+Marker Data: est_ovs06m14

Crop eggplant
Population ALF2
Linkage Group AL01
Marker Type SNP
Map Position 115.6
Annotation
Source Name OVS06M14
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class EST-misc
STS_primer_fwd TTCAGTTTTGGCAGATGATGTCGT
STS_primer_rev GGCTTCAACAGATCGTGCACCT
amplicon_seq TTGCGAGACTTCGAGAGGAGTCGGTCAGATCGCGCCGCTCTCGTTGAGTTCTACGCTCCTTGGTTCGTATACCTCTGTGATTTTACTTTTTTATTTTACCAATTATCCGGCTATATTATCTTCTTCTGATTCAGAAATTTGCGAATTTAGATGGATGCAGTGGATTGTGAATGCTTAAATCTGTTAACGAAGCGCTGAATGTGTTTTCAGTAATTAGATCTGTGATTGCTTTGATATATGATGGTGTGATCTAGATTTGATTTACAACAGACAAGCTGTAGAAATTGCTTCTTGATATAATCGATTTGATTAGTTTGTTAGTTTCCTAGAGTTGTTTTAGTTCTTTTGATCGTTTAGTTGTAATGCTTAGCCGCAAATAATTTAAGTTTAGTGTTTCCTTAGGCATTTAGACGTTAGAGTTAGTGATTATTGGATTCTAACGATGTGTTATTTGCTATTGTAATTATAGATACTATTATTGCAAAATATTGGTCATAAACTGATATCTTAGGATTGCATATTGGATTGATCTGAGTTTAGTGTTACATGGGTACAAACCTTGCTTTTATATGTGGAGTCCTGGTTGGCTTTTAATAATTGAGATGGGCGATTGCTAAATATGTAAGGTTGTTGGGAGATCGAATATTTCTATGCTATGATGTGGACTAATTGGGTTCATAATATGGGCCATGGGCAGGTGTGGGCA
SNP_position 579
allele_1 C
allele_2 T
ASP_primer_S GCGGGCCATCTCAATTATTAAAAGCCAACCAGA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCCATCTCAATTATTAAAAGCCAACCCGG
Common_primer TGGGTACAAACCTTGCTTTTATATGTGGA
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I

Line allele-1 allele-2
AE-P03 C C
LS1934 C C
WCGR112-8 T T

Population Linkage Group Position
ALF2 AL01 115.6
LW2010 E_01 132.9
LWA2010 LWA_01 110.764
LWAE2012 E_01 110.598
LWF2_2022 E_01 41.3
NAF2 NA01 105.9

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain