+Marker Data: est_ovs05n01

Crop eggplant
Population LWA2010
Linkage Group LWA_04
Marker Type SNP
Map Position 12.41
Annotation
Source Name OVS05N01
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class EST-misc
STS_primer_fwd taccatagacgatccggcaagttt
STS_primer_rev acttgatccaatgtctcagcaagc
amplicon_seq TTATACCCGCCCGTTTTGCTTCTTCNAGGTTTCCAGGGAAACCGCTTGTTCAGATAATTGGCAAACCCATGATCCAGGTACTTACTTACTTTATATAGCTAGCTGCATGTGTTTCAATTCGAATTATTATGTTTAATTGAGAAGAATTTTGAAATGTTTATAACTACTTTGATTTGAGGCACTTGTGGGATTTGATTTCACTGGATTTGTTGTTCTTGTTGTGTGTGGAACTAGGTAGAAAGTATGTTGAACTTAGTGATCTCAAAATTGTAGATGATTAGATCCGGAAGAAGTAGAGTTAAGATTTATGGGTTTTGATATTGTATTTGTTTTATGATGTTTGATATCCTTTACTTGAGCCGAGGGTTTATTAGAAATAGTATATCTACCTTCTGGGGTAGGGGTAAGATTGCACTTGTGGGATTAATGTTGTTGTTATTGGGTTATGGAATTTTCACTTTAATTAATGGGTTCATAAATAAATATCCTTGAGAAGCCGATGATTTAGGTACTTCTATAGCTGCATGGCCTTAAATTCGAATTATATTTGGTTATGATGAATTTTGAAATGTTTATATTTGTATTGAGTCTGAAAAAGAGTATTTTCTCTATTTACGAGTGGAAGTAGCAATAGATTCCTCAAATTCTAGNTGATTAGATTCAGATTCCACCTTGGGCAGAGGTAAAGTCAGGATTTTAAGTTTATGAGTTATGAAATTGTCACTTTAATTAATGGTTCACAAGTAAATATGCACGGAAAGTCCATGATCCAGTACGTATGTCTACAGCTGCATGACCTTCAGTTTTNGAACTAGATAGAGAACTTGAAATGTTTATATTTNGTATTGAGACTGAAAATATAGTAGCAGTAGTATTTTTCTCNNNNNNNAGATTTCTGCNTATAAAAAGAAATGGAACATTGAGGAAATGNTCTGATTTTAATCAACTGAACCNATGAGGATTTCTGAGTTTAAAAAAGGAAAGGAAAGTAACATAAAGAAATTTATTCTGATTTTAAGGCCTGTATGTCCAACAGAGATAAAGTTTCACAAATTGCTTCGTAAGAGTTTCTGATAATATTCTTAGTTCTCATGCTTGCTCTGATCTTTGGTAGAGACCTGTGAACCTTAGTAGTTTTCGTGAATATTCATGATTCTAGTGGTATAGCAGAAATGGACTTTTCCCTTTTATACGGATAGCAAGATGTTCTGCTATAGTCAACAGGGTAGCATTACTTAAGTATCAGGGCACTTGGATAAAACTAGGCAGTAATTTGTCTAGTGAAAAAAGAATACTGAGCAAACTACTAAATGCCTGATGAAGCATAGGGTGCAAAATCAATGTTACAACAGAAACATCTCATTTCACATGAATAGGGGGGGAATGATGTTGGTCCTGTTTAATTATAGGTTTGCTTTGAAAACTTAAAATAACGGATCTGTTATCATCAGGAATAAAACTTCTAGATCCATTTATTGTTCTCGGGTGGTGCTTCCCCTTCCGGCAATATCAAGATCCAAAAAATCTGGACCAACTTCAAGCTACTCAGAGGGTTCTAACTTTTGGAAATTTGCTTGCCTTATTCCTGCTATTTCTCATGTTTTCCGTTTATCCATGGTGAAGCGTTGATCAAAAACATCATAATGTCACAATTGTATTTGCTAAAAGAACCTGACACCCTCGCCATATTCGAATCTGATGGCAGAG
SNP_position 240
allele_1 A
allele_2 G
ASP_primer_S GCGGGCTTGTGAGTGGAACTAGGTAGAA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCTTGTGAGTGGAACTAGGTATAG
Common_primer TCTTCCGGATCTAATCATCTACAATTT
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I
Line allele-1 allele-2
AE-P03 A A
LS1934 A A
Nakate Shinkuro A A
WCGR112-8 G G
Population Linkage Group Position
LW2010 E_04 10.7
LWA2010 LWA_04 12.41
LWAE2012 E_04 12.459
LWF2_2022 E_04 12.8
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain