+Marker Data: est_ovs06m10

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_03
Marker Type SNP
Map Position 9.0
Annotation
Source Name OVS06M10
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class EST-misc
STS_primer_fwd ACATTTGGCTATCGACATTGGAGG
STS_primer_rev TCTCCATTGGAAACTTCCTGTCTTTC
amplicon_seq TGGGAATTTGGAAAGTTACTTGCTTTTCTGTTTCTTATTGTTAGTTTGAGAGGGTTTAAGGATCAGTTTATTTTGTATTGAGATTCATAATTTAGTTATGCTAACTAGGGAACTAATTAAGAAAGAAAAAAATTTAAATAAAGTTGTGGAATTGATGGTTTTATGCTGCAATTCATGTTTCAGTTGATTCATAGAAATGAAAATGAAGAAATTCATATATGGCTGTATTGTAGCAGTCCACTAGTTCTACTATATTGAGTGATGATCCGACATCTTATTTTCATTGCACAATCCTATGTAGTGACAAGTGTAAAATGAGACGATAAAACCATGAATATCAAATTGTGTACAATNACAATGTATCACTCTTGAAGAAATGATTCCATAGTTTAGAATAACTCTTGCTGGAATCAACTGGTCAATTTTTTAATTGGAAAAGAGACTCTTGTTGGAATTGGTAGTTACTTAATCTTTGTCTAGTTAAAATCACTCTTTGAAAACAAAGAATCATCATCAACTGAGAGTGATCTCCAGAAGTCGAGCACTTTCTTCTGTTCTAGGTAACTTAAGCATTTTTGTAGATTATCAATTTCTAGATTGATCAAGGTACATCTGAATGTGCTTTAGTGAAAATTCTTGTTTTCCTTTGCAACAGAACTTCAGTTTTAGTTTTCAATTGTCATTTCCTACTTTACTTTGGAATGTTAAAAGTCCTTTCGTTTCATATAAGGTATATAAAATCTCAACAATTTTTTCATAGAGGTGACTGCTCAAAGGGAAGACATTGTTGATGTTTTGTAAAGTGGCTCTTACAGGGTGATTGCTTCACCCTCAATTCAAATTTAACTATAGCTGCGTCTGACATATCACCTTTGCTCTTCTGGAATCTAATTTTATTTGTGGATGAGGTCTAGTAATAAATGTAGTGGGTGCAAACCTTGGAGATCAAGGTTTGAATTCCGGAAGAGACAAAAAACCAGTGATTTCTTCACATGTGTCTAAGGCTTAGTGGACAGAGTTAACCGGTATCTGTGCTGGTGGGAGGCAACAGATACCCCGCAAAATAGTTGAGGTGCACTCAAGCTGATCCGGACACCACTTTCATTATTTTTTTTGTTGGTTTTAGTGGCAGAGGAGGAGGATAGGTATGTGTATTTGAAAGTTCAGAAACTTCAGAAAAATTTCTCCAAGATTTGAGCTGGCATTGGACATGAATTTGTATAGGACTGCTGGCTCAATTGCTTATTACTGATTTCCCAATAAGATGAACTCATAAGTTGGAAACATAGTTAAGTAGATAAAAATACCCTCTCTCTATTAGTATAGCTTTTAGATCAAGGGCTTACATAATGCAGTATGTTTTAGATTTAAAAAAAATTGAGATTTTTTATAAGTAGAACAAAATTGACTATTTTACAATATGTTGATCGGTATCTCCAATGTACATATTCAGATATTGAAGAAGCTGTATGTGATTTGGTTTGCTTTAAAAACCCTCCTACTAAAGGACCAAATAGAGAAAATGCTAAATGAAAGAACCTTTTCTTTTNN
SNP_position 861
allele_1 G
allele_2 T
ASP_primer_S GCGGGCTTCCAGAAGAGCAAAGGTGATATGTA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCTTCCAGAAGAGCAAAGGTGATATTTC
Common_primer GGTGATTGCTTCACCCTCAATTCAAA
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I

Line allele-1 allele-2
AE-P03 T T
LS1934 G G
Nakate Shinkuro T T
WCGR112-8 T T

Population Linkage Group Position
AL2010 E_03 9.0
LW2010 E_03 36.2
LWA2010 LWA_03 36.217
LWAE2012 E_03 45.514
LWF2_2022 E_03 39.1

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain