+Marker Data: SOL7244

Crop eggplant
Population LW2010
Linkage Group E_03
Marker Type SNP
Map Position 89.8
Annotation
Source Name SmFL29D14C
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd GGGCCAGAACACTTGTGCTCTTTA
STS_primer_rev CTCGCTTGAAAGGTTCATGAAAAG
amplicon_seq NNGTATTTGAATTCTTAAAATGATTGCTTTCTTTTCTTATGGAGTTGGTTGCTAAGCTTGGCTTGGCAGACTTTGTTGGGGAAATATCTATTTTGTTATGCTTTCTAGTTAGTGCGTTTGTACTATTGCTTAACATTCTGCCCTTCTTTGCTTTTCCTTTCCTTTTCTGGAGTAGCCTGCGGTATCATCTGCTTCATCCAGACTACTTGTATTTTCGGATAAGGGAATTGCAGAAGAACTATAGACTCCGCATAATTTTGTGCCACGTTGATGTTGTAAGCCCTTTAATAATTTTGACTTCTTCATATTTGCATTGTGACTCTTATACAATAACTTGACTCATGCTCATGGTTGTCTTTGGGTCCAGGAAGATGTTATCAAACCTTTACTTGACGTCACCAGAACTTCTCTCCTTCATGATTGCACTCTGTTATGTGGATGGAGGTACCTCTTATGTTTGAGTAGATTTATTTCACAAAGTGGTATGCTTGCTTAGAAACATCTTGGAACTCCTCTGAGGTGTATCTGCTTTCTTCTATGTCATGACTCATGACCGCACATCATCATCATGCTCTTCCCTGTGCGGCTGTGCCCCATAAGGATTAGTTGAGAAAAGGCAACTCTTTGTTGTTGTTTCTATTGAACATTTGTGTGAGGCAGTTTTTTGCAATCACTGTAAATTGCTTAAATTTTTTAGTTTGGAAGAATGCGGAAGGTACTTGGAGACGGTAAAGGTTTATGAAAATAAGCCCGCCGACCTCATTCAGGGCCAAATGGATGGAGACTACCTATCACGGGTATGTGTGTCAGTTGATTACAGTTTGCAGTGAATTACTTTCTGACTTCGGTGACACAGATTATTTTGTCAGCAACTTGTCTGAAATGAAAATAATCAAAGAACGGACTGTTTTTTCTCTAAGCTCTCTGATGAGCACACTGACATGTGGTTTATTGTTTCCTTGTAGCTGAATCATGCTCTGACAACCATACGACATGTTAATAAAACAGATGTTGTGACTCTTGGCTCAACATTTGGGGTATGAATGAAATTGCAGTGGAATGTTTAGAATCTGTTTGTTTTTCAAGTCAGTTCCTAAGACAGTGACATTCTTTGCAGTCTCTCTCTCATGTAATGGATGCATCTATGGAAGATCTTGCTCGTTGTCCTGGCATAGGAGAGCGCAAGGTATCTTTCCATGTGGTTTATGTTCTCCAATTTGTTTGCTTCTTTTTCTTTTTGTTCTTTTTTGCCCATTGGTTGTATGTTTTTTTAATGGTTTCGTTGGATTAGTCTTTTGATTGGGGCTATGAGAAGGTTACTTGTTTTGTTGCTAGTTGTCGTCTCAAATTATATTGAGGAAGCTCCTGTTTTTCTAGCCATAGGCATCACTATATTATAAAAGCTAGTAGTTTTGTGATGCCAATTAAGGCAATTGTGTCTTGTCTCACTGCGTCTCTGATTGCGTTTTTATCATAGAAGTGCTTCATGACTGGAAGCAGTCTTATAGAGTTAGTCGGGGTTGGCTATAAGCGCTATAAAAATCCTCACTATACATTTTGCTCTGTTTAACCTATTTGTTCCTTATTATAGTTAGGTTCCCTAGCACTACAAGTTCTTAGTATTTTCCATTGACATCTCATACAAGAGAAAGAAAAAGTCAATGAGCTATTTATTAAGATCCTTGAGAGTACTTN
SNP_position 397
allele_1 C
allele_2 T
ASP_primer_S GCGGGCCAATCATGAAGGAGAGAAGTTCTGGTA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCCAATCATGAAGGAGAGAAGTTCTGTTG
Common_primer TTGGGTCCAGGAAGATGTTATCAAACC
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I

Line allele-1 allele-2
AE-P03 T T
LS1934 T T
Nakate Shinkuro T T
WCGR112-8 C C

Population Linkage Group Position
LW2010 E_03 89.8
LWA2010 LWA_03 91.567
LWAE2012 E_03 95.34
LWF2_2022 E_03 100.0

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain