typing_method |
Tm-Shift
|
Marker_Class |
misc_cDNA
|
STS_primer_fwd |
GGAAGTAGTTTGATTGGTGCTGCC
|
STS_primer_rev |
AAAAGCCCAAGTGCACTACCAAAA
|
amplicon_seq |
NTCAGGTAATTTTCTATTCCTTTTTCAATGTTTAGTTAATTATTGCNAGCGTGAATTTACAGGGCTAATACTAATATAACTTGTTAAAGCTTATGTCTTCCTTTTTTGTTTGCACAAAAAAGTGGAATATCAATAGGTGTATTAGGCTATTAGCAACTAAATTGCGCAGACTTTCATTTTCAATGCCTCACCTGTGTCAGATTTCCAAAAATACACTACTTTTGGAGAATTCGACANGCACTCGTTTAACATTTTGAAGAGTCTGAGCAACATAATAACTAGGATTAAGCTAATTATTGACTTTGGTCTCAATCTTTGCATAATGAATCCCTTTATTGTGATCCATTGCCGACAACTCATGTATTTTTTTAACCGCTTGGCAATTCTGTATGACCAGTTCCTGCATGATTGATTTATTTTAAGCATGACCAGTTTAACATTGATTTGGACCTGCATACTCTCGTTAAGAGTGGTACTTTTATATTTGAGCTTCATTTGGTCAACTATCCCGTTATGCTGTATGCCCAGTGTTATCAAAAGCAAAAAGCGCGAAAAAGCTCTAAGGTCCGTTCGGGCATTAAGCACAAAGCGCAAATAAAGCATGAACTTTAATGAAAAAGGCGCAAAGGAAGAAAAAAATACAAANATATATGTCCAGTCCAAGACTAATGAATTCTATGTATGAATGATAAATATATGGGCAAAGAAATTGAAAAAAGATTACGATAAAGTGAAGTATCAATTATGTAGTGTCGAAGAGGCTCATTAGCAAGGAAAAGTATGCCTTAGAACCTTGATGACTACTCTGANGCACCANATGANGTGAGGCGAAGTGCTCANCACGTTTTGAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNAGCTAGTAGTAGGNAGCTCTAGTGTAGCNGCCTTAGTAAGCNTACGACTGTGCCNACTGGTAGNAGNCGTTAGTGTATGCTATTACGAGGGGNATGGCCNTTTTCTTATTTCTTATTTACTGTTTTTTTTNACTTTCGTATTGCTCTTATTTTCATGGCTCTCTTAGCTCTATTTGTATTATTTCTCATTTCTTATTTCNGTTATGCCATCCATTCTACTTCAGATATTACTATGACCTTGTTAACTATTCTTTATCTTGAGCCGGGGGTCTATCGGAAACAACCTCTCNACTTTTTCAGAAGTAGCGGTATGGACTGGGTACATTTTACCCTCTCCAGACCCCACTTGGTGAGAATTCACTGGGTTTGTNGTTGTTGTTGTGTTAAGTCAAAGGCTCATNTTATATACTACATATGCATAATATCATTATTGATGATTCNTATCTTTTGTTTGTTCCCATCATTTCTGTTTTGTGCAATGTCTCAAAAAAATTGTTTGTCAGTGTAATTTTTTGTGAAGCGGTTGCTATATATGGTGTAATTGTGGCCATCATTCTTCAAACAAAGCTCGAGAGTGTACCGGCCTCACAGATTTATGCCCCAGAGTCACTTAGAGCTGGCTATGCAATTTTTGCTTCTGGAATCATTGTGGGCTTTGCCAATCTTGTCTGTGGGTGAGTGTGGAGATTTTTTTTCTCATACATGGATTTCTACTTCGTGCTGTCAAGTTTAGAGCAATGTTTTTCTGCCCCTTTAATTATTGTTATCCTTTTTATTTCTTTTGCAAAGGTTGTGCGTTGGGATAATTGGAAGCAGCTGTGCTTTATCTGATGCACAGAACTCCACGCNN
|
SNP_position |
1164
|
allele_1 |
T
|
allele_2 |
A
|
ASP_primer_S |
GCGGGCGGGGGTCTATCGGAAACAACCTCTCA
|
ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCGGGGGTCTATCGGAAACAACCTCTCT
|
common_primer |
CCCAGTCCATACCGCTACTTCTGAAA
|
enzyme |
Stoffel frag.
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dye |
EvaGreen
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