+Marker Data: gg12387_647

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_12
Marker Type SNP
Map Position 66.452
Annotation
Source Name FKO03-01.664.C3
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_rep_c12387
454-Contig_seq (unpadded) AACTGAAAAATAGAGAAAATGTTTTTAATCTGTTATTCATATATTTTCGACAGGAGGCAAATGAAAAGGATTGAAAGTGAGAGACCAGTTTCACAGAGCAATGGAAGGAAACGGCGAAAGAGAGATCGATTTTGCATAATCCTTTGATCTCAAAAATGTTCTTTTTGAGGTTGTTGGTTCGAAAATTAAGTTATTTCAGAATTATAATTTTAAAATTAATTTAATCTACCTGGAAGGTAGGATGAAATAACAACAAATTTGGTGGGGTATTTAGAATTAAGTTTATCATTAAATTTATATTTTGTTTGATGAAAAATAACTAAACAAAGTGTAAATTTAATCTTAAACTTAATGTTGAAATATCCCATCTTATTCCATGAACTAANATAGCCCCTTAGGTTGTTATATTCTACTGTTGGGNAAAAAAAGAAAGCTTATTATAATTAATCTTAGTGTGTCTTTAATTTTATCATTACTAGCTTATTGTNAAAAAATGTATTAACCTTCAAAATTATTAAATAAAAATNAACATGGTTATAGCTGCTTCTATTTATCACCACTCTTGTAATATCCTTATTGTCACATNTCTTTTTTTCTTTATCAAAANATTTAAAAAATATAAAGAAAATGTATGATTCAGTGACGGAAACAGAAATTCTTCTAAAGGTGTTTAAGAATAANTTTTTTTGTAAATGAGTTGAATATTATTGATTTAGCCTAGCAATTGTACCATGAACCATCCCACTAACATTTATTACTATCAAATACAAACAATCGNTATTTTTTCATGATGCATTTATTTTATATGATAAAAAGTATATGAATTATTGTGTTTAGAGTGGAATATTGGTTAAACAAATACTTATGAAACCTAAATCACACCAACACATGCACCGATTTTAACTTTGTGTTAAA
SNP_position 647
sequence_for_GGdesign CTNTTTTTCTTTATCAAAA-ATTTAAAAAATATAAAGAAAATGTATGATTCAGTGACGGA[A/G]ACANAAATTCTTCTAAAGGTGTTTAAGAATAA-TTTTTTTGTAAATGAGTTGAATATTAT
GGdesign_Final_Score 0.675
Ilmn_Id 12387_647-0_T_F_1967852737
allele_1 A
allele_2 G
Line allele-1 allele-2
Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_12 66.452
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain