Typing_Method |
Tm-Shift
|
Marker_Class |
SOL
|
STS_primer_fwd |
TGGCTTTTCGTCTAGGGTTTTGAG
|
STS_primer_rev |
AAAGTCGGAACCACCTTTATGCCT
|
amplicon_seq |
NAGGTGAGTGTAGTAGCTCAGATGCTACTGTTACTACTGCGACTGTGACGGTGGGAGAGGTTACGGAAGTTTGTAAGGATACGTTCTGGCCGATTGTTGAAGCTGCCGGTGAGAAAACTGTCGTTGTTGATATGTACACACAGTGGTAAAGTTACATATACTTCCTATTTTCCTTTTAGATTTGATGAATTTAGTGCTTAATTATGATTGTTAATACTAAGAATTAGTGTTGATTTTGTTTTTCTCTCTTACTCCAAGGATTTTTTAACTCAATATTAGTGTAATCATATAGGATGAGGAGGAGGATTGAGGTAATTTGATAATAGAGGTAATTATAACCATTTAACTATGATTAGTAGCATATAAGGGTGCGGCGTACTGGTCAAATGAAGCTAGAATGAACGACCTTGGTTGAACAAGGTTCAAAATATAGTGAAGATAAAAGGTGTATTCCCCTCCGTATCCATTTGATTGTCCTGTTCTGAGTTGGTACGGAGTTAGAAAAAGTATATAAGAATTTTGAGAATCTAAAATCAAAGATACCTAGAATGTACCAAAATACGATTTAATCTTACATGTCATGGGAAAACCTAAAATTAAAGAGTTGTCGCAAAAGGAAAGAGATGTTCTTTTCTAAACATACTAAAGAGGAAAGTAGGGCAAATAAATTAAAATGGAAGGAGTAGTTGATTTATTAATATGACTATCTGAGACACGTATTGGTTCTAGGATGCTGAAACTCGATAGAATATTTGAGGTCTGAGTAAATTGAGCTGCACACTACCTCTATCAAGGAAAGAGGGAAANAAACTATGATAAATTCTCTGAATACTGCAAGGAGTTCTTTTCGTTTTCCTGAGAACAATAGAATAGATTATGAATCCATGATTGAAAGAGAATGGATTAAGAAGATTCATATAGCTAACTCTAATTCATTTGGGAGTGGCATGTGCTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAGATGAACTCTTTTATTGGACAACTTGTAACAGAAAGTATCTTCAAAAATTTATGGTTAGCTTGGATTAGCCTCTCATCAATCATTCCCTCCTAATTGAAGTGATTATTGAGATTGATAGATAGTTGAGAATATTTATGCCTGCTGGTTTCTTGGCTTAAGGAATTTCAGTTGACTCTGCTTTCTCTTGACCTTATGGAATGTATGTAGTAAAATCTTATTTGGCTGTAACAGAAAGAATGTTAACTGGTAGTTGACAGTTCTATAAGCTTCTGCTGTCGCCAAAATTGTTTTGTAGATGGCGTTGATTCTACCTAGGTGGGTATTGGTATATTTATTCAGAACTGAAATTACTATCATTCATAGCTCTACACCTCACAAATGAAAGCCTCACGGGCTTCACTTCCCATGTGCCAACATATTACAGTGTGACGAAGGAAATACAAGGCAGAGGAACACCAAATTAGTGCAACGGACTTTCAGTATTGATCTTCATGNAATGATATTCATGTATTCATCTTTAAGAAAGCAGAATATAAAATATTGCATGCACAACTGTTGCAGACTAATGAATGATCAATTGATTGGCAGATGTGTTTTTTATGCTTTCAAGTGTAGGATTTGAAGAATGAATCTATGTATAAGGGGGTTATTCATGCCCTCTTGTCATTGCCATGCATTGTCGCCTGTCTGATATATGATTACTCGATTGAATGTTTCTTTGAATTTTGAACTAGTTGTTTTCTGGACCTTACTTTTATCGTCAGTAATGGAAGTGTCTTCTCCCTTTGTCTTGTAATTTCTGATTCCAATCCACCTGCAGGTGTGGTCCTTGTAAAGTGATCGCTCCAAAGTTTCAAGAGCTATCGAAGAAATATAACGATGTGGTCTTTCTGAAACTGGACTGTAACCAGGACAACAAGGTATGTATTCTTTAAATCACCTCCCCTTCTAACGAAACAATACAACACACACTAGAATTGATCAATGTGATAATTTGGCAGCCN
|
SNP_position |
738
|
allele_1 |
A
|
allele_2 |
T
|
ASP_primer_S |
GCGGGCGACACGTATTGGTTCTAGGATGCTGAT
|
ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCGACACGTATTGGTTCTAGGATGCTGAA
|
Common_primer |
TGTGCAGCTCAATTTACTCAGACCTCA
|
enzyme |
Stoffel frag.
|
dye |
EvaGreen
|