+Marker Data: SOL8552

Crop eggplant
Population LWA2010
Linkage Group LWA_11
Marker Type SNP
Map Position 9.465
Annotation
Source Name PED03A02C
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method DirectSeq
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd GGTGGTTATGGTGATGCAAGTCAG
STS_primer_rev GCATGTGCACGTAATTCTTCAAGC
amplicon_seq NNNNGGTTGTTTTGATAGGTGATTCAGCTGTGGGGAAATCTCAAATACTAGCTCGTTTTGCAAGAAATGAGTTTAGTCTTGATTCTAAAGCTACAATTGGTGTTGAGTTCCAGACAAGAACACTTGTTATTCAACGAAAGTCTGTTAAAGCTCAGATCTGGGATACTGCTGGACAAGAAAGGTAAAATGGGGTTTTTCTTTTTTGCTCAAAATTGAATCTTTTGTTAAGTTTGATTGGTTTGATGTAAGTGTTGTTAGAGTACATAAGTTTTTGATGATTAGAAATGAATTGAGGAAATGAGGTTTTTCTTTTTTGCTCAAAGTTGAATCTTTTGTTGGTTTTGATTGGTTTGATGTAAGTTTTGTTGAAGTACATGAGTTTTTGATGATTAGAAATGAATTGAGGAAATGGGGGTTTTCTTTTTTGCTCAAAATTGTATCTTTTGTTAAGTTTGATTGGTTTGATGTAAGTATTGTTAAAGTACATAAGTTTTTGATGATTAGAAATGAATTGAGGAAATGGGGTTTTAAAGAAACCCTNAGGGGTTGGTTTGGTAGTAATAGACTTGAGCCTTGGGGTTTGCTCCCTTTCAAGGTCTCAAGATCGAAACTCATTGGGTGCAAATAATTTCTGAGGGCCATCGGACTGGGTAAAACCTGAATTAACGCGGTGCACTTGCAGAAAACTTCTTGCCGAGGGCCTGTGCACCCCCGGGATTAGTCGAGTCTCTAAGAGACTCGGACACCTGGTGCAAATAAAAAAAAGGGTTTTAAAGAAAAAAGTTGTGATGGTTCTTTGCTGAAAAAGATTGAATCTTTTTAGNTTTCTTGCTTTGCTATTAGTGTTGTTTAAGTCCACAGCTTTTTGATGATTAGANNNGATTAAATGAATTAAAGAAAGGGGTGTTTAAAGAAAANNGTTGTGATGGNTTCTTTGCTTTAAAAAANTTGAATCTTTTTAGTTTTCTTGTTTTGCTATAAGTATTGTTAAGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGCANGAAAGTCCGNAAATATATCTCTATGAGNTANTGNTAAGNTCTGCGTACATTTNACNTCNGCANACCCNACTNGTCGGATTTCACAGGATATGTTGTTATAGAATGCAAGAAAGGGAATACAATTTTTTTNCACTTGTAATGGTTTTTTTTTNGGGCTAAAAAATTGGTTCTTTTTAGTTCTCTTGCGTTGAATTATTGTTAAAGTCACAACTTTAGATCTGCTGTTAGTGCCATTGAAATGCAATAAAGACATAAGGAGTACATTTTTGGGGGTAGTTTTAAGTTGAGAAGTTTAATGAATTGTGTGTTTGTGTTATTTAATGCTGTTTTCTTGCTTTGATCTGCCCTTTCTTGGTTTTTTGCTCTATGTTTGAAGCTGCTGATATCATAAAAGATACTATTTAGTAATGTGTTTGCTATATTAGCAAAACCGTATAGCAAGCTTGCCTTTGCTATCATTTTTTGTTGAATCACCTGAGTAAAAGCTTGATATTGGTGATCTCGTAAATTGAACTCATATACATGCTTATCAGATATTCAGAATTGTCCCTCTTACTGTAGAACTGAGTAATGCCCAAGTGCAGTGGTGCACGGTTTGAAACTCGGTTGGGAATGGATCCGCCCCTCTACACTTCGTTGGGTTTGAACCGTTAATGTGTGGTAACCCACACATTCCTGCTGAGCTCTTAACACTCCTGCAGGCGGCAAGTTGTGTTAATTTGTTTGCTTCCAGTCACTTCAGCTCTTTCTTAGCTAAGATCTTAAGGGGTGGGTCATGTTGAATTTTCTGTCAGCTTTTCTGTGCTCGGTTCACCTAAGACATTCCAAAAATCCCTTTTAGATCAGAGTCTATACAGCTTATATGTCACTTAATCATTGATTTGTTGTCATGAACAGATATAGAGCTGTCACGAGTGCGTACTACAGGGGAGCTGTTGGAGCTCTGTTGGTTTACGACATAACAAAGCGTCAAACCTNN
SNP_position 669
allele_1 C
allele_2 T
Line allele-1 allele-2
AE-P03 T T
LS1934 T T
Nakate Shinkuro T T
WCGR112-8 C C
Population Linkage Group Position
LW2010 E_11 9.5
LWA2010 LWA_11 9.465
LWAE2012 E_11 14.979
LWF2_2022 E_11 12.0
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain