typing_method |
Tm-Shift
|
Marker_Class |
misc_cDNA
|
STS_primer_fwd |
GCTTGGAGGAAACAGATGCCTAAA
|
STS_primer_rev |
GCTCTCGTTCTTTTGTTTGCTGGT
|
amplicon_seq |
NTGCCTGGTAANTTCTTGTGTTTTGTTTGTACCATGTTTTTTATGTTGTTGCTTTGGCTTGAAAAATATGTGTATTTGTCTTCCATGGTCTTATGTTTTGATGAAATGGGGCTAAACTAAGTGAAGTGGATCGTGAACTAGCTTGGGATTTAGGGGTAACTATGTGATTTTGAGGGAATTAAGTGTGCTTGTGTGTAAACAAGGTCTTGTAAGTTTGGAAAATTTAGCTTAGTTGCTCTGATTGAGTGGCCATGTAGTGCAATATTTGTCAGTTTGTCCTCCTTTTTTCCATTTCCGAGCTGGGATTCCTTCTGGGATGTTCTCTCAAAGCTANATTAGACTGCTTCATACTGATATCTACTGTTGGTGNTGGGAAATCTTACTTTATAAGGGAACTTCTGTATTTGTTTGAAGCAAGGAGCAGCTTCTGAGGTGCCTCCTAGCTAGTCAGGGAACAGTATTTTTATTTAAGCTAATATGTTCTGCTAATTGTTGTAATCTGAGAGTGTTCTTACTCTACGAGATAGATCTTATCTTCACTACCGATGAAAGTTCCATTTGGTATTTAGTTGTTCCTTCTTGGTTGGCTTTCTCCTTGTCGTGGAATACTTGTCTGGTAACTTCAATTGCTTCTGTTTGTGGTTGAGTTCCAATTCTGTATTTTCAAAATAAACATCTAAAACATGTGCCCCAAGATCCAACTTCTTCTCCTCTGATCTACATTGCATTGTATAANCATGCATTCCCCTTGCTTCTTCTGTGGAAACATAATGTCTTTTCTTTCGACANTCAGTAGTTTGTCCGGATTANNNNNNNNNNNNNNNCAGCAGTTTTGCGAACNNNCACTTGTGTTTTTGACTNNCAGTGAATGCTCTNNNNNNNNNNNGTTCCCCTTCTGAAAGCTTTCTTAAAGNATGCGAAAAAAGCTGCTGCTGCAATCATGGAAGATCCAAATAATTCTGGTCGAGCTGTGGTATCATCCAATTCTTTTTCTCTGTTATATATCACATCCAGCTTTCNTTTGTCTTGTTTAAATTTAATTTCTTCCTGTGTCTTGTCTAAATTTATTTTCCAGNTTGTCTCAATTGTCTNTATCTAAAATAGTGGCAACTGGCTATGTTTGACTTGTCTCTTTCTGCTATCCTCTTCCTGCCAACAATGCCCCATTTTATGTTGAAGTCATTATTTCTCTACCTTCCTTTGGATAAAAATGTTTAGGCGTTCAACTTTGCTAAATCTGCATACATCCCTGTATGCTTGTTGATACATAGTCTGTGAAGTGTTGCCTAATTGATTGNCGTAATGATGTAAAAGATCTGAGCTTCTCTTGCACCATGTCAGTCAGGTTATGCATACGTTTGATGCCATTGAGCTTAAAGCTCAAATTTTCTTATGAAGCTCTAATGTTGTGATGTATTGCCTTAAAGTACCACAGCAACAACATACCCACTATGTATTAAAGTCCATTANGTCTATTACGTCAAAAGAAACATGGGGTTTATNATGGATGATAAAGACACTTTTTTNGTCATTCGAATTTACTTATTGGTTTTTTGCCATGTTTAANCAGCATTTTGCTGCTAAGAAAGAGCAATCAGCAATTCGTTCAGTTCTCAAATGCATTGAAGAATACAAGCTTGAAGCTGAATTTCCACCAGACAGCCTTAAGAAGCAGCTTGAGCAGTGGAGAAGCCCAAGAANGANNNNNNNNNNNN
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SNP_position |
1298
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allele_1 |
A
|
allele_2 |
G
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ASP_primer_S |
GCGGGCTCTGTGAAGTGTTGCCTAATTGATTGA
|
ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCTCTGTGAAGTGTTGCCTAATTGATTGG
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common_primer |
CTGACATGGTGCAAGAGAAGCTCAGAT
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enzyme |
Stoffel frag.
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dye |
EvaGreen
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