+Marker Data: est_smfl17n01

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_05
Marker Type SNP
Map Position 57.7
Annotation
Source Name SmFL17N01
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class EST-misc
STS_primer_fwd TTTGGGGAGGTGTTGATTTGTCTT
STS_primer_rev GCATGAAGAGCTTCAGCCAATTTT
amplicon_seq GACATTCTGGATTTTTAGTATCACACTGCCAACTGCTGTATGCAACTTTCTTTCCTTTGTTCTCTCAGGAGAATTTGTGCTAGTAATGCCTTTCCTTGCATCTCCCTTGGTCGGTTGTTTGAAGGATTTTTTCCCTCGATGTCTTAAGGATTTTATTAATGCGTTAAGTATTAAACAATTCATGTACTTCAGATTTAGTAGTTCATATTATTTCTGCAGCTATTGCCAAGTCGCTGGATTTTAATATATTGTGCCAAAGGGTTTAGATTCAGATTATAAGATAATTTGTAGGCTTTTTAGGTTTGCATTGTTTCACTTAATTTCATAAATATCATCCAGTCAGTTCTTTTGCAGAATCATGCTCCTTAGCCATAAAAAGTGCATGGTTATTATTTGGGAGAATCAAGTTTTGTGATAATTTAGCATTACTTCACTGAAGGTTGTTATTGTGCTAATGTTTTCAGTTTAGCGGTTGAGATCATGAAATTAAAGATTATTGTATTTTAGTCTCTTTCACGTATGGATGTTTGTCCAACAATATGTTGGTCTGTGGCTTGCTTACAGATTGGTGTTTGTTCTTCTACTTGTAATGTAAATGATACAGCTTCTATTGTTGTAGTAAAATAGAGACTTCAAGGTGATTACTTATTAAAAGATAGAATTCAAGCTGATGATTTCTTTAAAATACCTAATAATCAGTAATGCCTTGTCTGAGAAATGGCTTAGGAATAAGTACCAAGCCACCTTTTAGTGGTTAAGTCAAGTTAAGTTGTATTCTGCTGAAGATTCAATTATTTTGAAGTGTACCTATGGTTGTATTATACTTGCACTATTAGGATGGAAATTACATTAGTGTTAGTTCTGTTGTTTACTTGTTGATCCAATGTAGGTCTATTGGACTCC
SNP_position 641
allele_1 A
allele_2 T
ASP_primer_S GCGGGCTGTAGTAAAATAGAGACTTCAAGGTGT
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCTGTAGTAAAATAGAGACTTCAAGGTGA
Common_primer ATTATTAGGTATTTTAAAGAAATCATCAGC
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I

Line allele-1 allele-2
AE-P03 A A
LS1934 T T
WCGR112-8 A A

Population Linkage Group Position
AL2010 E_05 57.7
ALF2 AL05 56.4
LWA2010 LWA_05 47.901
LWAE2012 E_05 51.451

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain