+Marker Data: SOL4139

Crop eggplant
Population NAF2
Linkage Group NA06
Marker Type SNP
Map Position 84.1
Annotation
Source Name SEP04G11C
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd GGAAGTAGTTTGATTGGTGCTGCC
STS_primer_rev AAAAGCCCAAGTGCACTACCAAAA
amplicon_seq ACATCGGATCGTCCAGATTTGATTAGGTAATTTGCTTCCCCTTTTCCATTTTCAATTACTGCAGCGTGAATTAGAAGAGTGATACAAACATAAATTGCTAATTTTATGCATTTCTTTTTTGTTTGCCATAGAATGGAATATAAATATGTGTATTAGGCTTTTAGCTAATTATTGACCTTGGTCTCAATCTTTGCATAATAATCCTCTTTATTATGATCCAATGCTAATAATTCATGTATGTTTCAAGGGCATAGCGATTCTGTATAACTAGTTCGTGAACCAAAAAGACCCTTGAAGAATAGTTTAAGCCAATGTTACCGTGCATGTTAAAGTTTATAACATAGATTGATATTTGGGTTCAAGTCAGAGTAGTTTCTCATAGATGTATTGCTTGTGCGAGATGATAAGTTGAATCAAACTTAGGCAGACCATGGATGTGGAACTTTCTAAAATTGTGTTGTTTTACCTTACCCTTTACTTGCCTTGCTCTATATTTTCATTTCAGAAAATTTATAAAGGTTGTATTTGTTCTAATGGAGTGATGGTAGTTTGGTTCAGAACTGTGAGCTTAATTAGTCAGTGTGTTCTATCGTTAATATCGGTCTGTTTTGCAAATAGTAATCACTTCGTGCTTTGTCAGCCAATGATACATGAGTTTGACAAACTAAAAAAGTGGTGATTGCATTGTTTCTTTTTTAACCTAATAAAAATTTTGCCATGATTGCATA
SNP_position 451
allele_1 A
allele_2 C
ASP_primer_S GCGGGCCAGACCATGGATGTGGAACTTTCTAAA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCCAGACCATGGATGTGGAACTTTCTCAC
Common_primer GCAAGGCAAGTAAAGGGTAAGGTAAAACA
enzyme Stoffel frag.
dye EvaGreen

Line allele-1 allele-2
AE-P03 A A
LS1934 A A
WCGR112-8 C C

Population Linkage Group Position
LW2010 E_06 74.4
LWA2010 LWA_06 72.168
LWAE2012 E_06 77.36
LWF2_2022 E_06 88.3
NAF2 NA06 84.1

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain