+Marker Data: est_smfl09a01

Crop eggplant
Population LWF2_2022
Linkage Group E_12
Marker Type SNP
Map Position 107.0
Annotation
Source Name SmFL09A01
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method DirectSeq
Marker_Class EST-misc
STS_primer_fwd GCACTACGGAAATGGAAAAACGAC
STS_primer_rev GACTTATTAGCCAGCTCGGAACCC
amplicon_seq NNNNNNGAGAAACCTCATCTTATCGTTTTCACCGGTATATACACNNNNTCGCTCTGTTCAGTTTCTGTTGTTGTTGTTGTTCTCATTTGGCGTTGTGTTAGGCCGTTGTTAATGGACTTGAGTATGGATTACGAGTCACTTTTTTTGAATGTGGACCTGATTTGTACTGCATCGGACATTTCTAGCTGGTTTGGCTAAGTTTCTAATAGGCATAACTGACATCTATGTATTTCCACTTTGGATGTGCACCCGTAGACATTTAAATTTGCTTAGAGCAAGTAGACACGTGTTCTAAGTNGCAAATCGCGNCCTATGCTACATTCTATTTGACNTCCTAGGTGTATTATGCTAGGTAGGATGCGTGTGTTTACTTATTCAGCTCTATACAAGTTTAAGCGTTCACCTGTGTTGTTGTGAACTTTCAAAGTTGAAGGGCATTAATGCTATATGAGGCCACGTTAAAAGGATATACATATATATGTATGTATTATGACTTTCGAAAATCTACTACTACTAATTTGTAGTGTTTTTTTTNGTTAAAAAGTAATTTTGGAAGAAGTAATCTGGCTNAGCTTTCAAATAAGTAATGCTTCTTGAGAAAGGTGCTAANTATGAGCTTCTTAAAAATGCTTGTTACTTTTTCTAAAAGCTTGTGCAAACATCTCGATTTTCTAAAATAAACATTTGTAAAAGAAAATTCACTTTTGGCTTCTTGGAAGCTTGGCCAAAAAGGCTAGAGTGAATATTGTCTTTGCTCGAGGAAGAGGAGTGTGAATATTTAACGCTTATNTTTAAATTGATGTTGTTTGAGTTCGGTTATTGTCAAAATGTTTGTAAAATTTCTGAACTGGATACATTAAATTAATTAATTATTTGTTTTAAGCAACTGAGGAAGGGATTGAAGTGCATATGGGAATCAAATTAGAATTCAAAACTCAATGCTGTTTACTTGTTCCTAACCTTTTGATTAGTGCAGGTTAGAGTTCANTTATTGAACAACTAACGTTACGTTACGTGTAGAACAATCATCTTTTTGACTTCTTCCTAAAATCTAAGGACTTAATCTATATAACAACCAACGAAAAGGTCTCCTCTTAATAGCAACTCAATAATTTTGTCACAATTTTTTCCTGACCTTTGGCTTTTGGTGGCTCCGTCAAAACCTGCCCTAAGTGTTTTTTAAGCCATTTAACCATTGCAGGGGACAACATTTTTGGATTTGATGCCAAGGATCCTGTAAAATCAATGAATGCTGCTTTTGCTCCTGCAATATCTTCAAACATACCATGGGCTGCTGTACTAGGAAATCATGACCAAGAATCTACTCTTTCAAGGGAAGGCCTGATGAAACATATTGTTGGCATGAAN
SNP_position 151
allele_1 G
allele_2 A

Line allele-1 allele-2
AE-P03 G G
LS1934 A A
Nakate Shinkuro A A
WCGR112-8 G G

Population Linkage Group Position
LW2010 E_12 95.9
LWA2010 LWA_12 94.234
LWAE2012 E_12 91.51
LWF2_2022 E_12 107.0

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain