+Marker Data: est_yfr05c16

Crop eggplant
Population LWA2010
Linkage Group LWA_04
Marker Type SNP
Map Position 5.064
Annotation
Source Name YFR05C16
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method DirectSeq
Marker_Class EST-misc
STS_primer_fwd ctttcttcgggagctcattaccaa
STS_primer_rev ttctcaacccaaagagagattggg
amplicon_seq CTCTTTTTTTATTTGATGATCTGTATTTGTATTTCCGAGAAAGCTGGTTTGTGCTGATGCTGCTCATAGGTTAGATGTGTGATTGTTTGATTTCAGGTTCTATGTAGTTGATTCCCCGCTCAAATGTTGGAAGCATGATTATTTGTGTTCTTTTGGTAGTTGTTCTATAGCGGGAAGTCTCTTATTGTTGATTCAGGTCATAGGTTCGGACTTAGGTGTGTTGTTATTTGTGATTTGATGTTATTTGTTTGATAATTGGTTATATTTGTGATCTACCTTCATAGGCTGGAAGCGCAATTATTTGCGATTCAGTGATGTTATTTGTTTGATAATTGTTCATATTCCTGATTATATGCTCATTCACTGTTAGTATGATTGTTTGTGAGTTACTGTTAGAGGTTTTATTGTGGATGCTCTTTAGAGTTGGTTCTGCTCATATGTTGGAAGCATGATTGTTTGTGATGTGATGATTTTGATCGGGGGTGCTCTATATAGTTGATCCCGTTCATATGTATGCATGATTGTTTGTTAGTTTAATGTTACTGGTTTGAAGGAACAGCAGCATCGGACTCACTTGATGCTAACTTGGTGAGCTAAGCTATTCCCTGTGTTGTTGAGTTATTGTTTTAATCTGTTAACTAGATTGTTTGTTGGTTnnnnnCGTATAATATGGGCTAGTCATTCATGTGTAATGTTTCAAATATATGAGATGTCTGATTATGTTGTGGTTATATGTTGAAGGCTTTGGACAAGATCCGCTTTGAGAGCTTGACAGACAAGAGCAAGCTAGATGCTCAACCTGAACTCTTTATCCACATTATTCCTGACAAGACCAACAATACCTTGACTATCGTTGACAGTGGTATTGGGATGACCAAGGCTGGTAAGTTAGATCATTTGTAGGAATTATTTGGAGCTGAAATTCCATTATTGCTGTAATACTCATCTCATTTGTATTATTGCAGATCTTGTGAACAACCTTGGTACAATTGCAAGGTCAGGGACTAAGGAATTTATGGAAGCTATAGCAGCTGGTGCGGATGTTAGCATGATCGGGCAATTTGGTGTTGGTTTCTATTCAGCTTACTTGGTGGCTGAGAAGGTTGTTGTGACTACAAAGCACAATGATGATGAACAGTATGTGTGGGAGTCTCAAGCTGGTGGTTCATTCACCGTCACCAGGGACACTTCTGGCGAGAGCCTTGGTAGGGGTACAAAAATGACCTTGTATT
SNP_position 335
allele_1 G
allele_2 A
Line allele-1 allele-2
AE-P03 A A
LS1934 A A
Nakate Shinkuro G G
WCGR112-8 G G
Population Linkage Group Position
LW2010 E_04 3.3
LWA2010 LWA_04 5.064
LWAE2012 E_04 4.491
LWF2_2022 E_04 4.1
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain