Typing_Method |
Tm-Shift
|
Marker_Class |
EST-misc
|
STS_primer_fwd |
TCCACAATCTGAAACAGCAGGAAA
|
STS_primer_rev |
ACCAACTCCACCTTTGCCAGATAA
|
amplicon_seq |
NNATCAAGAAATTTGTGCTACTGCTCCCAAAGGACCCGACCCAGGTCACTTTTCCTGCATATTATGATTCTGTAAAGATATTTTTTTGAGCTTGTTTTTTGTTATCTTTGAGATGTTGGGTGTCAATTTTGTGACAGTAGGGTGTTGTATTGTATCCTCCCAAAACATTGCATGTTCTTGAATAATTATGGGGTGCTAAGTTTTAGGCAGATGGGGAAAATCACCTCCCCTACTTGTTTGGATTGAGGCGTAGTAGTTATTGTTGAGGAAGGAACTATCTCCCTAACTAGTTTGGAAACGAGTCATAGTTGTTGTTGAGAAGAAATCACCTAGCTTGCATCCTAGTTGTGGCCTAGTGATCAATGAAGTGGTTGGGAATCATGAGGTGTCAGGTTTAAATCTTAGCGGAGAAAAAAATACTAGGTGATGCTTCCTATCTATCCTAGTCTTGGTAGAAAGAGTTACCTGGTACCTTTTGGAGGTGTCAGATATTTCATTGATTTAGTCAAGGTGTCCGAAAGCTGGCCCAGGCATTACGATCATCAAAAAAGAAATCACCTAGCTGTTTTACTTCTGATGAATTTGAACCCTAGTCTTGAATGGTCGTCATTATAGGTTCATACCCGTGGATACTATCANGTTCTTATTTTAGTGTTTATTTTTAGTAATTGCAGCTTGCTCGTTGTTGTCTTTTGATGCCTTGAAGTCAATACATAATAATGCCANTTGAGTTTTTAAGTTCAGATTGTCACACTTTCCATGGGGGAGTGAGTAGAATCTCTTTAGGAGGATTAAAATTTTCCCAACAGTTCTCTCGTTGTGATTTACTGTATATTTTTTNGATAATATATATTAGTACTCTCTAGTCGTATATTGTCACAATGATGACCTGCGTTACATAATTTCTAAGAAAGCATAAAAACTTTCACCTGTTATTGTTAGTATGTCTATTTAAAATGATAAGAACAAAAATCTCTACGCCCCAATTAGTTTGCCATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAAGTACAAGATAAGAATGACCTATCAAAAAAGGAGAGGTTAAGATAAGAATGTAGATACGTCACTGTCGGGAGCTTGCTGATCAGAAAACTAATGTTTTCCTCAGTAATTTCTATTCTTGTTTGTTATTTATGTCATTATGTTTTCTTGGTGTCCTTGGCGACAATCATGCTCATAAAGTACATAAAAGTTACAAAGAAGGGATGCTTAAATTCATTTTATCTGGAACTTACCATAATCATAACCATGTTAAAAAATTTAAACCACTAACAGAACTTTTAATAGAAAGTTCATGGAAGACATAAGCTTGGCATGTCATATGCAAACAAAAAGAGTGAGGACACAGATCTTGAAAGTGCATGTTTTACTATGATTTCTAGGATGGTAGTTTGTAGTCTGTGCATCAAGAATCCAACTTAAGAAGTTGGAGGATGTCTATTTTATTCTATTTTTCATCAAGAGTCTTCAGTGGAGGATGAGCAAAGAAAGTGAGGATCATCTTCACCACAAAAAGATGTGCTAACATTCACACTATGGAATGCCCAAAGGAAATCAAGCACCTCCCAGGCAGACACTCTCTATCTTCTGTTGGATGTTACCATTTCTAATTTTAAAACCATTATTTTGGTACCTTAATTTGATTGTATGATAATATTTTTTATCTGATGATTTCATGTAATATGGTGCAACTCATGTAATTTCTTGTATATGTGTATTGCAGCGAGCGGCAGAGGAAATATTGGGAGTTATTGACTGCATTTTCTAATGGATAATTTGTTCTAGTTTGCTAACTCCCTAGGTTCTTGAAAATTGAAATGATAAAATGGTCACTAGTGTATACGTGCCATTTTCTATGTCGTGGTAGCATTTTTATTTGTCAAGTTCTATGTTGTGGTAGCATTTTTATTTGTCAATTTATACAGTGTCCTCACTTTCTATGTTTTTGTATTTATGGTTTCATACAGACTTGGTTGCAATAGTAGAAAGACTGGCAACTGG
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SNP_position |
710
|
allele_1 |
A
|
allele_2 |
T
|
ASP_primer_S |
GCGGGCTGTTGTCTTTTGATGCCTTGAAGTCAT
|
ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCTGTTGTCTTTTGATGCCTTGAAGTCAA
|
Common_primer |
CCCATGGAAAGTGTGACAATCTGAACTTA
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enzyme |
Stoffel frag.
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dye |
EvaGreen
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