+Marker Data: SOL4001

Crop eggplant
Population LWF2_2022
Linkage Group E_12
Marker Type SNP
Map Position 72.9
Annotation
Source Name LS502F05F
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd GGTATCTCAGCTTCGGCTCTTCCT
STS_primer_rev TCTTGTAATAACGAGCAAGGCGGT
amplicon_seq TAATTGCCGTTTGGACATGAATTTGGTTATATTTGAAAAAAAAATAAGTATCTGAAATTAAGTTGATTTGAAAATTGAATTTGTGTTTGGAAATCTATCTGGAATGTTGATGTTTTATGAGTTTAAAAAGTTTACATGAAAAACAGATTTTTGTGGGAAAAAACAGAAACTTTGTATATCCAACAGTTGCTTACACTTTGGTATGATTGTTACTTATTCAATATATGGTGCATTTTATTGTTTTGCAACTTGTGTCATGTCATATTGATGAGTGTAATGCATGATAGGCTGTAGTATNTTTTTTTGGTTGTTACTTAATGCCACACATGAGCAATTTGAAGGTCAAACCTATGAGATAAGTAGGGTAAGTGGTGGAGTTATTATAAAATATATCATAAAAGATAATAAATAAAGGTAAAATGATCACAATGCCATTACACCAAATAAGTAGTTATGTACAATGGATTTAACGATACAATACAATAAAACTTAAGCTACAATCAAAACAAAAATGTATTTTAAACTAATAATACAATACAATAGGTAACAACCATCCAAACAATTTGTATGTCTTCATATAGGATCAGAACAAATGTTATGATCAATATATGAATGTTTGTGTTTCTGTAATTCTAGGTTGAGGACAATATCTGCAAGTTTGCAAAAAAAGGATTGACCCCTTCACAAATTGGTGTGATTCTTCGTGATTCTCATGGAATTGCTCAAGTCAAGAGTGTCACTGGGAGCAAGATTTTGCGTATCCTCAAAGCTCATGGTATTTTCTTTTATTCTTCTTTTCCATATCATCAATGATGCAAGAAATTCAATTGCAGTTAGATTTAGGTAAAATTTGGTTTAATGCATTGGTAGAAGGAAATGTGCCTCAATAGAGTGGAATAAATTGATTAGTTTTGGAATTAATAAGCAGTTGAGTGATTTAACATATGAATTTTTTGGGACAATTGGATAGGACTTGCTCCTGAGATCCCAGAGGATCTTTACCACCTTATAAAGNNN
SNP_position 489
allele_1 C
allele_2 T
ASP_primer_S GCGGGCACATTTTTGTTTTGATTGTAGCTTAAA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCACATTTTTGTTTTGATTGTAGCTTCAG
Common_primer CCAAATAAGTAGTTATGTACAATGGATTT
enzyme Stoffel frag.
dye EvaGreen

Line allele-1 allele-2
AE-P03 T T
LS1934 C C
Nakate Shinkuro T T
WCGR112-8 T T

Population Linkage Group Position
LW2010 E_12 67.8
LWA2010 LWA_12 65.191
LWAE2012 E_12 65.337
LWF2_2022 E_12 72.9

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain