Typing_Method |
Tm-Shift
|
Marker_Class |
SOL
|
STS_primer_fwd |
CAGATGCATTCTGGTGCTTTGAAC
|
STS_primer_rev |
CGCATCCAAATTCCCAGTTATCTC
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amplicon_seq |
ACGTAATGGTTGCCCTTGTTGTTTTCATTCATGCTTGTTACAGACCTAAAAAATACATAAATAAGTTAACAAACAAATGTGTTTCTTCTTTAACATCTCAAGGTTTTATACGAGGTAATCACATAATTCATAAATTTAAGTTTCAGCGCTACCCATTATAAAATAAGAATTTTCACTTGCTTGATCGTGACAAAAATAGTGAAATCCTAAGTTGCGGGGACTCTTCACTTGCAATGCCCACCCGTGTCGGATTCTCTGAAATACACTACTTTTGGTGAATCCAACATGCACCCGCTGCCACTTTCGAAGAATCCGAGCAACATAGGCGAAATCCACATGAGATGACATGTTGCCGGCCTAAAAGAAATAAGCGTGCCCCATATTTGGCAACTTAAGATTTTAGATGAGTGATTTGTTCCTTATTGGTGGTGTAAGGGTTTCCAAAGAGGTTAATAGATTCTTGGGCTATCCCTCCCATAGGTTTTGGGCTGGATGCTCAGTTCTTTCAAATGGCATTAGATCCAAAGGTCGGTGAGTTCGTTTGTGCCACCTGCTTCCTCTCTTCAACTTCTACCATTCTGGCTTCTCTCTAAACTAATCCCATGAAGCTGCTCTGGGTTTCTCTCTCTATTTCAATTCAAATCTATTGAGCATTTAATTAACATGGATCCAGATCCACTATTAGCCTGTTGTGTCTAATGTCTCCCTCTACTCCAGGCCCTTTCCTGTTGAGTCTCCTCCCTTCAGCTTCAA
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SNP_position |
200
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allele_1 |
T
|
allele_2 |
C
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ASP_primer_S |
GCGGGCAAGAGTCCCCGCAACTTAGGATTTCA
|
ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCAAGAGTCCCCGCAACTTAGGATTTCG
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Common_primer |
TTTCACTTGCTTGATCGTGACAAAAA
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enzyme |
Native Taq
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dye |
SYBR Green I
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