+Marker Data: SOL4073

Crop eggplant
Population LWA2010
Linkage Group LWA_04
Marker Type SNP
Map Position 1.765
Annotation
Source Name CHX03F02C
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd CTGCTGACGCATGCAAGACTTTT
STS_primer_rev CAAGGAATTTCTGAACCCCATCTG
amplicon_seq CTTAGGTAGAAATAAAAATAAAAATAAAAAAATATATCGTCAAATATTTTTAATTTGTTGTATCCGATAATCTGTACAAACAATAATAACATACCCAGTGAAATCTCACAAGTAGGGTCTGAGGAGGGTAGAATGTACGCAGACCTTACTACTAGCTCATAGAAGTAGAGAGGCTGTTTCCTGGATATTGTATCCGATAATTTGTGTTTTTTTAATATTTTTGAAAGTCTAAATAAGTTTGTAAAAAAGGAAACAAATTCAAAGGAGTGGATAAAGGATAAATTAGTAAAATTACTCATTTTACTTATGATTTTTTATTAGTCGTATTTTTATATCATGTGTTGGCATTATCTGTCTTGTATTTGTTACTTTTATCGTTGTTTTCCTTTTTTTCGGTTTGGTTTTGAGATGAGAATTTTCTGAAAACACTCTCTATCTCTATGAGGTAATAGTAAGCTCTGCGTGCATCTTACTCTTCCCTGACCTCACTTGTAAAAAATTATAATCAAGAAGAATAAGGATAATTTTTCTGAGATAATAGTTAGTAGTTATAACAAATAATGTGTCTTTATTTAATATTTTTCGAAAGCTTAAACAAATCAACAACAACAACAACATACTCTGTGAAATTTCACAAGTGAAGTCTGAAGAGGGTCAGATGTACGCAGATTTTATCACTACCTCATAGAGATAGAGAGGCTATTTCCGAAAGCTTAAACAAGTTTATAAATAGAGAATTTTGATATTATGTATAGATGGTGTAAAAAAAAAACTCTACATAATTATAATTATGTTACTTAAATAGCTTTATTTAATACACTAATTATATATTTTTTTAAAAATCTATTTCAGGAGGGGTACAACAAGGAGTTTGAAGAGAAGAAAACTGAGCTTCAACCAAAAGTTGTTGAAATTTATGAAGCTGCTGCAGTTGAGATCAAGGTTTTTATACACTTCATTTATTTATTTATATTTCAATATGATGGAAAATTTAACATAAATTTTTCCCTTTTCAAAATAAGTGTTGTTTTAGTTTTAGAAAAATTCAAAATAAGTGTTTAATTACTCTTTTCGTTCAATTTTACTCGTTTACTTTGACTTTGCATGTCTCTTAGGGCATTCTACCATGATATTCATATTGATTGATTTATAGACTTAAATATTGAAAAATGATTTGAGGAATAAATAATTAATATTGAAGGTTAAAAAAATTATTTTTTTGATATGTTAAAAATAACAAGTAACAAGTTATTTTTAGATCCCGTAGCAATAAAAATTTAGTGCACTAAACTGCATTTTTATTATGATGAAAAAAATATATACAGAATATAGTGAAGAACCAAAGGGTGCAGATTAAG
SNP_position 326
allele_1 A
allele_2 G
ASP_primer_S GCGGGCTTTACTTATGATTTTTTATTAGTCGTA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCTTTACTTATGATTTTTTATTAGTCGTG
Common_primer ACAAGACAGATAATGCCAACACATGAT
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I

Line allele-1 allele-2
AE-P03 A A
LS1934 A A
WCGR112-8 G G

Population Linkage Group Position
LW2010 E_04 0.0
LWA2010 LWA_04 1.765
LWAE2012 E_04 1.48
LWF2_2022 E_04 0.0

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain