+Marker Data: est_ls003g02

Crop eggplant
Population LWF2_2022
Linkage Group E_09
Marker Type SNP
Map Position 97.5
Annotation
Source Name LS003G02
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class EST-misc
STS_primer_fwd tccggatgcatataatgcagacaa
STS_primer_rev caggtgaaagattttgagggtaacca
amplicon_seq ATTCGTGAAAGTAGAGGCTACAGCTACTTGGTATTTCTGTTATACTGTTAATTTTCTTTGTGATTTATATGCTTATGGGTTGTTGAGACGAGGTCCCAAGGAAACAGCCTCTCTGCTATGAGGCAGTGATAAGGTCTGCATATATTCTACTCTTCGGACCTCACTTATGAAATTTCACTGGGTATATTGTTGTTGTTGTGTTGTGTTAATTTGAAGAAGAACCTGATAATTATGATACAGAGTAGTAATTATCCTTCCTTGTGACCACAAGGTCACTAGTTCAAGCTGCAGAATCAGCCTCGTATAATAAACTCTTGTGGTTCTCTGTTTAATCTACTAGAAGCTACAAAAATTAATATGGTATCAGAGCAGGACTCATTTCACTCAATATTGGGCCTTCAAAAAATAAAAAATTCTCACGCATCATATGTGAAGCACCCGGGCGTGAGGTGGGTATTGAAAAATACGAAAGTTTCTCCGCATTGGTGGTTAATGAGATGAGTGAACTCCCTTATAATGATTGGACAATCCCTCCTCCTTTTGAGCTAGCTTTTGGGGTGTGATTTAGGTCCAAGATCTAATTTTACTAATCGACCCTTTTCGGAATCGGTCGTGGTGAAGCTTTAGTACATCGGGCTGCCTTTTTTTTAGTACCTTATAATTATCTTAGGTTGTAATAACCTCAATTTCAACAATAGAAATATTCAATATTATAATCATGGAATTCAAAGTTACTACTGAAAATGAAACTAACAAAGAACTTGCAGnnnnnATGTTTTCCCGAGGAACCCTCGTCTCAAAAACCCATAAGCAGAAATAAATTAGATATGAAAAAAAGGGAAAAGAAAAAGAAAAATGAAAACAGAAAAGAAGCGGACCTAATAACGAAAAGGCATATAATAGTATGTTAAATACGGATAAAATTAAACATATATAAGAAAAGATAATGACAACACATGATACAAAGACATGACTAATCCTACTACCCTACTATACCTCACGGTCAGACATCAACATAACCCTGCTAACTTATTAGCCTGTCACTCTAATTCGTGACCTCCACTACATAATTGACAATCTTAAATTGGTAATGCAATCACTCTATTCGAGTACTTCTACATATTGTTAACAAGCCTTAGGGAATGTACTAATAGTTCAAGCTCTATTGAAATCCACCATAGAAGTGAATTTAATTTTTTTCTGTCAAACTAAGTAATGCAACTATGTAACTTACAAGTTTAATGGTATGTTAGCTATGCATTTCACTTTTTGTATATGATTTTGTTGTGCAGTTGATGAGGTTGT
SNP_position 93
allele_1 G
allele_2 A
ASP_primer_S GCGGGCGCTGTTTCCTTGGGAT
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCGCTGTTTCCTTGGGAC
Common_primer TGTGATTTATATGCTTATGGGTTGT
enzyme Stoffel frag.
dye SYBR Green I

Line allele-1 allele-2
AE-P03 G G
LS1934 G G
Nakate Shinkuro G G
WCGR112-8 A A

Population Linkage Group Position
LWF2_2022 E_09 97.5

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain