+Marker Data: TC5406

Crop pepper
Population KL-DH
Linkage Group KL12
Marker Type SNP
Map Position 167.31
Annotation
Source Name
Source Type CaGI.release_2
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

typing_method Tm-Shift
Marker_Class misc_cDNA
STS_primer_fwd tttccccagagagtggcataccta
STS_primer_rev gctcctttgcaaaatcctcatctc
amplicon_seq NNTTCAGGAGTTGAACAAAATTCAACCAAGTACTAGCAGTTGCAATGATTGCTGCTAATGGAGTTTCTGAATGTATCCACTAATGATATTTGCTTGCAGGAAGGTTCTCCAAAGATCAGGCAAGGACTATACCATCCTCTTGGTCCTTCCGTCGGGTATATATCATTACAAATTCATTGTGGATGGAGAAGTTAGATATATTCCAGAACTTCCATGTGTAGCAGATGAGACAGGCATCGTCTTTAATCTTCTAGATGTTAATGTGAGTGTTCTGCCTCCTGAGTTTTTGGTTTGGGGGAGGGGAATATGATTTACATTTGCCTAATTAACTGATAATTACATTATCATAGCAGAAGCATTTTTGATAACTTAAGCTTATTTAATCTTCACTGATATAATGACAAATAGCTTTCCAGTGGAAGGGTAGAGTTTGCAATGCTGCAGCTTTCCTTTTGTCCGGATTTATTTATGTTGTCATTTTTTTTCGTGCTGTTTTTCCTTGTCTTAGTTTAAGAGGAAATATGATTCTGTGTTATCTTTATAAAATAAATTGAAAATGTCTCTCAGATGCTAAACTAAAGTAAACATGGTCTGGGTAATGTGAAAGCGAGTAANTTAAAATGAATGGANGCCTGTATAACTTTCGAACCTTGGTGGTGCCAGTGGTATTTGTGACAGTATCCTAATTAATGTTACATGAAAGGGAAATTTATATCAAGGATTTGTTCACATATAGCTTCCTTAAATGTATACGCAGCTGTACGGGTTGGTTGGTAGAGATAGGAAAGCTATATAAGAACAAGGTAAGTTACTCTATACACATACGCAGTTTGTGATATTATCACTCAAAAGTAACACGAAGATTTATCTAAAAGAAACACGAATCTCATGGAAAAAACACGCTGAGGGCTGATTAATGCATAAACATGTGACATTATCACAGCAGAGGCATCATTGATAACTTTCAGCACATTAATTCTTAAGTATGTGGCTATGTGCTTTATAGTCTATATACCGGTTGTTCCCTGAGAACTTGTTTGGCTCATAATACGTGGATAATACAATTTGCATCATTCCTNN
SNP_position 630
allele_1 T
allele_2 C
ASP_primer_S GCGGGCCACCAAGGTTCGAAAGTTATACAGGCA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCCACCAAGGTTCGAAAGTTATACAGGCG
common_primer TGGTCTGGGTAATGTGAAAGCGAGTAA
enzyme Stoffel frag.
dye EvaGreen

Line allele-1 allele-2

Population Linkage Group Position
KL-DH KL12 167.31
KL-DH_2024 KL12 167.31
KL-DH_2024_R2 KL12 167.31

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain