Typing_Method |
Tm-Shift
|
Marker_Class |
EST-misc
|
STS_primer_fwd |
ACATTTGGCTATCGACATTGGAGG
|
STS_primer_rev |
TCTCCATTGGAAACTTCCTGTCTTTC
|
amplicon_seq |
TGGGAATTTGGAAAGTTACTTGCTTTTCTGTTTCTTATTGTTAGTTTGAGAGGGTTTAAGGATCAGTTTATTTTGTATTGAGATTCATAATTTAGTTATGCTAACTAGGGAACTAATTAAGAAAGAAAAAAATTTAAATAAAGTTGTGGAATTGATGGTTTTATGCTGCAATTCATGTTTCAGTTGATTCATAGAAATGAAAATGAAGAAATTCATATATGGCTGTATTGTAGCAGTCCACTAGTTCTACTATATTGAGTGATGATCCGACATCTTATTTTCATTGCACAATCCTATGTAGTGACAAGTGTAAAATGAGACGATAAAACCATGAATATCAAATTGTGTACAATNACAATGTATCACTCTTGAAGAAATGATTCCATAGTTTAGAATAACTCTTGCTGGAATCAACTGGTCAATTTTTTAATTGGAAAAGAGACTCTTGTTGGAATTGGTAGTTACTTAATCTTTGTCTAGTTAAAATCACTCTTTGAAAACAAAGAATCATCATCAACTGAGAGTGATCTCCAGAAGTCGAGCACTTTCTTCTGTTCTAGGTAACTTAAGCATTTTTGTAGATTATCAATTTCTAGATTGATCAAGGTACATCTGAATGTGCTTTAGTGAAAATTCTTGTTTTCCTTTGCAACAGAACTTCAGTTTTAGTTTTCAATTGTCATTTCCTACTTTACTTTGGAATGTTAAAAGTCCTTTCGTTTCATATAAGGTATATAAAATCTCAACAATTTTTTCATAGAGGTGACTGCTCAAAGGGAAGACATTGTTGATGTTTTGTAAAGTGGCTCTTACAGGGTGATTGCTTCACCCTCAATTCAAATTTAACTATAGCTGCGTCTGACATATCACCTTTGCTCTTCTGGAATCTAATTTTATTTGTGGATGAGGTCTAGTAATAAATGTAGTGGGTGCAAACCTTGGAGATCAAGGTTTGAATTCCGGAAGAGACAAAAAACCAGTGATTTCTTCACATGTGTCTAAGGCTTAGTGGACAGAGTTAACCGGTATCTGTGCTGGTGGGAGGCAACAGATACCCCGCAAAATAGTTGAGGTGCACTCAAGCTGATCCGGACACCACTTTCATTATTTTTTTTGTTGGTTTTAGTGGCAGAGGAGGAGGATAGGTATGTGTATTTGAAAGTTCAGAAACTTCAGAAAAATTTCTCCAAGATTTGAGCTGGCATTGGACATGAATTTGTATAGGACTGCTGGCTCAATTGCTTATTACTGATTTCCCAATAAGATGAACTCATAAGTTGGAAACATAGTTAAGTAGATAAAAATACCCTCTCTCTATTAGTATAGCTTTTAGATCAAGGGCTTACATAATGCAGTATGTTTTAGATTTAAAAAAAATTGAGATTTTTTATAAGTAGAACAAAATTGACTATTTTACAATATGTTGATCGGTATCTCCAATGTACATATTCAGATATTGAAGAAGCTGTATGTGATTTGGTTTGCTTTAAAAACCCTCCTACTAAAGGACCAAATAGAGAAAATGCTAAATGAAAGAACCTTTTCTTTTNN
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SNP_position |
861
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allele_1 |
G
|
allele_2 |
T
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ASP_primer_S |
GCGGGCTTCCAGAAGAGCAAAGGTGATATGTA
|
ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCTTCCAGAAGAGCAAAGGTGATATTTC
|
Common_primer |
GGTGATTGCTTCACCCTCAATTCAAA
|
enzyme |
Native Taq
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dye |
SYBR Green I
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