+Marker Data: est_sep03o11

Crop eggplant
Population LWF2_2022
Linkage Group E_02
Marker Type SNP
Map Position 59.7
Annotation
Source Name SEP03O11
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class EST-misc
STS_primer_fwd gcgcaaagttacaaaaggaaatgtg
STS_primer_rev gattagccaatcgataacagcatcg
amplicon_seq ANNNNNTGGACCTTTCCAATTCTCAACCTACTGGCAGGTTCTCTAATGGCAAACTTGCCACAGACTTCATTGGTAATTACTACGACATTCTCTAATACTACAATTCTTCACAACAAATTTCCTAGTTAATTCCTTTTTACTTTAGTAGTGAACTAATTCTGTTTCTTCTTTCTCTTTTCCTCCTGATATGTACGTTAATTTAACTACTCCCTCCTTTCTTGTTAAGTTGTCATAATTTTCTTTTTGAGAGTCAACCAAGATGAATTTTGGCTAACATTTTTAGTGGCTCGAGAAAAATTATTACGTACAGTTTATAACACTTTTCATATAATTTTTGAATGTCNTAGTTTTTTATTTAAAAATATCTAATTAATTTAATTTGAAAATTAGTCAACTTGATTCTTGAATAACACAATGTGATAGTTAAAAAGGAATTCTGGGAGTAGTTTATTGTAAAATAACAGAAAATTTACCTTTTGAATGTTGATGCATGAAAATCTTCACTAACTATTTTTCATTTTAAAAATATTTTCCCACTAACAATTTTTACCGTATAAAAGTAATCTTATTTTATTAATTTGATGAAAGTTAGTACGTACGTAAAGTATATTTGGACCTTTTAAATTTTAAAAATAGTAATCGAAAAAGTTTTCAAAAAAAAAAATAATGGTTTTGCAGCGGAGNNNNNN
SNP_position 288
allele_1 T
allele_2 A
ASP_primer_S GCGGGCTAAACTGTACGTAATAATTTTTCTCGT
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCTAAACTGTACGTAATAATTTTTCTCGA
Common_primer TTTCTTTTTGAGAGTCAACCAAGATGA
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I
Line allele-1 allele-2
AE-P03 A A
LS1934 A A
Nakate Shinkuro A A
WCGR112-8 T T
Population Linkage Group Position
LW2010 E_02 40.3
LWA2010 LWA_02 41.855
LWAE2012 E_02 42.448
LWF2_2022 E_02 59.7
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain