+Marker Data: CO906603

Crop pepper
Population KL-DH
Linkage Group KL03
Marker Type SNP
Map Position 48.18
Annotation
Source Name
Source Type CaGI.release_2
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

typing_method Tm-Shift
Marker_Class misc_cDNA
STS_primer_fwd GCTTGGAGGAAACAGATGCCTAAA
STS_primer_rev GCTCTCGTTCTTTTGTTTGCTGGT
amplicon_seq NTGCCTGGTAANTTCTTGTGTTTTGTTTGTACCATGTTTTTTATGTTGTTGCTTTGGCTTGAAAAATATGTGTATTTGTCTTCCATGGTCTTATGTTTTGATGAAATGGGGCTAAACTAAGTGAAGTGGATCGTGAACTAGCTTGGGATTTAGGGGTAACTATGTGATTTTGAGGGAATTAAGTGTGCTTGTGTGTAAACAAGGTCTTGTAAGTTTGGAAAATTTAGCTTAGTTGCTCTGATTGAGTGGCCATGTAGTGCAATATTTGTCAGTTTGTCCTCCTTTTTTCCATTTCCGAGCTGGGATTCCTTCTGGGATGTTCTCTCAAAGCTANATTAGACTGCTTCATACTGATATCTACTGTTGGTGNTGGGAAATCTTACTTTATAAGGGAACTTCTGTATTTGTTTGAAGCAAGGAGCAGCTTCTGAGGTGCCTCCTAGCTAGTCAGGGAACAGTATTTTTATTTAAGCTAATATGTTCTGCTAATTGTTGTAATCTGAGAGTGTTCTTACTCTACGAGATAGATCTTATCTTCACTACCGATGAAAGTTCCATTTGGTATTTAGTTGTTCCTTCTTGGTTGGCTTTCTCCTTGTCGTGGAATACTTGTCTGGTAACTTCAATTGCTTCTGTTTGTGGTTGAGTTCCAATTCTGTATTTTCAAAATAAACATCTAAAACATGTGCCCCAAGATCCAACTTCTTCTCCTCTGATCTACATTGCATTGTATAANCATGCATTCCCCTTGCTTCTTCTGTGGAAACATAATGTCTTTTCTTTCGACANTCAGTAGTTTGTCCGGATTANNNNNNNNNNNNNNNCAGCAGTTTTGCGAACNNNCACTTGTGTTTTTGACTNNCAGTGAATGCTCTNNNNNNNNNNNGTTCCCCTTCTGAAAGCTTTCTTAAAGNATGCGAAAAAAGCTGCTGCTGCAATCATGGAAGATCCAAATAATTCTGGTCGAGCTGTGGTATCATCCAATTCTTTTTCTCTGTTATATATCACATCCAGCTTTCNTTTGTCTTGTTTAAATTTAATTTCTTCCTGTGTCTTGTCTAAATTTATTTTCCAGNTTGTCTCAATTGTCTNTATCTAAAATAGTGGCAACTGGCTATGTTTGACTTGTCTCTTTCTGCTATCCTCTTCCTGCCAACAATGCCCCATTTTATGTTGAAGTCATTATTTCTCTACCTTCCTTTGGATAAAAATGTTTAGGCGTTCAACTTTGCTAAATCTGCATACATCCCTGTATGCTTGTTGATACATAGTCTGTGAAGTGTTGCCTAATTGATTGNCGTAATGATGTAAAAGATCTGAGCTTCTCTTGCACCATGTCAGTCAGGTTATGCATACGTTTGATGCCATTGAGCTTAAAGCTCAAATTTTCTTATGAAGCTCTAATGTTGTGATGTATTGCCTTAAAGTACCACAGCAACAACATACCCACTATGTATTAAAGTCCATTANGTCTATTACGTCAAAAGAAACATGGGGTTTATNATGGATGATAAAGACACTTTTTTNGTCATTCGAATTTACTTATTGGTTTTTTGCCATGTTTAANCAGCATTTTGCTGCTAAGAAAGAGCAATCAGCAATTCGTTCAGTTCTCAAATGCATTGAAGAATACAAGCTTGAAGCTGAATTTCCACCAGACAGCCTTAAGAAGCAGCTTGAGCAGTGGAGAAGCCCAAGAANGANNNNNNNNNNNN
SNP_position 1298
allele_1 A
allele_2 G
ASP_primer_S GCGGGCTCTGTGAAGTGTTGCCTAATTGATTGA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCTCTGTGAAGTGTTGCCTAATTGATTGG
common_primer CTGACATGGTGCAAGAGAAGCTCAGAT
enzyme Stoffel frag.
dye EvaGreen

Line allele-1 allele-2

Population Linkage Group Position
KL-DH KL03 48.18
KL-DH_2024 KL03 48.18
KL-DH_2024_R2 KL03 48.18

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain