+Marker Data: SOL5084

Crop eggplant
Population LWF2_2022
Linkage Group E_04
Marker Type SNP
Map Position 98.7
Annotation
Source Name OVL04I17A
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd ATGGGATGTCTCAGTTCCTCCAAC
STS_primer_rev AACATGGTGGACAAAGAGAGGAGC
amplicon_seq NGTATTTCACCTTTTGGTTTTTCTGTTTTCTGCTAATTTATACGATCTTCTACGATTTCTTGGATTTTTTTTTGTACTGTTGCTTATTAAGAAGAGACTTTTATGGCTATCTGATTTCTTATATCAATGCAAGAAAGATTATTGATTTTGAGTGCCAAGGGTAGTGTACTAGTTCACGCTTCTATTATTTATATATGACGACTTAGTGTGGTTAGAGACTTCTTTGGCAGTAAGGAGAAGAGTAAAGTATAATTACTTAATAGTGGAAGAGAGGATAGGAGTAGAATGGAATGGATATATTGGTTTCATGTAATTCGGAATGGAGGCATAGTTGACTGATTGATTGGTAGGTAATTGCCAGAGATTGGCAGCAGACGTTTGAATTAATTGCAATGTGATCTCTTACATGATATTATCTTTCTGGATTGTTTAAATTGCAGGAAAGTTGCTGTTATCAATTTGGATCCCGCTAATGATGCTTTACCGTATCCACTTAAGTTCTGTACTTTTTTGACAATCTCTGGATAACATATTTTAATGTCTAATTCAAGAAAATTGTTCATGTATAGTTAAATAGGAAAACAGTGTGTATGGTTATGTTCTTCCTTATCTGATAAAGATATGAGTGTGCTGTGAATATTGAGGATCTAATTAAGCTGAGTGATGTAATGATTGAACATTCTCTCGGTCCCAATGGAGGTAAGCTTGCCTTTCCCCCTTTCTATTAAGATCAGTCTGCATTCAGTCATTTAATAAATAAGTTCCAAGTTGCTATACTTTTGGATGCTACCACCATATCATTAGACGTGTATGGGTACAAGATGTTGCTTCAGTTCTTGGGCGACCTCCATTACCTATTTTTGGTGCAANGATATTGTTCATTATATAGATGATGTTTTCTTTGCTTTGAATTGTTGTTATGTTCTTGTGATTCTTACCTTGTTTTNCTAACTCATAACTGTATTTTNCTTTCTGTAGGNCTTGTATATTGCATGGACTATCTTGAGANGAATATTGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCGATCATTTTATATTTTGCTGGAACTGGCTTGGTTTGTAGGTGTTTNATGCCACTTTAATGCTGTCTTTATGTCTGGGGAAATTNACAACTTGTCAAATTAGTGTCTCAAAGTTTCAGTTTCCATGTGGAGAGCCAGTCATTTTGCATCAGTGCTATATTTTCTCAGCTAATCTGTCTGCTTTCNTATATGCTCCCGTTACATACTTCATACCATGTTTTACTTAACCTCCAATTTTCTAGGTTTCTTCGAATTCACAACAATATAGATAGTGTGAAAACTTTAAATAAGAAAAACATAGATGGTGCAATTGTTGTTACTGCCTTACCATTCTGGCAGTGGCATGGAACTGACTTTGAGAGTTCATGACTTCTTGATTAAAAAAAATACATTATACATCCTGGATTTTAGAGATTTGATAATTTGTGTATTCAGTTGTAATGGTTTCTGTTAATCTAAACTTGAGTCAATGTGTTGAATGTGATGGAGCTATTACACTGTAACATACACATGGTCAGGCTTGGGCTAAAAAGCACCAATAATATATGCTCATTTACAACAATATTTTACTTGCTTGGGTTTGCTAACTTTATTTTGATGAATTATGCGAAGAAAAATTTCGAGTATGTGAATTTTAGCAAAGTTGTTTGAGCACCTTGAGCTCTTGAGATTCAGCACATTCATGGATCCTTGCCAGTTTACCCATCGTCTTGTGTGAAAACTGCAGTATTCTAACCACCACTTCAGCTTGTTCTGACTTTTGTCTATTTATTTTTGCAGAGCACTATTTACTTTTTGATTTTCCGGGTCAGGTGGAACTATTTTTCCTTCATAACAATGCGAAGAACATGATTATGGAACTTATAAAGAAGTTAGATCTCAGGGTTAGTCTCTTTTTCAGAGTTATCACATCTATTTCATCCTTCACTACTATGCTTCCCGTTAAAGCTAAATCGCTAATTGTTTAATTTGTTAATGCAGTTGACTGCAGTCCATTTGGTTGATGCCCATCTTGCAGNGATCCAGG
SNP_position 1249
allele_1 G
allele_2 T
ASP_primer_S GCGGGCAGTAAAACATGGTATGAAGTATGTAAA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCAGTAAAACATGGTATGAAGTATGTCAC
Common_primer TGCATCAGTGCTATATTTTCTCAGCTAATC
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I

Line allele-1 allele-2
AE-P03 G G
LS1934 G G
Nakate Shinkuro G G
WCGR112-8 T T

Population Linkage Group Position
LW2010 E_04 73.4
LWA2010 LWA_04 76.861
LWAE2012 E_04 75.254
LWF2_2022 E_04 98.7

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain