+Marker Data: gg17330_461

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_11
Marker Type SNP
Map Position 1.512
Annotation
Source Name SHT03O18W
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_rep_c17330
454-Contig_seq (unpadded) ATTATTTCGTTCTTGAATCTAACAGGAGTAAATGAGTTATTTACTTTTAGCTGACTAACCAAGATTGAGTCATATGAACATAGGAATCTCATGCATGTTCAAACTTCTATTAATAATTCTGTTTGTTTATTAGTTTAATTCATTTTAGGCGTCCAATNNAGTCANNNNNNNNGTTAGATTAATATAATATATATATATATATATATATATACACATATGTNGGCAGCCTCCTCCAGAAATAACAGTTGTGTTGAACGTTCAAATGCATTGTGATGCTTGTGCTCAAATTTTGCAGAAACAAATTCGCAAAATCAAAGGTACAATATAAATAATTTATTCGGAATTCATAAACTCAAGATCTTAGTTTTGAATTCTAGCTAATAATTGATTTGAGCTATATGTTGTGACAAGTGTCAACTTTAATTTTATAATATGATGTATGCAGGTGTAGAATGTGTTACAATAGACCTTGAAAAAAGTCAAGTAATTGTAAAAGGTGTCAATATTGATCCAGAAAAGCTAGCAAATGATGTATATAAGAGAAGTGGAAAACAAGTTTCAGCTGTAAATAATATTACTCCTACTNGAAGAGAAAAAGGAAGAGGTAAAAGAAGAAGAAGAAAAGGAAGAAGATATTATGAAGAATTATGTTTTGGNCTCAAAAGTACNAACAACAATATGGAGTACTTTGCTAATTATTCCCCTGAAATTTTCAGTGATGACAATCCTCATGCTTGCTCTCTCATGTAACTCAATTTTCAGGCTAATTAATTGATTATATCTAATGTTCAATATTCGTATTATTAGAGCTTGATTAGTCGAAATTTGTACTACATAAAGCCAATTGAGGGATAATACCGTACTAAATATTCAGAGTTCAAAAATCNAAAATCNAAAACCTTCAGTTAAGGAAGAAGCAATCAGCTTCAGTGGTTGTAATTTATTGTTACTTATAATAAACATGATCAATTATTG
SNP_position 461
sequence_for_GGdesign TTGTGACAAGTGTCAACTTTAATTTTATAATATGATGTATGCAGGTGTAGAATGTGTTAC[A/G]ATAGACCTTGAAAAAAGTCAAGTAATTGTAAAAGGTGTCAATATTGATCCAGAAAAGCTA
GGdesign_Final_Score 0.831
Ilmn_Id 17330_461-0_T_F_1967852404
allele_1 A
allele_2 G

Line allele-1 allele-2

Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_11 1.512

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain