCATAAATTTAACATTGAAGATCAAAAGAGAGTAGTAAAATGCTTATGGTACATGTAACAACTTATGAATATACATGATTTTTGTTACACACATCACATAAGTGACATATGTATAAATAAAGAATTAAGGTACACCCTTAGAGAAATTGTGAATAAAAGAAAAGAAATTAAATTAATTACCAGTAGCAAAAACCAGCATCATCATAAGGAACATAGTTGCAACAATTTTGGAAAAACCAGCCATTATATATTTAATTGAAATCCTCTTTTATTATAATTTCCCTTTCTTCTATGTGATGAAGAGTGAAGAGGCCACTACTAAATATATAGGCAACAAGAATTTTGAATCTATGGGGTGTATTACTTTGACTAATCTACAAAGNAAAAATAAACACACAATATCTTTAATAAATAATGACCACATTATCTTTGCAAAAATGAATTTTTATTAATTTTNTAATATAAACTNTTTGGNAGATTTATTGGTTAATTTTTCATTNNNCTGCAAAAATGAATTTACATTAATCATGACGTGTGTTATTGTGGTTGAAAGTTCAAACATNAGATGGACGAAATCACNTTTGTAATTCTTCTCTAGGAAGATGATGCATGTGGAAAATTTNCTCTTTAATTTGTAAACCATGTAATATGT
SNP_position 1307
sequence_for_GGdesign ATTAAGGTACACCCTTAGAGAAATTGTGAATAAAAGAAAAGAANTTAAATTAATTACCAG[T/C]AGCAAAAACCAGCATCATCATAAGGAACATAGTTGCAACANTTTTGGAAAAACCAGCCAT
GGdesign_Final_Score 0.611
Ilmn_Id 1529_1307-0_T_R_1967852756
allele_1 T
allele_2 C
Line allele-1 allele-2
Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_01 20.806
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain