+Marker Data: SOL7319

Crop eggplant
Population LWF2_2022
Linkage Group E_09
Marker Type SNP
Map Position 60.7
Annotation
Source Name SmFL21J11A
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd CGCAAGCTGTTAGGACTTTGCTCT
STS_primer_rev TTGGTTCCCTCCCACACATAAAAG
amplicon_seq NNNNNNNTACCCATAGTTTGTTGTCANTATTTCTATCTATTGTAAACTAAAATGCCCTGCTTTCATTTTTTCACTCTCGGGTGAATATACTTTACAAGTTCAACAATACTCTTCGTTGATATGAAGGACGAAGCACCTTCTTGGTTCCACTGCCAAAGTTTTCTGACAATGGGCACTTTGGGGAACATCGTTTCTTCAACAATAAACCCACTATTGTCCATCCAATGCCATCAACTAATATTGATGATTCAAAAGAGGTATCAATAGTTTATTCATGTTTGATATTTTAGACTCATTCTCATTACTCTAACTGCATCCCTTCAGCTTCTAATTTTAATGAAGTGATAGCATTATCTATGTATTCTACTATTCCGCTAATATGTTGCTTGAGCATGAATGTCTAAATTTTCCTGATTTTGTTTTCAAATAATCTTTCAAGACTACATTCTCCTTCTCAACTGACAAGCAAGTAAGAAGGATGCAATGGTTTAGACACGAACAGCATTTAGCTTAAATGAGATAGAAGCAATGTGGCATCACCTTTAGCAATTTTAGGACAGGCTCTAGTTCTAACTCAGTACGGGGGTGGCTTCTTCTATGCTTTTTGCCTGCAGTCAACTGTGTCTTGAATCAGCAGATGAATTAATATTCAACCGAATTGTTTTTATGGATGATCTAATTGAAGAAGCAGTACACGATGCAACTTTCCTAAGCTATGATCCAAAGTGATATTGTCTCTGATTCATTAATTTCTGGTTTGGGTTATCGTGAAAAGATTGAATGGATTCAATTGCAGTAAGTTAATCTACTAGAATTAAACCTATTTGAGAGTTTATTTATTATGTCTCCTACTAAGCCTAAGTAGCTATTCCGTACCTTCATGCTTAAGCAAACTAGTTTGCATAATATGGAANGCTCAGAAATTCTGTGCTAAATAGGTTGATTCCAATCTTCAGANCTATGTAAANCATTTTCCAGANTACTGATTAAATTTGTTGAANTCGCTTCCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATGAGNACAGANTAGTGNNATCCTTTANATGTATTTNATGACTNATTNNCTGCANGTATGTTNGANTGAANCATGATAATNNATNAAACAGTGCCATGAAACTGTCTATNGCAGACAAAAGCTCAAGAAATGCTCAACAGCAAGCACATACATGGATGATGTCTTTTACTTCCTTGTGTCTGTGGTNACTCTGCTTTTCTATGCTTGTAAAATGCAAAAAAGGGATCACCTTGAATAATTAATTAGCTTCCTCTATTCCTCTGTAGTCATGATATATAACTTATTCCATCTAGCTTTTGAGAAGCCATATGTTGCTACTATCCCTAGTTCATACTGTATAGAAATTCTTGTGGCTTCAGAATATTGATATGTCATGTTTATGGGATATGCCACTTGCAACTTAGTTGCTGATTACTGTTATCAGCATATCATCAAGAAGTTCCATCAAATGATGTATTGCTACATTTTGTTCTTTACCTGAATCAACATGTGAATTGGCTGGGAGCTATTTGAATACTCCTACTTAAACTACCAGTTCTTGGCTTGACTGAAAGACACTCTAGCTCCAGAAATTTTAGTGCAGGAATATTCCCATCGAGCGCTTTGTAAGGAATTTCTTGTGTGTCTTGAAGTGCTTCTTGCATCCCGTGAAATAACACTTGTGCATTTGTTATTCCAGAAGTTAAACGCAGAAAGCGACACAGGAGAAAGCACTTTGAAAACCAAGAACCATGTTTCATGAGAGGTGTGTACTTTAAAAATATGAAATGGCAAGCTGCAATAAAAGTTGATAAGAAACAAATCCACTTGGGTACAGTTGGCACTCAAGAAGAAGCTGCAAGACTGTATGACAGGTATCATAGTGCCTGCAAATTTATTTCTCCACTTGTTAAATTTTGCTCCCCTGCAGTGTGGTGCTAAAAATTTCAAATGTTCAACAGGCTTGTACCTTATCGGTATTTGATAAGATGGGGTTTCCTAGGGTTCATCTACCAATACAAGATCCTTTTGCAGTTTTACTGCAATTAGATGATTTTTNTATGGAAGTTTTAATATGGACGGAAATNN
SNP_position 203
allele_1 T
allele_2 C
ASP_primer_S GCGGGCGGCATTGGATGGACAATAGTGGGTTTA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCGGCATTGGATGGACAATAGTGGGTGTG
Common_primer CACTTTGGGGAACATCGTTTCTTCAAC
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I
Line allele-1 allele-2
AE-P03 C C
LS1934 C C
WCGR112-8 T T
Population Linkage Group Position
LW2010 E_09 56.8
LWA2010 LWA_09 59.41
LWAE2012 E_09 43.752
LWF2_2022 E_09 60.7
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain