+Marker Data: SOL6038

Crop eggplant
Population LW2010
Linkage Group E_03
Marker Type SNP
Map Position 35.5
Annotation
Source Name SmFL31A11C
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd GAGAAAGCTGTTGGTGAACCCATT
STS_primer_rev TGTCAAAAACCACATTTCACGAGC
amplicon_seq NTATCTTTACCCTCCTCTAGCAATTTATGTGATGTAGTTTCTGTTTGAAACTTGTCGTCTAAAATAAGTCATACATGTTTTAATTGGAATTGTGTCAATCGACTAATANAGAGAGCGTGTCATATAAATTGGCACGGATGAGTAATGTTTATTCATAAGAGATACTCAAACTTGGCCTCAACTTGAGTGTGTATATTTAGACATCTCAACTCGTTTCCACTATGTTAGTTTAACACTCCAACTTACAAAATTCAAGAATGTGAAAATGAGATGTTCTTAGTTNAATTAAGGTGGGAAAGTTAGTAAACTGAAGCTATTTAGCTGAAATCGACTACTTTCTCCGTCCCAATTTATATGACCTTAGTTTGAATAGGCAGAGAGTTCGAAAAAGAAAGTAAGACTTTTGAAAACTTGTAGTTTTTAATATTTCATAATAATTGAAAAATAAATGTCATCACATAAACTGGAACAAAAACAAAGAGAGATGACTAGTATGTGTCTAGTGTATTTGCTCAAATCTTGAGTTTAGCTTAGTCCAACCTAAGCTGTGAGGACTCTTTTTGCGCCTGTAGGATTCTCCAAAAATATACTACTTTTGGAGTATCTGATACGCACCCGTTGACATTTTTGGAGAGTCCGAGCAACATAGAGTGCAAAAACCGTGTCTTTTGCTCCATGGGGGTATATGTGATGCTGGCCTGCGGAGTTGATCTTAACTCACCTATAACAAAAACTTTCAACTATGAAAGGGTGTGTTTTGGTAAGTGCAGGTTTTGAGACTTCGTAAAGACTAAATGGTGGATGATACTGTATTTCTCTGCAATATTATATAAAGCATCTTGCATTAGCTGACCCCTTGAAAAATTCCGATGAACTAATGCCATGGATTAGAGAAGNAAAAATCACATATGATTAAGATGGGCGATTTTCTCAATCATGACCAACAAGCTTAGTTCTTAGTTTTCACTGCATCGCTGTTTNACTATTACCAACTACTCGAGATGGTCTGAATTGATAATGTAAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTNNNNNNNNNNNNNAGAAAAAGGAGNATGTCGAAGTAGTAAATGGAATTNGNTGTGNTCTNGAACTGAGNCCCTTGTGGTGATGGTTTGTAGATATCTTTGTATCATTTGGATATGACACATGCATTGCTCTCAGGAATGACTTGATGCAGGGTACAAAGGCGTTTTGTAGTGGTGGTGATCAGGCATTGAGAAGTAAGGATGGTTATGCCGATTTTGAAAGTTTTGGTCGCCTCAATGTTTTAGATTTACAGGTACGCTGAGTAATCTGTCATGTTCTTTGAAGTCGTTTCAGACAAGTTTTTGCCTGTCATTCCTTGAAACTGATATAACTTTTTGATGTGTCTAGTTCTTAGCATCAGTTGGTGTACTCTTTAAATTTACCTTACTCTTCTTCTTTTCTACATAGGTGCAAATTCGCCGTCTGCCAAAACCAGTAATCGCAATGGTAGGGTTCTCTTTCTTCCTTGTGTTAAAATAAGTGCTTCAAATATGTGTCCTTGTANNTCATGTAATTCAATTATGTTTGAAATATCTCTTTTGCTTTTGTTGCAACTAAGGTTGCAGGTTATGCTGTTGGGGGAGGACACATTTTGCATATGGTTTGTGATTTAACAATTGCAGCAGACAATGCTATATTCGGTCAGACTGGTCCAAAGGTGCTTTTATCAGTTACATCCTGTAGAGCATGTCTTTTAAGTAGTGTTTGGAATAAAGTTATGTTCTATGTTGATCGAATATCTCGCCTTATTTACAGTCTATTATTGTTCTTATTCTATAGCTGCCCTGACTTTTATTGTTATACTCTTGAGGCCCTTTGTGCACAAAGAATCTACATAAAGTTAAATTTGATGTCTCTTGCATATTGCAGGTAGGAAGTTTTGATGCTGGTTATGGAAGTTCAATTATGTCCCGTTTGGTAGGAGTCTTGCTTCTGGTTAAAGATACAATCTATGGTTAACTGATTGATAGTTCTCTTAGNGCAAACTGTNATCTGGTTCCAATTATGTTGGTGCTGTCNNNN
SNP_position 607
allele_1 G
allele_2 A
ASP_primer_S GCGGGCCCAAAAATGTCAACGGGTGCGTATT
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCCCAAAAATGTCAACGGGTGCGTCTC
Common_primer TGCGCCTGTAGGATTCTCCAAAAAT
enzyme Stoffel frag.
dye EvaGreen
Line allele-1 allele-2
AE-P03 A A
LS1934 G G
Nakate Shinkuro A A
WCGR112-8 A A
Population Linkage Group Position
LW2010 E_03 35.5
LWA2010 LWA_03 35.723
LWAE2012 E_03 45.151
LWF2_2022 E_03 34.0
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain