+Marker Data: est_sep05k17

Crop eggplant
Population LW2010
Linkage Group E_04
Marker Type SNP
Map Position 44.8
Annotation
Source Name SEP05K17
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class EST-misc
STS_primer_fwd TACTGCCAGAAAACCCCCTTACAA
STS_primer_rev ATCCCCATAGATCACAGCCTCAAG
amplicon_seq TTCTTCAGGTTCTTCTTTCTCTCTTTTTTTGTGAATATATATATATATATATTTTCTAGGGTAATCAGTTTCCTGGATTTACAATTTGTTTTGTAATGTTGATTCACAGTATTAAACTTTTGCTCTTGTTCGAGTGGGTCAAAGTCGTCTGTTTATATGGATTCAAAGTAATTTTGGGGTTGAATTAGGCTCAGATTCTATATCTTTACATGGTCCATCCCTCTCTCTAGTTGGGCATGGGTGTGAAGGGGGTGTTAGACCGGGTTAAAGTTACTACTACATTGATAATGCTCATCTGTTTATATGGACTTGAGCAATCCTCTTCCTGTGAGCTGCCTTTTGGGGTTGAGTTAGGCTCGGGTGGTATATCTTTACAGGTCTATCTCCAATCTTAGGTTAATTTTGACATCAGTGAGGTTAATATTAGACCAAAAGTTCACTTGAGGGCAAAGTTGCTGAATTTAAATCGTACAGCAGCAAATTTGGACATTTTCCCTTTATATAATACAATATGAGTTTTTTGGTATGAGTTGATCATAATCTATGTTAATCTGCTAAGCAATATTGATGGATTCATACAATTTTGTATGTTATGTTAGACACATAATTGGTTGATACCATTTCTTAATGATTTTGTTAGATGTTTAGGAGTTAGTGTAGTGTTTCTTTGACAGAGAAAACTGTACAGTCAATCAAGGAACTTGTACAGTTTGCTTTTGTAATCTGTTTGTTACCTATTACTATTTGAGCACACTTGCTTTGGTCAATTTTCTTGGATAAATGTGTGCCATAAAAAAAAA
SNP_position 199
allele_1 T
allele_2 C
ASP_primer_S GCGGGCTTTGGGGTTGAATTAGGCTCAGATTCT
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCTTTGGGGTTGAATTAGGCTCAGATGCC
Common_primer CCAACTAGAGAGAGGGATGGACCATGT
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I

Line allele-1 allele-2
AE-P03 T T
LS1934 T T
WCGR112-8 C C

Population Linkage Group Position
LW2010 E_04 44.8
LWA2010 LWA_04 46.954
LWAE2012 E_04 46.21
LWF2_2022 E_04 65.5

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain