+Marker Data: gg9686_1024

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_09
Marker Type SNP
Map Position 1.238
Annotation
Source Name FKO03-01.5923.C1
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_rep_c9686
454-Contig_seq (unpadded) TTTCTAGAAAACTATTTTCTTCGTGAAAGAGGAAATTTTCCAAGAGCATATCTTGCGGTGACTCTTTGGCATAGAAGTTCTGTTTCATTCAAGTAGAAACTGATGTGCTCTTAGTAATATGAAACTTATTGACTCATCAGCAAAGAAAGGGATAAAAGTATAATACTTAATGATGCTTGCAAAAATTTCAAGAAATTCTTTCATTTCTATCACCTCAAATGTGGGGGTAAATATTGCCGGTGAACGAAAAAGAAAGTTTTGTATCTCTCTCATAGTAGATATTCAACAGGCTGAGTTGTCTTTATGTATGTTTCCCGATGAGCTTCATGTTCGATGTGATTCCCATTAGTCGNCATTGGAGCTAATTCTGTTTTCNATTGATATCAGATGACAGCATGGCNAATNACTAATGGCATTTCNAGACACCAGAAGTTGAGATCCTAGGCTTGACTACGACATTTGGCNAATNGTTACTACNAAAAGATGCTACACGTAACGCATTACTTTTGGNTATGTTTTTTAGTTNTATTTATCTAGTACCTAGTGATGAGTATAAATTCCTTTNCCTGTAATCNATTTTTACAGTTTCCATNCTACTAGATGTTTGTGGGTTGAGTTCTTGATCAATTNACTTCTTTAACTTAATTTCCAAAATGACAGTGTGAGGCTGCAGGATGTCCGGATGTTCCCGTGGCAGAGGGTAGCCCAGAGCCACTGAAGGTAATTTTGTTTTTATTTTTACCNACACAGTGTAAAGCGATGATTGCTTTTACNACAAAATTCTTTTTAGTTTATGCTTGATTTACACTGTCGCCTAACTTTTATTTCTTGCTGTAGAGAGGGGAACCACGGGTTGCAGACTTTGTTCATGGTTCAGATGGATTAGGCAATTTATTTTTACCTTCTCCAAATTCAAAGAAAATCGACAAATCTGCATCTGAATTCTTGGTGGAAAAAGTTTCTGAATATCCCGGTGAAGTGTCTGTACTCGCACTGGGACCATTGACAAATTTGGCTTTGGTATGTCGTATCTTAAAACTTTTGATTTTTACGTTTCCAATTTTGCTTCCGATAATAGAAGTTTCATTCTTATCTGTTGGTAGGCTGTCAAGAGGGACTCAACATTTGCAAGCNAAGGTGAAGAGAATAGTTGTACTCGGTGGTTCCTTCTTTGCTTTAGGAAATGTTAATCCTGCTGCCGAAGCNAAATGTGGGTNGATTCTTTTTCCNACTATAATATTCGCTATGTTTTAAATTCCTTTTCCNAAACTTGCTTTGATATGCTTTTCNTTGATCCGATGGTCTATCGGAAGCAACCTCTCTACCTCACAAAGGTAAGGTAAGGTCTACGTATACATCACCCTCCCCAGAACCCACTTAGTATGAGTCCTTTTNTGGCATTATGTTAGCAGAAATACTGCGAATTCTTGTGTATTATATATCATTTCATATTGTCATTAAAGTCTATAAGCTCAACATCTTTTGCATGTTCATGTATTCACTATCCGAAGCTGAAGAAGCATTCGTTGTTGTATTCAATCATCCAATCCTTTACTGTCTTCTCATTTGCATAGTTTTCTGACAGAACAGATATACGGGGATCCTGAGGCTGCTGNATGTTGTGTTTACATCGGGGGCAAATATTGATATTGTAGGCATCAACATTACAACACAAGTCNAAAATGACAGGTGAGTGCTCACTGCTTTAATATGTCGGACGCTTCTACTTTTTGNCACCTTTCATTGTATAATTTTGTTCACCTCTCGAATAAGAGTGTGCGTTTCCCTGCTTGTAGATGCTGATCTTGAAGAACTAAAGCAATCCAAAGGAAAACACGCTAAATTTGTGTGCGACATGTGCAAATTTTACCGTGATTGGCACGTGAAATCAGACGGTGTCCATGGTAACTTCTGTGTTCTTATAATGTTTTTGGATGATTGGCATTGCTTAAACCACCTCCTTGCATNNTTCTCNTTGNTNNAATCATCTNCTTNCTCAATTGGCGCTTAAACCCTTCAAAAGTATTGCGTTGGATCCTCCAAAAATGCACCACTTTTTGAGGATCCAACATGCATCTAACGAAATTTTTGAAGAGTCCAAGCNAACATAAGAGTTAATCACCACCGATAATAATTATACACCCATCCTATTTGCAGGAATTTTCCTACACGATCCTGTTAGTTTTGNTAGCNNACTAGTTCGGNCCTGAACTCTTCACCTTCAAGAAGGGCGTTGTGAGGGTTGAGACACAAGGCATCTGTGTCGGGNCNACACCTTGNTTGGATCAAGGACTTAAGAAGTAAGTATTTGCTCAGANACTCCCCAAAANATGTTGCCACGCTTGTGTCACTCTACTTCTGGAGGGTCCAACATCCATCTTTCAACATTTTTGNAACAGTCTGAGCAACATAGAGTATTTGAACTTCTTTTGTTTTTTGNCATAGTAGTTAGAACTAATAAATCGTTATATTAGGTGGAATACAAGCAACCCNCTGGACAGATTTTTCCCCGGTTTCAGTTGCATGGACAGTTGACGTGGATGAAGTTCTTGATTATATAAAGAAAACGTTGATGAAACTGTGATCACCATTGGATCTATCGGTCTCTGCCACGTGTGAATCCTGCTCCAGAGATCGAGGAACGTCGTGTTTTCTAACAACACAATTGTTTTTAGTCTTCNTTTTTTCCTCCATTCCTTGCAACTAAATAAACCTCAGTTAGTTCTGGGAAAATATGTAAAGGGCTTATAAAATGGAGGTCATTTTCATGATTCTTTACATGTGTCATATAGTAATTCTTNGAACCAAGCTTGGTTGGCCTAGTGGTTAGCTCACTAGGTCGCTTAAGCAACTGTCGGGGGTTCGATTCCCGCCTTGTGCATGCAGCGACCAATTGGTCAACAGCAAACCCTTAAATGGAGCTCAGATCTGCAGAGGATTAGTCCTTGGCCTGTTNGGTCGGGGATACCTTGTAAAAAAAAAANAGGTNAATTCTTGANTTCAATTTTCGCCCTGNTGTTATTGGTGCCATGTGTTGGAATTTTTCGAGAAGTTAGGGAACACTAGTCATTTCTTAAATATAAAAATTTAAGCAAAA
SNP_position 1024
sequence_for_GGdesign AATATCCCGGTGAAGTGTCTNTACTCGCACTGGGACCATTGACAAATTTGGCTTTGGTAT[A/G]TCGTATCTTAAAACTTTTGATTTTTACGTTTCCAATTTTGCTTCCGATAATAGAAGTTTC
GGdesign_Final_Score 0.91
Ilmn_Id 9686_1024-0_T_F_1951735582
allele_1 A
allele_2 G
Line allele-1 allele-2
Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_09 1.238
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain