+Marker Data: SOL5164

Crop eggplant
Population LWA2010
Linkage Group LWA_03
Marker Type indel
Map Position 76.227
Annotation
Source Name PER07D11A
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method indel
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd ACTTTTCCAACAGGCTGGTGTTGT
STS_primer_rev TTTCTTCAGCAGCATTTACCCTGA
amplicon_seq NACTGTCNACTGTNGTTCGCAGATTTACTGGGNNGGGAAGATGCTGAGGACAGCTTTATGTATCACGGAATTGAATCTTGTTTTTGCAGGTCATTTACAATAGGGAAACTGATAGGAGTCGTGGATTTGGGTTTGTCACGATGAGCACTGTGGAAGAAGCTGACAAAGCTGCTGTACTGTACAACCGTTATGTGAGTTACATTCGTTATTTTTCTTTGATGGATTTGTGGCTATGGTTTATTATTTTGATTGATCTTATGAAATCCATTTTAAGGCAAAAGAATATTTATGTTGGATTGTTGAATTTTGCTGTCAAAAGCTGGACTTGAAGATGCTTTCTTTTTGTTGCTGGAAATAATAACCCCTCCCCATTTTGTCTGGCAGGTATTGCTACTAAGAGATAATGTAGGTTAACTCTATATTTGTATATTCAGTAGAGGCTCAAGAATCCGTTTGCCTCTAAATTGTTTTGATTCTCTATTGTACACTGTGAGGAAATCCTCTTTTTACTTAATCAAATTGTTTATACATTTTGATGAGACTTAAATATCCAGGTAAAGGTTCATGAAACAAGTAAATTCAGTTGAAGGTAACTTTTTGAAAGGAAGGATGATTTTGATATCCATCCATTAAGGTTGTGAAAAATTGCTGTTCATGATTTTATGACACTATCTTCATCAGTAAAATTATTCTTTGTGGCAGTTAACTTATACATGACCAGAAGTAACAACATTCTGAGCTCACTACTGAAGGAAGGATGCTGAGCTTGTTGGCTGAAATGCTTCCTTTGCTTCTTCTTATGTTGATAGCATGTTAGAGAGTTTTCACTCTTGATTGGCAATCTATCCCTAACTAGTTTGGGTAGGCATAGTTGGTTGATTAATATTTTGTCCCTATCATGAGGCCGTTCCNTCNGGATAGGGAGATGGTAAAGGGCTTCAATAGTAGCTGTGAAGCATGAGAGTACGACTGTCTTCTGCAGTGTCATCATCCCNCCCATGAATGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCTAGGTTTTCAAATATGGGAGTAGGTGCATTATAAACCTGTATTCATAAATTGGTATCTTATAGATAATTTCTATGGCAGGAGACCAAGTNTAAATTGGTAAGTTGGTGGTATCTTGATGTACCAATGATGTTTAGGTTCACTATCATCCCACCCCTGGCAAAAACAAAAAATGAAAAAAAGAGAGAAGAAAATTAAGACATCTAAGAGTCTAAATGAGATTAATACACTGGTATCATTTGTTTACTGCATCACTTGAAATAAACTGTACTGATTTTGCATTAGTGTTGAGTGTTTGGTTGTTATTTATAGTTCCCCCAGTAGTTATGAGCTGCTTACACCCATCTTTCCAAGTACGTTTTTATTTGTTAACGGAACATATGTCAAAGCATAAAATGACTAAAATAATTGTTATAGTATTACTTGCTTAGTTAAACTATTTCTTGTCATCTCATATTAGTTTCTAATAATTCTTGTAATACACTGTATTGCTTTTAAAATTAGAAGAAAGCAATTCTTCAACTCTGAGTGAAGTTTAAGTCTTTAACTATAGCTAACCTGGTGAGCCTTACTTCAAGATAAAGCTGAACTTTACTTTGGGTTGGCGTTCTTTCTTCGGAAAGAGAAGTTGCTCGCCTTACTATGCCAACCATCTTAGGGGTGGTTGTTTTGGCTATGAAAGCTAGCAAAGGAATATTATATATAGATAAGAGATGGTGGACAACATCTGGGTTGATATATTGGAATTTTGATATGATTAATTAATATGATAAGAAATGCAGATATAGAATGATGATTATCAAGTTTATTATATTTTAAGTATTGTGATTCCTGATGTGACTTGTTCACGCAACAAATGAACTCTCTTTATATTGTCTGCTTTATACAAATGTTGAACGGTTGGTTAGTTGGTTCATGGTTGATATTCTCATCGATGGATTCATGTTTGCCATATATTTTCTTCTCAAGATATTTGATCTTGAGGCTAATTGTTTCT
indel__position 329
Indel_primer_fwd GTTGCTGTCAAAAGCTGGACTTG
Indel_primer_rev ACTACCTGCCAGACAAAATGGG
Line allele-1 allele-2
AE-P03 wt wt
LS1934 wt wt
Nakate Shinkuro wt wt
WCGR112-8 DEL24 DEL24
Population Linkage Group Position
LW2010 E_03 75.1
LWA2010 LWA_03 76.227
LWAE2012 E_03 82.483
LWF2_2022 E_03 80.0
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain