Typing_Method |
Tm-Shift
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Marker_Class |
SOL
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STS_primer_fwd |
TCCTAAATGTGTTCGAGTGATGGG
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STS_primer_rev |
ATTCAAGTATGTCGCCCACGATTT
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amplicon_seq |
NNNATGGGCGGGCTGAATGACAAGGAGATTAATCAGACCTATGTGAAGGTAGTAAAAATCAGGACCTTAAAATTACATTTGTGCTGTCAAAAAGCTTTCTAAGTTCTATTTATTGTTATAGTTGAATAATTAAGATATTTTGCTTGGATTTAGAACTTACTGAAACGTCACTGTATCCATTTCCTCTCATATACGTTTTCCTTTATGTATGATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAACCTTTTGCTTGCAGGTGCTAAGTCAAATGCCATATTTCAGGTTATCCGGTGGCCGCAACCACATATTTGTCTTCCCAAGGTATAAGTAGTCATACGGTGATCCTTAAACTCATGAATAGGAATCCAATTATGAGATTCTTGCTTCACAGATTATAGATGACCCAATGATGTATGGAGGTTTTAAAAGCTGGTATATGAAAACAACAGGATAGCTAAGTTCTGCATGGCTTGGATGTAGATATAAAGCCACACCCTCAAAGTTGCTATCCGATAAAAATATCGCCTAATTGTAGTTGTGCTGCATTTGTCAAAACTGCCATTTAATAAGACAGGAGTAACCACGTTATGAACTGGGATGTAGATGTAAAGCCAGAACTTCAACGTTGCTGTCAGATAAAATATTGATCATCCATTTTTACCTGTGCTAAATGCTGTTGCAAATAGACATGCTGCTAAATTTCTTTTAGTAGCATTTTCAATTGAAAGAATTAATACTTTTTCTTATGTGTGTTACTTTTGCTGAACTGNAGTGGTGCTGGAGCTCATTTATTTNNNN
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SNP_position |
482
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allele_1 |
A
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allele_2 |
C
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ASP_primer_S |
GCGGGCGGATAGCAACTTTGAGGGTGTGGCT
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ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCGGATAGCAACTTTGAGGGTGTGTCG
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Common_primer |
AGCTAAGTTCTGCATGGCTTGGATG
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enzyme |
Native Taq
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dye |
SYBR Green I
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