+Marker Data: TC4862

Crop pepper
Population KL-DH
Linkage Group KL06
Marker Type SNP
Map Position 162.24
Annotation
Source Name
Source Type CaGI.release_2
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

typing_method Tm-Shift
Marker_Class misc_cDNA
STS_primer_fwd GGAAGTAGTTTGATTGGTGCTGCC
STS_primer_rev AAAAGCCCAAGTGCACTACCAAAA
amplicon_seq NTCAGGTAATTTTCTATTCCTTTTTCAATGTTTAGTTAATTATTGCNAGCGTGAATTTACAGGGCTAATACTAATATAACTTGTTAAAGCTTATGTCTTCCTTTTTTGTTTGCACAAAAAAGTGGAATATCAATAGGTGTATTAGGCTATTAGCAACTAAATTGCGCAGACTTTCATTTTCAATGCCTCACCTGTGTCAGATTTCCAAAAATACACTACTTTTGGAGAATTCGACANGCACTCGTTTAACATTTTGAAGAGTCTGAGCAACATAATAACTAGGATTAAGCTAATTATTGACTTTGGTCTCAATCTTTGCATAATGAATCCCTTTATTGTGATCCATTGCCGACAACTCATGTATTTTTTTAACCGCTTGGCAATTCTGTATGACCAGTTCCTGCATGATTGATTTATTTTAAGCATGACCAGTTTAACATTGATTTGGACCTGCATACTCTCGTTAAGAGTGGTACTTTTATATTTGAGCTTCATTTGGTCAACTATCCCGTTATGCTGTATGCCCAGTGTTATCAAAAGCAAAAAGCGCGAAAAAGCTCTAAGGTCCGTTCGGGCATTAAGCACAAAGCGCAAATAAAGCATGAACTTTAATGAAAAAGGCGCAAAGGAAGAAAAAAATACAAANATATATGTCCAGTCCAAGACTAATGAATTCTATGTATGAATGATAAATATATGGGCAAAGAAATTGAAAAAAGATTACGATAAAGTGAAGTATCAATTATGTAGTGTCGAAGAGGCTCATTAGCAAGGAAAAGTATGCCTTAGAACCTTGATGACTACTCTGANGCACCANATGANGTGAGGCGAAGTGCTCANCACGTTTTGAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNAGCTAGTAGTAGGNAGCTCTAGTGTAGCNGCCTTAGTAAGCNTACGACTGTGCCNACTGGTAGNAGNCGTTAGTGTATGCTATTACGAGGGGNATGGCCNTTTTCTTATTTCTTATTTACTGTTTTTTTTNACTTTCGTATTGCTCTTATTTTCATGGCTCTCTTAGCTCTATTTGTATTATTTCTCATTTCTTATTTCNGTTATGCCATCCATTCTACTTCAGATATTACTATGACCTTGTTAACTATTCTTTATCTTGAGCCGGGGGTCTATCGGAAACAACCTCTCNACTTTTTCAGAAGTAGCGGTATGGACTGGGTACATTTTACCCTCTCCAGACCCCACTTGGTGAGAATTCACTGGGTTTGTNGTTGTTGTTGTGTTAAGTCAAAGGCTCATNTTATATACTACATATGCATAATATCATTATTGATGATTCNTATCTTTTGTTTGTTCCCATCATTTCTGTTTTGTGCAATGTCTCAAAAAAATTGTTTGTCAGTGTAATTTTTTGTGAAGCGGTTGCTATATATGGTGTAATTGTGGCCATCATTCTTCAAACAAAGCTCGAGAGTGTACCGGCCTCACAGATTTATGCCCCAGAGTCACTTAGAGCTGGCTATGCAATTTTTGCTTCTGGAATCATTGTGGGCTTTGCCAATCTTGTCTGTGGGTGAGTGTGGAGATTTTTTTTCTCATACATGGATTTCTACTTCGTGCTGTCAAGTTTAGAGCAATGTTTTTCTGCCCCTTTAATTATTGTTATCCTTTTTATTTCTTTTGCAAAGGTTGTGCGTTGGGATAATTGGAAGCAGCTGTGCTTTATCTGATGCACAGAACTCCACGCNN
SNP_position 1164
allele_1 T
allele_2 A
ASP_primer_S GCGGGCGGGGGTCTATCGGAAACAACCTCTCA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCGGGGGTCTATCGGAAACAACCTCTCT
common_primer CCCAGTCCATACCGCTACTTCTGAAA
enzyme Stoffel frag.
dye EvaGreen

Line allele-1 allele-2

Population Linkage Group Position
KL-DH KL06 162.24
KL-DH_2024 KL06 161.74
KL-DH_2024_R2 KL06 161.74

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain