+Marker Data: gg10705_341

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_11
Marker Type SNP
Map Position 18.826
Annotation
Source Name FKO03-01.5981.C1
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_c10705
454-Contig_seq (unpadded) CTTCTGTGATGGTTGTCATTTGCTTGTACTGGCTTGGATTAGTCGATCATGTTGGCACTCAAAGCAAAGAGACTGTGCTGAACCTTTCGAGTCTTCCTGTTGCTATTGGACTTTATGGATATTGTTACTCTGGGCATGCAGTGTTTCCTAATATATACACATCCTTGGAGAAACGTAGCCAANTTCCCTGCTGTACTCTTTACCAGGTAACTATTTATACNACATCAAAACAGCATAGAGATTATCCGCNGTCAACANTTCTGGATTTCCTTGGACCTCGTGTTTTCCTGTTTTACCTATTTTTCATTAACGTGGATATAATTTGGATGCAGTTTTGCTATTGTAACTGTGTTGTACTCCGGAGCAGCTGTGATNGGGATATATAATGTTTGGAGACTCAGCTGAATCCCAGTTTACTCTGAACTTGCCTACAGATTTAGTTGCCTCCAAGATTGCTTTTTGGACCACGGTAAGTGAAACCTGATTGATCGAATTCTCTCCTTGAAATAACCATTTGNATGAACACGTGATGACAAATCGTCTGCTTCTTTTGCAGATCGTTAATCCATTCACAAAATATNGCATTGACCATGGCCCCTGTGGCTATNGAGTTTGGAGGAGTTGATACCATCGAACCATGCCAAATCTCACATGTACAGCATCCTCATTAGAACAGCACTGGTGCTGTCCACATTACTCGTGGCTCTTNAAAATTCCATTTTTCGGTAAGTTAAGCTGCTATAATTGCACTTTATCAATATTGCCTGGACATTGTGTTCTTGANTCCCCTAAACGCGTTTGGAACNAAACTTATCCCAACAAAAAAAANATNGATATCAAACTTATCTACTAATTGTCCTGCAGGATTTGTGATGGCGTTGATCGGATCCTTTTTTACCATGCTCGTGGTGAGTCCTTTTTACCAGTTCTATGTTTTCGTTACATAGATTTTATGTTTCCANTTTTTGATAGAATTGAACTAATATATGATCTTTTCTTATATATTTCAGACATTGATTCTACCTTGTGCTTGCTTCTTGAGAATTTTGAAGGGAAAAACAAGCTCCANTTCAGGTACAACAGAAGNTTTCTCTATATCTCAAACCATTTGTTGGTACTAATTATCNAAGTTTTAGTCAAAACTTAATCGAGGGTCTATCAGAGACAACCTCTCCACCTCTAANNGGGGTAAAGATCAGCAAACACTCTACCCTCCCCAGANCCCCACTTGGCATATTGTTAAAACNAAATCGACTCATCAAATGAGGTAGTCGNACTTAAGTTATCCATAGCTCTTAAAACTTTCGCCTCTTTGTTGTCCTAAAGTACACCGTTGATGAGACTTNCATTTGNCACCGTAGAGAATCCAAAATCTAGAGTCAGTAAGTTCAGAATGAANTGTGATCTTTACATATATTACGATCCATGTCCTTTTGNTTTTCAGTTGAACTACTGAANTTCGCCCTAAATCCGTCNTTTTTTTAATGNCAGGTGGTAACATGTATACTTATTATCATAATAGGCAGCATGTCAGCAGTTATTGGATCCTACTCAGCCCTCTCCAAAATCATCCATAGCCTATGAGTGAAGAAAATTGGCAATACAAAACAATGGCCATAGATGTTTTCAAGTCTAAGATTTTATAAAANTTTTTTGNTGTGTGTGTTCTATTCTTAGTCTCAGGCTTGTGATCTCAATGCAATCATTTTGTCTTTNTAGAGAAGAAATTTTATGTCATCTTGATTGCATGTTACTCAAACCATATGGCTTTATGTAGATTGCTTCANTTTTCTTTTTATCGGTGAGAAGTAAACACTCTAATTTTGAAAGTGCAAACGTCTAGATATTTTAACTTGGTTTCAAGCAGCAACAAAATACTCAAAGCCTATTCCTATTGTGCCTCGTGGGCACCTGACGCTGGTGTATGACACATAAATTTTAAAGATGTCTAGATAATCATTTTGAAGTAAAGTGTTTAACTAACATACTAAAGAAAAGTGGAATCGTCTAAATATGCACACTCAAAGTTGGAAGTGTTTACTCACTAACTGACATCGTGTTTGAGTATTTGTTTACGCATTATCCCTCTCAGNAAAATAGGAAAACTACAATTTTAAGATTTCATGTTCAAATTCTAGCNAAATCTATTCTCATTTCTGTTTAGCCTTGATAATATCTGATACCTATTACTAGTGAGAGGTGACACGTCTCATAATTATGTAATAAGTTGAGGTGTCCATTAATTGATTGAAATTAGTCGAAATACATGTAGGCTACCTCAGCAACAATAATATACCTAGTAAAATTCCACAAGTAGTATTTGAGAAGGATAAAATGTACGCAGACCTTACCTCTACCTCANTAGAGGNTAGAGAGACTGNTTTCCAAAAGACCCTCATCTCAAAANATCATCCCNCAAGAGCAAAAAATACTAGTTATGAAACCAAACGACTAGAACGAAAAATAAATGATAANTTTTGTAAAGACAATAAAAGTAACAAAATGAATGACCGACAATAACAACACAATAAATGACGTGTAGGCTACCTCAACAACAACAACATACCCAGTGAAATTTCACAAGTGNGGTCTGAAAAGAGTTATATGCAGACCGTACTACCACCTCACAAAGGTAGAGAGGTATAGCCACTTAATAAGACAGAATTTTCCATGGGTCTTTCCTTGTACTATNAATTTGGCTGAACAAAATGATANTTTGCAGGATTTTGATAACAGAAAGGGAAGAATAAAGAATAAAGGATAACTAAAATACAGTAATATTTTCAGATTACATTTACACTTCTGCAACACCTACAACTTATAAACAAGCATACTCTCTCTCCAAGCCGCGGTCTTTGCTCATTGTTTTGTGAGCAAAATGGTTGATCTCCTAGCAAAGGCAGCAGCACGCCATGACACAGATACATCATACATATGCTACGATTACTAGGTTTCACCGTAAAGACTAC
SNP_position 341
sequence_for_GGdesign GTTTTCCTGTTTTACCTATTTTTCATTAACGTGGATATAATTTGGATGCAGTTTTGCTAT[T/C]GTAACTGTGTTGTACTCCGGAGCAGCTGTGAT-GGGATATATAATGTTTGGAGACTCAGC
GGdesign_Final_Score 0.924
Ilmn_Id 10705_341-0_T_R_1951736705
allele_1 T
allele_2 C
Line allele-1 allele-2
Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_11 18.826
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain