+Marker Data: SOL5238

Crop eggplant
Population LW2010
Linkage Group E_11
Marker Type SNP
Map Position 38.1
Annotation
Source Name PLA06D24C
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd AAAGATCGGACCATCCGGCTAT
STS_primer_rev CCACCACACGAACAAAGTTTTGAA
amplicon_seq TCGAGTATCCATTAAACGTACAAAGCTCACGGCCGTGAAGTCCGCGATGTCCATGTCACTCAGTAACATTCTTCTCTTTTCTGATTCTTTTTCTCTCATAATCGATGTTTTCCAATATCTGTGTAGTTGTGTTTTGCTATCTATTACTATATTGATTTGTGAATACAATTGTGAATTATGTGCGTAATTTTCTCATCTTTTGAATTTACTTATTTTGTTGAATATGCATTTGAACAAAATCAGTCTAGACGTGCAAGAAGGATTATAATTTATTCAGCTGGAGAGTGTGAAAAATCACATTCCTTTTTACCCTTTTTTACGTTGCATATCAATGTAGGGTGGAAAAGGAATTTTTGTGCTATGTCATTTTTGCTTGGTTAAATTGTATTTGGTTTTAGGAAAGGTGAGGGGCTGTACAAGATAGGGGGGAAAAGGCTATTGGTTTTACTTCTTCCAGATGATGCTTTGGGATGCTTAGTTTTAGCCTCTTTGGCATGGTTGGAAAGAGAGTAAAAGTTGCTTTCTCTGTTTTAAATTGAATGTCTAATGTTGATTTCCCAGGTAGGCGAAGAAAGGTTAAATCTTGCATTGTATAGTAGTAGTTGAGAGAATGCATGGTCGTGTGTAAGCTTTTTTCTTTTGTAGAATAAACTAGAGAACATTAGTCGGACAACTGTTATAGGGATTCCCTTGTAGAACCTTTTAAGGAATATATATCATGTGATTCTGTGAATACCTTATTCTTGCTTAAGTGGGCATAATGTTGATATGAACTAAAAGAGGAATGTGGATGTTCAATTTGAAATGAGGGAGTATATATTTCTTCCTTCCTATCCACCTTTGGAGAGATGTAAAAAGCTGAATATAGAAAGGTATCTAATCCACCAACATATTCACTTATCCTCCTCTTTTACCTACACTAGCAATATACGAAAAGAAGAGAATCCTACACCATAATATGGTTCTGTACAAAAGTCAGACATTCATCTATACAATTAGGGACCTCATGTGTGCTCCAAAAATAAACTAAAGGTGCAGTTCTCCTTCCACCCTTCCTCATTTGCTCCAATCAGGCATTGTGTTAATGCAATGGAAAACTGGTTATTTGATAATGATTGAAAAGGTTAAAGTCAAAATACAGGTTTAAAATAGGGAAAAGTCAATCGAATGAATAAAATGTTTGAGTTAAAGAGTAGTAAATAGTAACATATCATGCCTATGAAAAACAACAACACATGTTGCATGCATTTATATGCTTATGTTGGATATACTCCTTTTGTACACTCAAGTATTAAAGTCCTTAGCATTTAGACTATACAGTTTGTTTTTATCGTTCATTTGGCCTGATTCCGAAGTCTTTTTAATGATGCAAACTTTTGATGGCCTGCATGCTCTACTGTAATTT
SNP_position 1073
allele_1 G
allele_2 A
ASP_primer_S GCGGGCAGTTTTCCATTGCATTAACACAATGCT
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCAGTTTTCCATTGCATTAACACAATGCC
Common_primer CAGTTCTCCTTCCACCCTTCCTCATTT
enzyme Stoffel frag.
dye EvaGreen

Line allele-1 allele-2
AE-P03 G G
LS1934 G G
WCGR112-8 A A

Population Linkage Group Position
LW2010 E_11 38.1
LWA2010 LWA_11 37.957
LWAE2012 E_11 41.528
LWF2_2022 E_11 42.5

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain