+Marker Data: TC4554

Crop pepper
Population KL-DH
Linkage Group KL11
Marker Type SNP
Map Position 153.06
Annotation
Source Name
Source Type CaGI.release_2
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
typing_method Tm-Shift
Marker_Class misc_cDNA
STS_primer_fwd gccaatctttgaccctttatgctg
STS_primer_rev ccagtggtaaggctgagttcatgg
amplicon_seq NTGGCGCTACTAAGAAAGTTGTTGNNNTCCTTAAGGGAAATTCTAATGTTGAGGGGGTTGTCGCTCTATCTCGAGATGATGATGGTTGTTTGCTTTTCTGCTGTTTTCTGCTTTAATTTGCTTCATATTTGTGAATTTGACTTGAAGATGTAATCTTGATTACTAATGGTGCATACCCTTTTAGCTGAATCTTTATTTGCTTGCATTTCTACCCCTTTATCTGAATCTTTATTACTAATGTTTCATAGCCTGTTATCTGATTTCCTTTTTCTGTTTGCATTTCCAACTTTTTGTGCTCTATTGTCTCATTTGAATTGCGAACTTAAGAGTCTAAATGGTAATGTTTATTAGGTATGTTTTATACCCTTTAAGCTGTCACTTCTCGCAAGCCCCTCGCTGTTGNTGCTGCTACTAAGAAAGCCTGTCCTTAAGGGCAATCGTTCAGGGTGTTGTCACTCTATCTTAAGATAATGATGGTTGTTTACTTTTCTGCTTTTTATGCTTTAGTTTGCTGTGTTTTTTTGGGGTCATATTGTGGATTCTGACTTAAAGATGTAATCTTTATTACTAATGTTTTATCTGAATCTTTATCTATTTTTGTTTCCANCTTTTTGTGCTCTAATTTGCTCTTCGATTGTCATATTTGTGATTGTGGCCTAAACATGTAAGCCTTTCCAAGTATNCTTCACTCCCTTTTATCCGAGTCTTTATCTGTTTGCATTTCCACCCTTTATGCTCTAATTTGCTTTTCTGTNATCAANTTTGTGGGTNGTGACCAAAANGATATAAGCCTTTNCGAAGCANTATTTCANCTCCCNTTTTATCTGAATCTTNATNNGTTNATTNGTCCGCCCTTTATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNTATGCTTNGGCTTGTGTGCGTCGTGTGTAGCATGAATATGGTGACACTACAAATGGGTGTATGTCTACAGGTTAGCTTCTGATTTAGTTTGAACTTTCTGTTAATTGGAATGTTGGTCAATTGGAACTCCTCTAGTAATATACCAAAACATTTTTCGGAACTCTTCTAGTAGCTAGTTGGAAATGACGTTTTTACTTCTAGTTCCGCTGGTACTAGGTTGAAATTTGTTCCCTTTTGTTNCACTGCAGGAGCCCATTTCAATCCTAATAATTTGACACATGGAGCTCCTGGAGACGAAATCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATAACAGCCAATGCCGATGGTAATGTACTTGTTTTCTATTCTTTCATACCGCATTGACTCTATTTTTGTTTGTTTAGATGGATGATGACTTTCTGTATNCTTGCGTATGCTTACTGTATGCAGGCGTGGCTGAANCAACAATTATTGNTAATCAGGTTGTTACATCCACCTTGTCTGGTCATTCGATCTCNCTTTTTGTGCTCTATGTTTGTTACTGTTTTAAGTTTAGGATAATTTACTGACTCTACCTTTTGTGCACCAAGTAGATACCATTGACGGGTCCAAACTCAGTTGTTGGAAGAGCACTTGTAGTTCACGAGCTTGAGGATGACCTCGGAAAGGGTAAAAGTTCTACATTTCGTATATTGATCCATTTAATCTGTGGATTTGAAAATGTTACTTCTGCGAGTGTATCAAATCTATTTGCTACACTGCTTTACTTACCTTTACATTTTGGGAGGTCTTNGCGGTGCCTNCATGAGCTAATCGTCNN
SNP_position 1360
allele_1 A
allele_2 G
ASP_primer_S GCGGGCCTTACTGTATGCAGGCGTGGCTGAAA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCCTTACTGTATGCAGGCGTGGCTGAAG
common_primer TCGAATGACCAGACAAGGTGGATGTA
enzyme Stoffel frag.
dye EvaGreen
Line allele-1 allele-2
Population Linkage Group Position
KL-DH KL11 153.06
KL-DH_2024 KL11 171.11
KL-DH_2024_R2 KL11 171.11
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain