+Marker Data: TC6901

Crop pepper
Population KL-DH
Linkage Group KL12
Marker Type SNP
Map Position 169.11
Annotation
Source Name
Source Type CaGI.release_2
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
typing_method Tm-Shift
Marker_Class misc_cDNA
STS_primer_fwd aagaatcggcaagcaaccaatatc
STS_primer_rev atgggtctggaggtctccattttc
amplicon_seq ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNGATTTTTTTTAANNNNNNNNNNNNNNATNNNNNNNTATTGAGTATCTTTNAAAAGAAGTGTNNNCCTAATTTTATCCGTGTATCATTTATTGTTTTCCCTAACTTGAAANNGGTCCAAGCTAGCCGTTAACTAGTCGTCCTAGAGTTTTAGGACCTTTAATATGAAANGAATTTTTCGCTATACTAGCCATGAAGCATGTGGTTTCTGGTACTAGTTTATAGATGAGTTTGTCGAATCCTGAGGGATACACCTATACGGTTAAATATCCTCAAGGATAGCGTCATGGACACGCCTCAAGCTAGAAGAAGTTCAGTGATTGCCAACATTTAGGCTTTCATAAGCTTTTAGCTTATCACTTACGAATCTTCATTTTACATGACTCTGATGGTCGTTATCAGTTTTACATATCTTCTGATTACAAAGGTATGATCTCGAAAACCATAATGTGTTTCTTACACCATCAGCTCTAGTTTCAACTTCTTGATGCATCTCGAACACTTCGGCCATTACCGTTGTGGAATTCAATTTTAATGACAACGTAGACGCATATATTTTGGTGTTTACTCTGAAGATGCTCTTTTTTTTGCTTCAAACTCNCCAGGACTCTCACCGATAACATGGTGGTCGGTGTCTCCAAAGGGTTCGAGAAGAAACTTCAATTGATAGGTGTTGGATATCGTGCAACGCTCGAAGGAAAAGACATAGTTCTCAATCTTGGATTTTCACATCCAGTTAGGATGGAAATTCCTGCTGGACTGCAAGCTAAGGTTGAAGAAAACACCAGAATCACTGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
SNP_position 1235
allele_1 A
allele_2 T
ASP_primer_S GCGGGCCAGTGATTGCCAACATTTAGGCTTTCT
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCCAGTGATTGCCAACATTTAGGCTTTCA
common_primer CCATCAGAGTCATGTAAAATGAAGATTCG
enzyme Stoffel frag.
dye EvaGreen
Line allele-1 allele-2
Population Linkage Group Position
KL-DH KL12 169.11
KL-DH_2024 KL12 169.11
KL-DH_2024_R2 KL12 169.11
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain