+Marker Data: SOL2105

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_02
Marker Type SNP
Map Position 44.8
Annotation
Source Name SmFL33L20F
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd GACTGTTATCTCCTGTGATTGGC
STS_primer_rev GTTCAACTTGCTCAATGCATTTCC
amplicon_seq NCATGTGACACATATAAAGTTGACATTGACAAGGTAAAAAAGGATTTTCCTGGTGTAATATCTCTTATTCCTTTCAGGAAACTTTATTAGTGTGCCATGGAACCTACTCTTCTGGGGTGCTGATACATGTCAATTGTCTCTTTCTTTTCTTTTTTCTTGGATAAGTTGAAAAAATTTGGTGGTCATATACAAAAGGAAGCTACATCAGACCACTAAGATGTATCATATACTGAAGGACAATATCGGATCGTCTACAATGTAGTGTAGTCATTTGTTTGCCAGATAACAACACATAACAGTGACTTGAGACTCCAGATTGTTGGTACTGTGACTATCCAGATCATCAGCACTGTTTCAATTGTTATCGACAACTAAATCTCTAACCAAAAGCATACTCATTTGCCTCTGCATCCCAACTGGCAAATGAATACCCAATATCCATGGATTCCTGTTTTCACTCGATTTTACTGCCTCTATGATCATAGAGATGCTGTTAACTGTTGTAGTTCCTACTCTCGTTTCAAACAAGCATAACCTCTTCTCTGTTATTTATAGAACCTAGAATCATAACTATCACCTTCTTATTCAGTAAGGTGCCTAGCTCCCCAGCAGTTTCAAGTTACTAAACAACTATTCCTATACCTTCATAACCCAATGAATGTCAATCTCTTAATTCCAACATGTTCCTCTCTCTCCTTTCAGATTTCTGTTTAGTGGCGGGTTTACTATTCTTCCTTTCTTGATATGCAACAAGTGTAACTAGTTGTATTTGGTCTCACTATAATTACTGGGTGGCCTGAAATATTTAGTTGATACCCATAAGCTAATCGTGAGACATTGACTGTCCGGATTCCAATTAATTCAGTGTTGCTTTACTTTGATACATATGTCACGTACAGTTACTCCATGTTTGAGTCTTTTGGTGAATCTTCTGTTATGCCTCATTTATTGAGAAAATACATTGGAATTGGATTAAAAAGTTATAAAAAAAACATTNATACCAGGACTTGGATGGGTTCATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACATTAGACAATGGGAAAAATCAACTGTTAAANCCAAACTGGAGGAACCCTTTTTCTGGACAAGTTAAAATGGAATCCTGAACTACTGGTTTTATTGGCAAAANCAGCTCTTTTTTGTTGGTGCNTAGGTTGCATTGAATTCCAGGATAATATTTGAAAGTTAGGGTGGCTTTAGTGACCCTCATAATGATCTGTAGCATATCTACGTCATTAAAGTTGTAGGCTCATAGTCAGCAGTAAGTCATATCTACCTGATCTTATTTGATGTCAGAAATCCCCCCTGAGATGGAACCTGTTATTGGCACTGTAGGATGTTTGTTGTTAATCCTAGGTTCTGCTTCTTGTTTATAATGCCAGTCAAACAATTGGCTCCAGGTCTTATTCTTGTGAATGTTGATTTTATTTTGATATGCTGGCGGGTTGAATTGCTGAAATAATGCTTGTCATTTTCTATATTAAAAACTTTCACCTAAAGGAAAAGAGAGTGTTCTTTGTTTGAATAATTGAGGTATCTTGGAGCTATACCTTTCCCTTGGATATGTTTATATGTTCTGGTTGGACATTTATGAGTTTATATGCCGGTAGCAATTGAAGTACTTTTAATACGTTTAGCTTGGACATTATGAGTTTGTCTGCAGATAATAATTGAAGTACTCTTAATATGTTTAATTTGGACATGAGTTTATCAGCTGCATATAGCAAGTGATGAATTTATTCTCACAATTTGACAAAAAGGAAGATTGAGAGAAAGACATCATGTCTAATTCCTTAAATTTGTGGGTTTGACTTTTGATGAAAGATGAAGTCTATGCTGTGTTCTAGTTCGAACACTTTTTGTTAATATCTTATGATGCTTAATTTTGTTAATTTTTAGCCATTAGTTTCAAAAATTCCTTAGGGATTAATTTCTGTAATTCCTTAGGACTCTCGGTGCATTTTGTTTCTCCAGTTTAGTGGTTGATCCACTTGCATTCAATTAATCTTATCCACTTGTATGCTGAGCATGTNNNNNNNNNNNNNNNN
SNP_position 856
allele_1 A
allele_2 G
ASP_primer_S GCGGGCGTGAGACATTGACTGTCCGGATTCCAA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCGTGAGACATTGACTGTCCGGATTCAAG
Common_primer CGTGACATATGTATCAAAGTAAAGCAACA
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I
Line allele-1 allele-2
AE-P03 G G
LS1934 A A
Nakate Shinkuro G G
WCGR112-8 G G
Population Linkage Group Position
AL2010 E_02 44.8
ALF2 AL02 46.2
LW2010 E_02 37.2
LWA2010 LWA_02 36.617
LWAE2012 E_02 37.87
LWF2_2022 E_02 56.9
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain