Typing_Method |
Tm-Shift
|
Marker_Class |
SOL
|
STS_primer_fwd |
CGACAGTACGACGTAAGGGTTGTG
|
STS_primer_rev |
TGTCCACTAATCTCCCAAACAGCA
|
amplicon_seq |
NNNTNNNTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTGCCCTCTGAAGGTGGTAGTCCTTCCGACCTCCTCTTCCTTGCCGGCGGCGGTTCTTTCATCTCCATTTTCTGCTAGATATAGTTATACTTACCGTACATCCCTAGATTATTCCGTACAGCTTTTTCTTCCAATTATATTTTAAGCAAATTAAGGTTACTCTACCTAGTAGTCTAAAGATGATGCTTAAGATTAAGAGGGTTCCTACGCTTGTCTCTAATTTCCAAAAGGATGAGGTGGATGAAATTGGTGCTCGTGGTGCTGGCTGTGGCCGGAATTGCCTCAGGAACTGCTGCCTTCCAGGTATTTTATAACCCCTTTTCCTAATTGTTTAAAAAATTAATGTTCCAAGTGTTTGTTCAATTAGTCTAAGGAGACTGAAGTTCTTTGTAATTGAGCTTTGGGGGTTGAACCTTTAGTTGATTTTGCTGAATATGCTCTTGTTTGAATTGTTGAAGGTTCAAAGCTACCGCTGTATTGTTTCAAAAATTTGAGCTACGGCAAGTCTGTTGCCGATGAAACAAAGGAACCTCCGGTTGACTTCCTGGAATCCCTTCTTCTTGGAGAAGTAAGTGCGAAGCTTCTTTATTTGATTGCTACTCCTTGCACAACTTTTCTTGTTATTCGGTTACTATTTTGTTATTTTAAATTGCCAAATTTTAGATATTTTGATTTGATCACTCACCTTTTGGTCAATTTTGATGTGCAGTGGGAGGATCGTCAGCAGAAAGGTCTCTTTCGCTATGATGTCACCGCTTGCGAAACCAAGGTATTTTTTTTCCTTCACTCATTTGTCTTTTGGTTACTGTAATTGATAAGGTCTTTTAGTTGATGCCTACACGTTTTTCTTTAGTTATTACCAGTTAGATAGACTTGGTTTAGAAATTCTGGCTTGACATCTATATATGGGGGACTATTAGAAGTTATAGTCCCTCCGGCCATGTTTGACTTGGCATCTCTCTTCCGAAGCANTAAATAAAGTGNTAATTTNACTATNATGACTNCTTAATTATTGAGTCATCTAAATGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANNNNNNACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTTNCGAGTGATAAGNTGCTGCAGCTTTNGATGAAGCAAGTNCAACTTCACTAAGNTNGGACAGGAAGAGTNGCTCTNCCAGTTTGAAGCAAGTGAGGAAGATGAAGTNCAGCTCTATCCGGNATGCGCCCATTGATCTGAGAAATCTCCAAATGTCGTGGCCATCAATGTATGTTCTTAATTAGTTTTGCACATATTCTGGAACGTTTTTTGGTAAGTAGAAACAGTGATTAATGAGTATATTGGTTCTAAATGCAACAGGTCAGTCCCATTGAGTATGGGCATGTGCTTTTGATCCCTAAGGTCCTTGAGTGCCTTCCCCAGAGGATCGACAGAGACAGCTTCTTGCTTGCACTGCACATGGCTGCCGAAGCAGCAAATCCATACTTCCGATTGGGTTACAACAGCTTGGGTGCATTTGCTACCATCAACCATCTTCACTTCCAGGTAGACTCTAAAACACTTCCCATAATCGACATGGTTTTGGGATCATCAGTTTTATTTGTTTGCTTTAGTGACTGCTGAGAGCTTCATAACGAAGTAGGAATTCAATTTCATTGTTGTTGCTCTCTTCAGGCTTATTTCTTGGCTGTGCAATTCCCCATTGAGAAGGCCCCAACTCAGAAGATAACCGTCACTGATGCTGGAGTTAACATATCGAAGATGCTGAATTACCCAGTTCGAGGTCTGGTCTTTGAGGGTGGAAATACTTTGGAGGATTTGGCCAATGTTGTCTCAGATTCTTGCATTTGCCTGCAAGAGAACAACATCCCTTACAATGTCCTAATCTCCGACTCAGGAAAAAGGATATTCCTTCTTCCACAGGTCTAACTCTTGCAACCACATCTTACATTTACTACTTTGGGATTCTTTAATTAGTTAACAGTTCCAAATGGCTGTATGTACATTTTCTCTGTTGCTTTTAGAGATTTATCGATAACCATTGCAACTTATTCGTATATGTGTATTGGAACAGTGCTATGCAGAGAAACAAGCTCTTGGAGAAGTCAGCCCTGAACTCCTCGNN
|
SNP_position |
2054
|
allele_1 |
T
|
allele_2 |
G
|
ASP_primer_S |
GCGGGCTCGATAAATCTCTAAAAGCAACAGAGA
|
ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCTCGATAAATCTCTAAAAGCAACAGCGC
|
Common_primer |
AGTTAACAGTTCCAAATGGCTGTATGT
|
enzyme |
Stoffel frag.
|
dye |
EvaGreen
|