+Marker Data: gg16135_1057

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_11
Marker Type SNP
Map Position 73.415
Annotation
Source Name FKO03-01.16379.C1
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_rep_c16135
454-Contig_seq (unpadded) TATATGTATACTGTACAGTTTATGGAGCTTATATGTACAGTTGATTAGCTATTTATTGCTTTTAGAAGAATAGAAGTTGCTTGAAAAATTGTAAAGAGTTGTTTTAGCTGTATTACCTTTTTAAGTTGTTAGATATGTAATAGTTTTTCGTCTTAGGTGGATGAGCTAAAATCCACCTAAGTAATTAATTATGATTATCGAACAATCATACTGCAAAATACTGAAATTGAAATTAGAAATATCGAACTATATCGAGCTAATTTGGTATGGTAATAATATCATATCTTTAGATATCAAAAATCAAAATTACCACACCAAATTTTAAATATCATACCATACCGTACCATGCCCACCCCTACTTTCTATTGGTAAAATTATCAGATTACTTAATCCATTTATAAACATTGACAAGAGTGTATACCAAACACCATCTCTAGTTTATTTATCCTTGCAAAGAGAACATTTAGGCAGAAGATNAATNTGAACTCTCATTGGTCAACAATGCACTGTATATATGAAAAATNGAACTATATTAAACAATTTCTATAAATCTATTGGCCTTTTTCATGAAAGTACATTGNAATATATTATTATTTTTAAAANTGTTTACTAATTGGGAACCTATCAATAATTGTAGCTACTTCTGAGTCAAATAAAANGTTTTAGTTTATGATATACCAGAATAACTATAATGACAGACATGNAGGGAAAAAAATATAATGTGATGCAACCAGAAGNAGTAGTTNCAATACTAACAGTTACTACCACAATAAATATAATATACCTATTGGGNATATATAATGTGATGCNAACCAAAAGAGTAGTTCAATACTAACAGTTACCACCACAATAAATATAATATACCTATTGGGATTGTCTAGGAAAGGTGGAGTGTATGNNCAAAACCCACCCGTACCTTTGTGGGGTAGATTCCGNATAAGACAAATAATAGTNGAAAAACAAAATGAATTCCGGGTGCACTCTCTGTTTCTTGATCACTTTCGAACTTTGTGACAAATTGAGGACATTAGATGAGCAACAAGACATGCTTTTTATGACTATATTGTCTTTAAGACGGATGTGATGGAAAGAAGTGGAAGTAACATTTAGGTTCCGCCATAACAGAGCTAGAAAGGATTGTCTTAGGAACAAGATAATTCTATATCCTCATATATTTGCTTTGATCAACTCCCTATATAAACTCTTCANTTTTTACACCTGATGTAGTCCTGCATATATTCAAGCGCGCCCAAATTAGAAATTCTTGAGGCAACAAAAGNTTTACACTTCCTAACATTCTCTTCAAGTTGNATTTTTGCCCTTCAACACTTTANAGTAATAAAAAGTTGNCCGAAAATATCCCTGACATCGAATTAACAAAAAAAGAAAATATCCCTGACATCAAATTAACAAAAAAAGAATCTGCAAGACAAAAGTCTATAGTTTCGTACCATAATATAACAAGTTATGTTGTTTAAATTCCTATATAATAATGGCGTAAGTTCAATTCGTAACTTAGT
SNP_position 1057
sequence_for_GGdesign ACTTTCGAACTTTGTGACAAATTGAGGACATTAGATGAGCAACAAGACATGCTTTTTATG[A/G]CTATATTGTCTTTAAGACGGATGTGATGGAAAGAAGTGGAAGTAACATTTAGGTTCCGCC
GGdesign_Final_Score 0.936
Ilmn_Id 16135_1057-0_T_F_1967852786
allele_1 A
allele_2 G

Line allele-1 allele-2

Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_11 73.415

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain