| Typing_Method |
Tm-Shift
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| Marker_Class |
EST-misc
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| STS_primer_fwd |
GACCTATTCCTCCTGGTGGGACTT
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| STS_primer_rev |
CCAGATTCAAATATTGCTCCACTGA
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| amplicon_seq |
TGCAGGTTCTAATTCTGTTCCTTTTTTTGTTTGTTGTTGTAAAATTGAAGTTTTAGCTTTAGTGATATAATTGGAGATAAATTGAGTATCTTGTTGGAATATTTAGAGGATAAGAAATGAAGGTTGAGCCTAAATTAGCTCCAAAAACTAGCTTATGAGGTGAGAAGTGGGATGGGTCTGACTCTAATACCATTATAAGAAATACCTAAAAGCTAGCTCATGAGACGAAGATTGCATGTACAAGGGAACCAAGTTCCCCATCTCATTGCCAGTATGTGACTCAACAATTTTGTATTTGAAAAGTTTTTCTTTGAGGAAACAGCCTTGGGTCAATTTTCATGAATTTCATAGAAGAGTGAAAGAACTATAGAATTAAATATGAGGAGATTGGACATTATTTTAGTATGAAGTAAAAGAAGAATGTGAAATGTTCAATTAGAAAAGCAGGAAACATTTCCTTAGATCTTTGAAGTATCGCGGCTTTCCGTCCAAAGTAGCTAAGCATGTGAAAATGCTTAAGCTATTTCCTGTGTAAAACCTGAAAACGAAATTGGTGTACTTAAATCATCCTAAGTTGGGTTAGATTTTGTAGAATAGAAACAAAAATGGTTTGAACCTGATTTTATATTCTAAGCTTGCTAGGAATGATAAAGTATTGTTTGGAAGGCTGAAATGTAAGTGCTGTACATTATTTTAAGTTAAACTATTATATACTAATTCAGTGCTTTGATTATTAATTTTAGTGTCATCTTTCAACACTCATCCTCATACATATTTAACTAAATAGTTGGTAAATTTTGTGACATTTTCTTAATATGAAATTTGTGGTTTGCAGCCACTGCGGTTTGTGCGACACATTCTACATTGCCCATGTCAAGAATGCATGTGCTTTCTTGGGGGATGGCATGTCTAGAATTGAAGTGAGTCTTTCTCCCGCTTCTGTATAAGTCAAGATACTGTGTTCTTTAGTTGCAGTTTTATTGTTTATGTCTAGTTTTCATTCCTTAAGTTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTACGTTGTTTTAGTGATCCGGNAAGATCGATTTACTCCCCGACCTGTCCTGGCAAGGNTTCGTGACTGGAATTNGAGTNCTGTTTNGTTTTNCATGTTGATATTCTAGTGGTTAATTTAACCATTTCCATCCTCCTTTCCCCGTTCATGTTTTTGATAGGACACCAGAGGAAGTTATAGCAGCTAAAGGTGTTAAGCCGACACTGTCTCCTAATCTAAATACTCTTGCTTTAGTTGAGGTTTCTCCTTTCACTTCCATTAACATCAGATTCTTTGTTTTTCTTTTGTTGTCATCGATGCATTTATAATTTGTGTCACTCTATCGAATTCCTGAATGAAGCATGTTATCATGAATTGAAGATGTCATATCTCTCTTCAATAGGTAATTGAAACTTGTGTAGATATGCTTTGTGATCTGCCCCAATTGAGGATTTCACGGAGAATAGCTTTTGCTTTTTTGATTTCTTTCATGTGATAGTTCTAGCTGCATTGCTTTCCTGATAATGTCAGATTCTTTTTGCCAAATGTTTCCTCTCTTTCCTTTGGGAGGGTCATGGGTTCTTTTTTTGACTTCGTTTTAACAATGTGAGATGGTTTTTCCCCAAATGCTTTCTCCCTTTCCTTGGGAAGTATCAGGCTCTTTTGTCCATCCCCAACCATCTGCATTTACATTTCTAAATGTAGGCTTCTAGTTTTTTTATTCCTAACAGTGCAATCCATAGAATTTCACACTTTCTACTCATGCATGCTCTAATGCATTAAAATTTGGGTTTTAGGAGATTCCTGTTTTCACTGAGGACTGTCATGCGAGTTTAAAGTATAATCTAAAGTTCAAATGTTTAAGTAAGCAATAATTTTTCCTGGAAACAGGCAGCTGGTGTGAAACGTCTACTCTTCTGTGGTGTTGGCTGCCAAGTTCAAGGTATTAATGTTGTTATGATCACTTCGTCTATCCTTTAAAGTTGTTGTTGGTCATTCCATCTCTGTATCATAAGCAGTGNNNNN
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| SNP_position |
94
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| allele_1 |
T
|
| allele_2 |
G
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| ASP_primer_S |
GCGGGCTAATTGGAGATAAATTGAGTATCTTGT
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| ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCTAATTGGAGATAAATTGAGTATCTGGG
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| Common_primer |
AGGCTCAACCTTCATTTCTTATCCTCT
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| enzyme |
Native Taq
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| dye |
SYBR Green I
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