+Marker Data: gg10779_1541

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_09
Marker Type SNP
Map Position 17.864
Annotation
Source Name FKO03-01.879.C1
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_rep_c10779
454-Contig_seq (unpadded) AATAATAATATTTTAATATTTAATTTTAATAAATTANNNNTTTAAAATTAAAAGAGTGTGTAACACATATAATATATTTCTAAAACTAATAAGTGATAATTTAGTGTTTGTACAACTCNAAAAAATGGTATAANTTTGGGTAAGTTTCGTAGTCTCTGCAGTTGTTCTGGATTCCCTCAATTTAGGTTTCAGTTCTTCTTTTGTTATCTCTATGTTTTCATGAGATTTTCTTGTGAGTTCTAAATAGAAGCAGCTTTCCCACCGTGTCAAAGCAATTTATTGGTGGTTACACTCCATGGGAAACAAGACTTCAAAGGGAACAAATGCGAANTTATCGGGTTGGTGTTGAAAGTGTTAAAATTCCTTTTGNTAGATTTGGTGGAAGCAACTAACAACTTTGATGACAAGTTTCTCATTGGACGTGGTGGNATTTGGGAAGGTTTACAGGGNGTGTTTTATGTGATGGCACAAAGGTGGCCTTGAAAAGGGGTCGACTTGAGACCGGACGAGGTGTTGCACAGTTCCAAGCAGAAATTGAGATTCTCCAAATTTTACCCCATCCGCATCTGGTTACATTGATCGGATACTGTGATGAAAGAAATGAGATGATTCTGGTTTATGAGTACATGGAGAATTGGACCCTCAAGAGACATTTGTATGGGTCAGATTTACCCACTTTGAGCTGGGAGCAGAGACTGGAGATATGCATCGGGGCAGCCAGAGGTCTGCAATACCTTCATACTAGCTCAGTTATACATCGTGATGTCAAATCTTCAAACATATTACTTGATGAGAATTTTATGGCAAAAATTGCTGATTTTGGAATATCCAGGAAAGGGCCTGGGCCTGATCAGACTCATATTACCACAGGCGTGAAAGGAGTCCTTGGCTACCTTGACCCTGAATATCTTAGAAGGGGACAGCTGTCAGAAAAATCTGATGTTTATTCTTTCGGTGTTGTTTTATTTGAAGTTGTTTGTGCTAGGCCTGTCTTCGATTGTTTTCTTCCGGAAGAGGAGATGAGCTTAGCTGAATGGGCAATGAAGTGGCAGAGAAAGGGACAACTGGAACAGATCATAGATCCCAATCTTGTTGGCAAAATAAGACCAAAGTCCCTGAGGAAGTTTGGAGAAACAGCTGAGAAATGCTTAGCTATTGATGGTGTAGATAGGCCATCTATGGGTGATGTGCTGTGGAAGCTGGAGTATGCGCTTCATCTCCAAGAGTCTATCATTCAAGATGATCCTGAAGAAAACNAATATCATCCCTATTGNGCCATGATAGCGAGCAAATTAGTGTTTGCACTGGTGTCAGTGATTGGAGTGGTATTGCTGCCAGTTCTTTTGCTAGTCAGATCAAAACATTAAATTTGGNATGATCTCTAAAGTGAAAATGGTTCATACCTTCCTTAGGTGTTTGTTAGTTCCNATTNTATATTNTGTTTTCTATTNTACTAANGTTATGAGTTGTGGATCCTATTCGAATTTCACTCTTAACANTTTGTATGTTTTATTACAACTTTTTCACTTGGGCTAAAATGTGTTACTACTCTTCTTTCTAAGTGCTGCTCTGCAAGAAGTCTTTCTAAATTGTTCAGTGTTGAGCTTCTAGATAATATTCNAAACACGAAACTGAGGACAATAATGCTTTTAGAAGGTNAAAATAGGACTTGCCTTTCCCGAAGAGGCAACCCCTCGCAGGCATGCTTTTATTTACACCTCATAATGTTTGTTATGTGTGCACTAAAGATTTGACTATAATTTATACAGTGTTTTCTATAACTAAGAACTGAACTGTGCTTAAATAGTTAATCAATCTTCTTCACCATTTACAGATACTGGTTTATTTAGACTTTTATACATCTGCTAGATTAATATAGTTGATTAATTTGGTCACTGAT
SNP_position 1541
sequence_for_GGdesign GAATTTCACTCTTAACA-TTTGTATGTTTTATTACAACTTTTTCACTTGGGCTAAAATGT[A/G]TTACTACTCTTCTTTCTAAGTGCTGCTCTGCAAGAAGTCTTTCTAAATTGTTCAGTGTTG
GGdesign_Final_Score 0.897
Ilmn_Id 10779_1541-0_T_F_1967852515
allele_1 A
allele_2 G
Line allele-1 allele-2
Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_09 17.864
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain