+Marker Data: SOL8257

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_09
Marker Type SNP
Map Position 79.3
Annotation
Source Name SmFL03I20A
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd ctgaagaaatcgatgcacgctg
STS_primer_rev ttttctcggggaacaaaagtacca
amplicon_seq NNNNGAGGTTTTAGCATTCAANACCCTAAAGCATAAAGGACAGGCGTGGGTAGTGTTTGAGGATGTTTCTTCTGCTACCAATGCACTTCGTCAGATGCAGGGCTTTCCTTTCTACGACAAGCCTATGGTAATCATTGCTATTGTTTCCAATTTTCACTGCTGGATTCTAGCTTGCAACTGTTGCAATGTATTTGCTGCAATTCTAATTGATTGACACAAAACAACAACTTACTATCAACCCATCAACTATATCTCTCAAACTAGTGGGAATGGGAGTCAGCTATATGTAGGTTTATATTAATTGATTTATCATAACTTAGTTAATTTTATGCTGGCTGTGAATCCATTATAATCTTATGCTTCATCTTTATACAGACTTGGGACTGGATATGGTTTGTTAGCATAGGTAGAGCTAATGCAAATTAAACATTCTAGTATGGCTATTGTTATTTATTTTCCTGAAGAAACTATTGATCAGTAGGGAAGGTATCATAACCATATGTGTTTGAGAAATGATCCTAGATACATATTGATTGAAGCATTTAGGCATCTTACCTATGCTTAATTAGAGAAAACAATTATTCATGGTCAAACTTAGTAAAACCTCTGTGCGAATTTATGTGACACAATTTGACTCGGCACGAAGTTTAAGAAAGAAATGAAGACTATTGAAACTTGTAAACTTGGATATGCCATAATGCCACAACATTTGGGTCACTATAATACTTTTGAAACTTGTAATCTTAAACATGTCATATCATTAGTGTATCTATAAAAACTGTCATTAAGTACGAAATGAGAAGCTAAAGTTAGGTTGTTCTCAAATGTANGAANTGTATCATTTTCTTGAACGGATTAATAATGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTTAAGAGTGTTTTTCNATGCTAGTNCTAGGTGTCACNTCATTGCTGCTATTTTTTAAAAATCTATTTNGACGGATACAGCTAAAAGTTATTGCTTTCCATAGGCACCAACAAGTGCAAATAGTTGCAGGAAAAAAACCCNGAACGCCTGCAAACAGTTGCAGTGGAAAAACCCAAAAACACCTACAAAGTTTAGTAAGTCATGTACAGTGTCTATTAGTGTAAGTCATGTACAGTGTCTATGTGATGTACACTAATGATCTTTACACGAAAAAGACAAAAAGTACAAACATCTATATTTTACTTGTTTTTTGTTCTTTTGCATAACATATTATCATCTATAATTTTTTTTCCTCTTTAAATAATTGCTTTCTGTTTTTGCATGGCGTGCTACTGTCACTACTCTTTCCATTTCCTACCAATTGATAAAACAAGTGAATTGACTGAATTTTCTCAATGTTTACTTTTAAATGCAATGATACTCTTTAGACTTGCATGTTAGCATGTTATGGAGTTTAGCAAAGAGCATACAATGCTATATAATGTGGCCACCTCTTTGCTTGTTGTTCTTGCATGCACATGCTATGTTCATCTGTTGATTATTCGAGCAAGATTAATGTTGCTTCAAGATAATAAATGAGGTTGGGATTTCATATTTGGGAGTCGCTTTTTTAGTTCCTGAATTAACTTTTCTTTACCTCAATTATGTGGTAAAATGTCATTTTGATAGCTGCTGTTATATGTTTTATTGGTGTAGTATAGATTGGTTACATAGTTATTTTGAGACACATATGTCTTACATAGTTATTTTGACACATATTATATGTCTGTCTATCAGCGAATACAATATGCAAAGACTNNNNNN
SNP_position 275
allele_1 A
allele_2 G
ASP_primer_S GCGGGCATAAACCTACATATAGCTGACT
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCATAAACCTACATATAGCTGACC
Common_primer TCAACCCATCAACTATATCTCTCAAA
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I

Line allele-1 allele-2
AE-P03 G G
LS1934 A A
Nakate Shinkuro A A
WCGR112-8 G G

Population Linkage Group Position
AL2010 E_09 79.3
ALF2 AL09 97.7
LW2010 E_09 70.9
LWA2010 LWA_09 76.642
LWAE2012 E_09 60.467
LWF2_2022 E_09 84.7
NAF2 NA09 78.4

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain